问题标签 [rpy2]

我想在 Python 中使用 R，由模块 Rpy2 提供。我注意到 R 具有非常方便[]的操作，您可以通过这些操作提取特定的列或行。如何通过 Python 脚本实现这样的功能？

我的想法是创建一个 R 向量并将那些想要的元素添加到该向量中，以便最终向量与 R 中的相同。我创建了 a seq()，但它似乎有一个初始数字 1，所以最终结果总是从数字 1 开始，这不是我想要的。那么，有没有更好的方法来做到这一点？

我得到了以下R代码，我需要将它转换为python并在python环境中运行它，基本上我已经用rpy2模块完成了这个，但是python做同样的事情看起来有点乏味，所以有人能找到更好的方法用 rpy2 模块将以下 R 代码重写为等效的 python 脚本？

我正在使用 rpy2-2.0.7（我需要它才能与 Windows 7 一起使用，并且为较新的 rpy2 版本编译二进制文件是一团糟）将两列数据帧推入 r，在 ggplot2 中创建几层，然后输出将图像转换为 <.png>。

我已经浪费了无数个小时来摆弄语法；我确实设法输出了我需要的文件，但是（愚蠢地）没有注意到并继续摆弄我的代码......

我真诚地感谢任何帮助；下面是一个（简单的）演示示例。非常感谢您的帮助！！！〜埃里克黄油

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*输出只是一个空白图像（181 b）。

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这是我在 ggplot2 中摆弄时 R 本身抛出的几个常见错误：

*RRuntimeError：错误：绘图中没有图层

*RRuntimeError: 错误：设置美学时，它们可能只取一个值。问题：填充，x

我有以下两行代码，它们在 R 和 Python 中都运行良好（通过 Rpy）：

但是，如果我想添加 的参数include.lowest=TRUE，它会在 R 中按预期运行：

但它在 Rpy 中不起作用：

这给出了以下错误：

你知道是什么原因造成的，我应该怎么做才能让它发挥作用？谢谢！

这里的真正目标是在 Python 中找到分位数均值（或总和，或中位数等）。由于我不是 Python 的高级用户，但使用 R 有一段时间了，所以我选择的路线是通过 Rpy。但是，我遇到了返回的均值列表与分位数的顺序不对应的问题。特别是，我在 R 中有以下内容：

这一切都很好。但是，如果我将代码翻译成 Rpy，我得到了

请注意，最终列表的顺序是错误的（我们知道是因为在这种情况a下b两者都是有序的）。一般来说，我只是无法恢复 Rpy 中从最低分位数到最高分位数的正确顺序。有什么建议么？

另外（不是替代品，因为我想知道上述问题的答案），如果您能提出一种直接在 python 中执行分析的方法，那也很棒。（我没有安装 numpy 或 scipy。）谢谢！

编辑：澄清一下，a并且b是配对的，但不一定是有序的。例如，a是眼睛b的大小，是鼻子的大小。我试图找出在 的各个分位数中，通讯员sa的含义是什么。b谢谢。

到目前为止，我正在尝试在我的 Mac OSX 上安装 rpy2 for python，但没有成功。我尝试过 Macports 和 DarwinPorts 但没有运气

import rpy2

在 python shell 环境中。我对 Mac 中的编程知之甚少，而且我是在基于 Windoze 的系统上安装模块的专家，但对于我的生活，我无法在家中的 Mac 上做一个简单的移植。

如果有人这么好心的话，我所追求的是为 Mac OSX Snow Leopard 成功安装 rpy2 的“简化”说明。希望这里有人成功地做到了这一点，并且可以概述他们所采取的过程吗？至少这是我所希望的。

提前谢谢了！

使用 psycopg2，我得到以下形式的查询结果：

[[（15002325，24，24，24，20，1393，-67333094L，38，4，493.48763257822799，493.633348372593703），（15002339，76，76，20 1394, -67333094L, 38, 4, 493.493464900383, 493.63348372593703), (15002483, 76, 20, 1394, -67333094L, 91, 3, 499.9590402442434, 945]42742434, 499)

我正在尝试使用 RPY2 将此嵌套元组/列表转换为 R 数据框：具有九列名称和四行数据（此嵌套列表中的元素数））

但我不明白如何，我正在尝试使用 taggedList （进入 RPY2 容器库）但没有成功.. 标记列表似乎只需要一个列表一个列表。

谢谢帮助！

我进行了广泛搜索，阅读了 stackoverflow 中的上一个问题，但似乎无法解决在我的 Mac 上使用 OS X 10.5.8 安装 rpy2 的问题。我安装了 Xcode 3.1.4 和 R 2.1.11。当我运行时：

我明白了：

任何帮助将不胜感激。

大家早上好，在 Windows XP 机器上安装 rpy 版本 2.1.7 期间我真的很挣扎。我将正确的路径放在环境变量中（C:\R\R-2.10.0\bin 称为 R_HOME）。安装过程似乎接受了该条目，并且没有给出消息“路径中没有 R 命令”，它开始安装。

但是，过了一会儿，它给了我以下错误：

文件“C:\python26\lib\site-packages\setuptools\package-index.py”，第 475 行，在 fetch_distribution return dist.clone(location=self.download(dist.location, tmpdir)) AttributeError: 'NoneType'对象没有属性“克隆”

有人可以向我解释这是什么意思吗？非常感谢，法比奥

如何识别所有库 Rpy2 R。

Rpy2 无法识别库、实用程序和工具。

（>>> from rpy2.robjects.packages import importr Traceback（最近一次调用最后一次）：文件“”，第 1 行，在 ImportError：没有名为包的模块）

因为我可以更新 Rpy2 以加载所有库而不会出现问题或 R 可以完成。

PS：我在 ubuntu 上使用 R 2.10 和 python 2.6