我有这个脚本
annotatepeaks.pl file mm9 -annStats filename > output
我使用这个脚本来运行一项工作:
annotatepeaks.pl file.xls mm9 -annStats file_stat.xls > file_ann.xls
由于我有多个文件并想批量运行(添加Batchparallel.pl
)
Batchparallel.pl annotatepeaks.pl ann.xls mm9 -annStats filename -f *.xls
基本上为一项工作运行并行命令。问题是-annStats
只给我一个输出文件。如何指定文件名,以便它获取输入名称并将其用于该特定标志 ( -annStats
) 的输出。
我对此很陌生,所以希望我的问题对每个人都有意义。
谢谢你的帮助!