问题标签 [rscript]

我有一个名为的脚本，其中foo.R包含另一个脚本other.R，它位于同一目录中：

但我想R找到other.R不管当前工作目录是什么。

也就是说，foo.R需要知道自己的路径。我怎样才能做到这一点？

我试试这个命令：

但我有这个错误：解析错误（文本 = args [[i]]）：“path_in = /”中的意外'/'

Rscript 的一部分：

如何将 path_in 定义为 argument(args) ？

谢谢你。

我的脚本使用对 mysql 的访问来获取启动 Rscript 的命令参数。其用法如下： Rscript $RFILE $ARGUMENTS（RFILE对应Rscript的路径，ARGUMENTS对应使用的路径文件和agr）。

我尝试了不同的方式，但我仍然有错误，这里是我的 bash 脚本的副本：

我验证了我的命令行（通过 echo），如果我复制粘贴到我的 shell，我可以运行我的 R 脚本。但是从我的 bash 中，我无法执行我的脚本（但命令行很好）。

通过使用：Rscript $RFILE $ARGUMENTSRscript $RFILE $ARGUMENTS和 $RUN，我有这个错误：

通过使用：eval“$RUN”，我有这个错误：

如果我在我的 shell 脚本中尝试这个，一切正常：

有人有想法吗？

谢谢

我在“functions.txt”文件中有一个简单的函数 f1（参数）。

我写了一个批处理文件 test.bat 如下

在 Windows 命令提示符中，我使用

我想做的是使用 incredibuild 在不同的机器上计算函数 f1()。

我观察到的是在本地运行的函数在文件 Out.%%G.txt 中返回一个值，但远程运行的函数失败并出现以下错误

远程机器没有安装 R 程序。

我在做正确的事吗？即使 R 程序未安装在远程计算机中，incredibuild 和 Rscipt 是否应该能够工作？

提供详细的答案将是非常友好的。

Rscript 非常好用。但我想在运行时指定输出路径，例如：my.Rscript input > output. message()非常适合记录到 STDERR，但 Rscript 似乎系统地输出WARNING: ignoring environment value of R_HOME到 STDOUT，即使指定--vanillaor --no-environ。

任何解决方法？

（这是 R 脚本前端版本 2.13.0 (2011-04-13)）

我正在使用以下代码绘制图形并将其打印到 PDF：

当我在 TextMate 中执行脚本时，这工作正常。

但是当我通过 RScript 从命令行调用它时，我收到以下错误：

我在我的 RScrpipt 文件中使用以下标头：

任何想法可能是什么问题？

这是我的命令行会话信息：

在 textmate sessionInfo() 中给了我更多附加的基础包：

我不知道为什么会这样。

我想按行然后按列进行层次聚类。我想出了一个完整的解决方案：

变量mtxf.in和mtxf.out分别表示输入矩阵和聚类输出矩阵文件。变量clusterMethod是hclust方法之一，例如single,average等。

作为示例输入，这是一个数据矩阵：

运行这个脚本，我失去了左上角的元素mtxf.in。这是此脚本的输出：

我的问题：除了寻找一种方法来保留输入矩阵文件的原始结构之外，我也不知道这会消耗多少内存，或者是否有更快、更干净、更像“R”的方式来做这件事.

在 R 中按行和列进行聚类真的这么难吗？有建设性的方法来改进这个脚本吗？谢谢你的建议。

我真的很喜欢 littler 非常适合使用 R 编写脚本。但我不知道如何使用 gnuplot 等外部图形设备（例如使用 Octave）。我能够生成所需的图表，但我必须使用 Sys.sleep 而我不想这样做，因为我想以交互方式关闭它，或者更好地在不关闭设备的情况下继续脚本。

到目前为止，这就是我的代码的样子：

我的问题是：你知道实现这一目标的方法吗？

任何提示、文档、链接或代码将不胜感激

我正在尝试在 Rscript 中加载一个库，但这给了我一个奇怪的错误。我正在运行 2.12.1 版本的 Rscript 二进制文件，但它抱怨我的包是在 2.12.1 版本下构建的。知道这里发生了什么吗？

我可以从哪里安装 Rscript？我需要使用 exec 从 php 文件运行 R 脚本。但是我需要先安装 Rscript。