4

如何识别所有库 Rpy2 R。

Rpy2 无法识别库、实用程序和工具。

import rpy2.robjects as robjects

R = robjects.r  

>>> R['library']("utils")

RVector - Python:0x7f65fc85cfc8 / R:0x19bb980

>>> R['library']("tools")

RVector - Python:0x7f65fc85f5a8 / R:0x2419140

（>>> from rpy2.robjects.packages import importr Traceback（最近一次调用最后一次）：文件“”，第 1 行，在 ImportError：没有名为包的模块）

因为我可以更新 Rpy2 以加载所有库而不会出现问题或 R 可以完成。

PS：我在 ubuntu 上使用 R 2.10 和 python 2.6

4

2 回答 2

4

为了让 importr 命令正常工作，您可能需要升级您的 rpy2 版本——尝试检查您的版本：

print rpy2.__version__

我相信您需要 2.1.0 或更高版本。以下适用于我在 2.1.7 下但不适用于 2.0.3：

In [1]: import rpy2.robjects as robjects

In [2]: R = robjects.r  

In [3]: from rpy2.robjects.packages import importr

In [4]: importr("utils")
Out[4]: <rpy2.robjects.packages.SignatureTranslatedPackage object at 0x1e96310>

我不确定您要做什么，因为这些库应该可以在没有任何额外导入的情况下工作，正如 Gavin 所提到的。

于 2010-11-11T18:51:38.240 回答
1

除非我弄错了——我不使用 Rpy2——这些包（顺便说一下，它们不是库）会在 R 启动时自动加载；您无需执行任何其他操作即可使用它们。这些包中的所有用户可见功能在 R 启动期间都可用。

此外，您无法更新这些包 - 它们是 R。您只有在更新 R 本身时才能获得更新。在这一点上，它们与推荐的软件包（如 nlme、mgcv、MASS 等）不同，这些软件包也在 CRAN 上，并且在 R 版本更新之间更频繁地更新。

于 2010-11-11T18:50:56.103 回答