问题标签 [rda]

我对 R 比较陌生，我正在努力了解如何在 R 中进行排序技术，这样我就不需要使用其他软件。我正在尝试用环境因素代替物种的 PCA。由于我的场地在质量上有所不同（在土地利用方面），我希望能够在最终的地块中显示这种差异（使用不同的颜色）。因此，我使用了带有 vegan 包的 la Gavin Simpson 方法。到目前为止，一切都很好。这也是我用于此的代码：

当我尝试在排序图中为我的环境变量放置箭头时，问题就出现了。如果我使用 biplot 和 ordiplot 等其他功能。我将无法为我的两种类型的网站保留不同的颜色，因此我不想使用这些。如果我在这里使用命令：

我得到了很好的箭头，只有与我之前在代码中给出的环境变量（第 5 行）没有对齐（在某些情况下是完全相反的）。我试图更改缩放比例，但它们无法对齐。

有谁知道如何处理这个问题？

任何提示都会很有用。

这是我的代码的一部分。

它读取具有纬度、经度、时间（每月）和值的数据，并将数据转换为以下格式（英亩）。问题是在输出中，第 1 个月和第 10 个月之间没有区别。它们都存储在例如 1983.10 的第 1 个月和 1980 年的第 10 个月。我是否可以将它们存储为不同的格式，例如第 1 个月的 1980.1 和 1980.10和 10。

我正在尝试在 R 中的数据上应用 RDA，经过一些研究后，我发现 R 中有一个名为“rda”的包，它似乎可以为我完成这项工作。但是，我查看了该包中 RDA 函数的描述，现在我有点困惑：

R中给出的用法：

我不确定在这种情况下“alpha”和“delta”代表什么。我被告知在 RDA 中有两个参数“lambda”和“sigma”，其中 lambda 是一个复杂性参数，它决定了线性和二次判别分析之间的平衡，而 sigma 是另一个进一步规范协方差矩阵的参数。它们都在 0 和 1 之间。

但是对于 R 中的这个“rda”函数，delta 的默认值在 0 到 3 之间，这让我很困惑。

谁能帮我解释一下？谢谢！

和文件之间.RData的主要区别是什么？.Rda.Rds

• 压缩等方面有区别吗？
• 什么时候应该使用每种类型？
• 如何将一种类型转换为另一种类型？

只是出于好奇，我想知道与使用 CSV 相比，将数据集保存为 RDA 文件是否有任何优势（例如，空间效率等）？

我想在 R 中使用 vegan 执行 rda。

我的代码如下所示：

我收到错误消息：

当我检查我的数据时，我得到：

我的数据集中没有 NA 或空白。但似乎物种数据集是问题所在。我用该物种编译了一个新的数据集，但我又遇到了同样的问题。有任何想法吗？

我是使用 R 进行多变量分析的新手。我正在尝试绘制一个 RDA 图来描述我的物种丰度与环境数据之间的关系。我有 6 个环境变量。但是当我获得绘图时，我只能看到两个向量单独代表两个变量。我使用的命令如下。

有人请帮我解决这个问题。我希望在我的 RDA 图中看到所有 6 个环境参数。

我正在使用 R 包“vegan”进行冗余分析。我想获得用于分析的 p 值（或 t 值），以评估我的预测变量的重要性。我可以使用 anova 函数生成 p 值，分别为每个 RDA 轴（轴）和每个预测变量（术语）：

但是，我真正需要的是每个 RDA 轴的每个预测变量的 p 值。所以像这样的表：

有谁知道如何以及是否有可能获得？任何帮助将非常感激！

我在R中有一个函数，我需要有条件地加载一个 .rda 文件。例如，我希望函数的用户能够指定他们要加载的文件，然后R将加载相应的数据文件。

该函数有两个参数，状态（即“NY”）和我希望它加载的 .rda 文件（即“data_0203.rda”。

因为我需要读取的池中没有那么多 .rda 文件，所以我想一种方法就是执行 if 语句，如下所示。

我知道它不是优雅或高效或任何东西，即使它有效，我仍然希望有一个更好的方法来做到这一点。有任何想法吗？

我使用了以下代码：

我可以通过运行来检索错误：

但是这个错误是什么意思？我怎样才能得到唯一的0.06151142？