问题标签 [sequencing]

I am trying to limit the number of attempts that a user can take to pass a quiz, regardless of content launch number.

I found a precondition rule, but i think that is only for the current launch attempt.

Has anyone successfully done this? The sco is in captivate.

我想编辑一个排序的 Fastq 文件，并删除仅在某些字符位置重复的行。理想情况下，我会遍历输入文件中的每一行并输出一个文件，该文件只有一个任何唯一字符集的实例。

所以如下图。我只对查看每行的前 6 个字符、后 6 个字符和中间字符的一部分感兴趣，并且只保留三个序列的每个唯一组合的一个实例。

如上例所示，如果我们取一个仅包含 4 行的文件，并且我正在查看字符 1-6、19-28、37-42，则第 2 行和第 3 行将被删除，或者不会输出到输出文件因为它们在每个所需位置都有相同的字符，但由于第 4 行不同，因此不会被删除。

我从下面的代码开始，我的想法是将每个位置设置为一个变量（但我不知道必须得到中间序列），然后在我们遍历输入文件时与每一行进行比较。

如果有帮助，这些文件也是 5-10GB，所以不是很小。我将不胜感激任何帮助。谢谢。

我有这个脚本

我使用这个脚本来运行一项工作：

由于我有多个文件并想批量运行（添加Batchparallel.pl）

基本上为一项工作运行并行命令。问题是-annStats只给我一个输出文件。如何指定文件名，以便它获取输入名称并将其用于该特定标志 ( -annStats) 的输出。

我对此很陌生，所以希望我的问题对每个人都有意义。

谢谢你的帮助！

我的任务是通过用内部数字的破折号替换 3 或更多的内部序列来缩短数字序列（如 3,5,6,7,8,10 将是 3,5-8,10）

我的理解是来自 Illumina HiSeq/MiSeq 平台的配对末端读取看起来像这样：

R2 中的读数与 R1 中的读数相反。然而，对于我的测序数据，情况似乎并非如此。如果它有帮助，我可以从下面的 MiSeq 运行中获得一对读取。

我正在使用 libgdx 并且我有几个具有不同方法的游戏对象我希望我的计时器中的方法一个接一个地发生但是在 libgdx 它们一次发生我不知道如何修复它

它的工作原理是每次调用一个数字时都会运行一组方法，但它们会同时运行，我希望它们一个接一个地运行

所以我正在尝试编写一个基本的音乐音序器之类的东西。需要非常精确的时间的东西。这适用于 iOS 9。

我现在正在使用 libpd（纯数据），只是发送具有各种延迟的事件以达到我想要的效果。这听起来不错，但不是很好。

在 iOS 上这种精确的音乐计时有“最佳实践”吗？我可以从 libpd 中取出笔记调度并获得更好的效果吗？

谢谢！

我的要求是：

1. 我有一个脚本，它负责在给定的子网中查找免费 IP（旧写的，很好用）。

2. 我正在自动创建 IP 池，但必须按顺序排列，因此可以作为上述脚本的一种包装器

   • 在python里面执行脚本知道免费IP
   • 检查它是否可以依次给我 3 个 IP，然后是另一个 40 或
   • 检查它是否可以依次给我3个IP，然后是另一个80个序列
   • 我有另一个脚本，它可以根据命名标准输入为找到的 IP 注册 DNS 条目。

python脚本可能会像下面那样做 -

不管.py -range3,40 -register name（基于基本名称，它将从中创建标准名称。命名如下：

希望得到一些帮助..我只是python的初学者..还没有线索..如果需要，我可以提供更多细节。

我需要替换'|' 进入选项卡，以便我可以分析我的人类注释基因组数据（200+mb）。我是一名研究助理，学习如何以最简单/最简单的方式分析/操作测序数据，以便我可以在更多数据上复制它。

这是我的数据的样子。一个文件中有大约 400,000 行此类数据。

我尝试使用此代码替换“|” 进入 '\t' 几行。

我得到的只是这个：

我的问题是关于可视化样本队列的突变，就像 coMut 图 ( https://www.broadinstitute.org/blog/visualizing-cancer-genome )。有人知道是否有特定的网站可以制作这些类型的情节吗？

谢谢