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我有这个脚本

annotatepeaks.pl file mm9 -annStats filename > output

我使用这个脚本来运行一项工作:

annotatepeaks.pl file.xls mm9 -annStats file_stat.xls > file_ann.xls

由于我有多个文件并想批量运行(添加Batchparallel.pl

Batchparallel.pl annotatepeaks.pl ann.xls mm9 -annStats filename -f *.xls

基本上为一项工作运行并行命令。问题是-annStats只给我一个输出文件。如何指定文件名,以便它获取输入名称并将其用于该特定标志 ( -annStats) 的输出。

我对此很陌生,所以希望我的问题对每个人都有意义。

谢谢你的帮助!

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