问题标签 [rda]
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r - 我是否正确使用带有有序变量的 dbRDA?输出中的 *.L 和 *.Q 箭头是什么?
当我将 dbRDA 应用于距离矩阵(在本例中为 Bray-Curtis 距离)时,如下所示:
是否可以在变量中包含一列有序因子site_vars
,它是一个数据框,其中包含在采样点测量的值,例如平均温度,但它还包括一列“土壤”,其中对不同的土壤类型进行了排序?或者是否有必要在公式的单独Condition
参数中添加所有序数和名义比例变量?
这里有一个小例子:
版本 1 似乎忽略了我的土壤变量排名的事实。版本 2 生成的输出我觉得解释起来有点棘手,因为除了组质心之外,它还显示箭头。我希望土壤有 1 个箭头,就好像它是一个带有数字 1、2 和 3 而不是三个级别的数字变量。但是,它显示了两个箭头,分别标记为 Soil.L 和 Soil.Q。为什么一个变量有两个箭头?*.L 和 *.Q 代表什么?不幸的是,我没有找到任何解释。
r - vegan 包中的 db-RDA 不评估所有解释变量
这些天来,我正在尝试对 vegan 包进行 db-RDA 分析。我有 24 个解释变量和 46 个样本。问题是,在开发 db-RDA 时,我只能得到前 7 个环境变量的结果,而不管它们的排列顺序如何。可能是什么原因?我用代码解释问题
#1 我收取包裹素食主义者的费用
#2 我上传了 OTU 数据帧,并以正确的格式进行了调整
#3 我上传了环境条件并以正确的格式进行了调整(解释变量)
#4 执行dbrda分析和绘图,只出现前7个解释变量
#5 我用方差分析进行了显着性。尽管分析评估了所有环境因素,但仅显示了前七个解释变量的结果。
我也做了一个 R 笔记本,但我不知道如何在这里提交,但可以更清楚。
r - ggvegan 用于最新版本的 R
是否有替代 ggvegan 用于在 R 版本 4.0.0 中创建 pca 图。我已将 rda 函数与以下脚本一起使用:
但是,似乎 ggvegan 不适用于最新版本的 R。有替代方案吗?
ui-automation - UiPath 将过滤器添加到 Excel 中的所有列
我有一个小问题。我有一个 excel 文件,我只想在我的所有列中添加一个过滤器。首先,我不想将某个条件放入过滤器中,而只是选择使用带有小箭头的工具栏进行过滤。
有人可以帮帮我吗?
r - 如何消除错误:有幻数“PK-”不推荐使用 2 之前的保存版本?
R 4.0.3 GUI 1.73 Catalina build (7892) for mac
r - 具有小数据集的 RDA 未执行完整分析
我正在尝试使用简单的数据集执行 RDA 分析,但即使数据已标准化,我仍然会遇到相同的错误。谁能帮我理解这个模型有什么问题?
当我尝试运行情节线时出现的错误:
我认为没有执行分析,因为 rda.lake 的摘要仅返回 RDA1 结果。
数据被识别为数字。
anova.cca 函数仅返回零作为残差并且不显示 p 值,这让我相信数据或模型存在问题。
这些是实际使用的表,都有 6 行。
生物湖
钱安 | 瘸子 | 迪诺 | 克里斯 | 桑特 | 迪亚特 | 欧格尔 | 齐涅 | 克洛罗 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0.0590634 | 0.21536114 | 1.286085 | 0.01117714 | 0.00000000 | 0.17741471 | 0.1438246 | 0.04127306 | 0.23323527 |
0.0590634 | 0.21536114 | 1.286085 | 0.01117714 | 0.00000000 | 0.17741471 | 0.1438246 | 0.04127306 | 0.23323527 |
0.0590634 | 0.21536114 | 1.286085 | 0.01117714 | 0.00000000 | 0.17741471 | 0.1438246 | 0.04127306 | 0.23323527 |
2.8144055 | 0.09724492 | 1.128178 | 0.02302370 | 0.03858338 | 0.01373549 | 0.9708160 | 0.90119103 | 0.08646308 |
2.8144055 | 0.09724492 | 1.128178 | 0.02302370 | 0.03858338 | 0.01373549 | 0.9708160 | 0.90119103 | 0.08646308 |
2.8144055 | 0.09724492 | 1.128178 | 0.02302370 | 0.03858338 | 0.01373549 | 0.9708160 | 0.90119103 | 0.08646308 |
非生物湖
教授 | Temp_H2O | 外径 | 条件 | N_Tot | NO2 | NO3 | 建议零售价 | 西奥 | Zmax | 宙 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0.0 | 20.7 | 8.15 | 98 | 230.72 | 9.28 | 294.32 | 15.91 | 3.72 | 4.8 | 4.5 |
2.0 | 20.4 | 7.16 | 105 | 228.61 | 8.56 | 352.34 | 8.92 | 4.49 | 4.8 | 4.5 |
4.8 | 20.0 | 5.20 | 107 | 190.82 | 6.82 | 293.81 | 11.15 | 7.82 | 4.8 | 4.5 |
0.0 | 30.4 | 9.24 | 100 | 610.28 | 3.46 | 42.82 | 36.15 | 13.17 | 5.0 | 2.0 |
2.0 | 28.3 | 6.62 | 110 | 612.11 | 3.63 | 48.19 | 32.19 | 11.94 | 5.0 | 2.0 |
5.0 | 25.8 | 2.13 | 115 | 560.31 | 4.69 | 60.98 | 35.30 | 11.03 | 5.0 | 2.0 |
- 编辑:根据需要,“dput”的输出
块引用
- 编辑 2:根据需要,rda.lake 的输出:
块引用
- 编辑 3:由 rda 分析产生的 NA。
块引用
compiler-construction - 达到定义分析 - 我的解决方案是否正确
我被要求为以下代码编写到达定义,我想知道我的解决方案是否正确?我什至走在正确的轨道上吗?我真的很感激任何帮助或提示。谢谢你。
代码:
步骤#1:查找块和标记
步骤 #2:为每个块找到 GEN 和 KILL 集
堵塞 | GEN | 杀 |
---|---|---|
1 | a1 | a3 |
2 | ∅</td> | ∅</td> |
3 | b3、c3、a3 | a1 |
4 | ∅</td> | ∅</td> |
第 4 步:查看算法以找到 IN 和 OUT 集
步骤 #5 导出 IN 和 OUT 集
堵塞 | GEN | 杀 | 在 | 出去 |
---|---|---|---|---|
入口 | ∅</td> | |||
1 | a1 | a3 | ∅</td> | a1 |
2 | ∅</td> | ∅</td> | a1 | a1 |
3 | b3、c3、a3 | a1 | a1 | b3、c3、a3 |
4 | ∅</td> | ∅</td> | b3、c3、a3、a1 | b3、c3、a3、a1 |
出口 | b3、c3、a3、a1 | b3、c3、a3、a1 |
vegan - 然后如何使用函数 ordiR2step 获取所有变量的 p 值?
在 R 中:我正在做部分 RDA,使用前向选择程序来识别对鞘翅目群落最重要的解释变量。
但是,当使用函数 ordiR2step 时,如何不仅获得调整后的 R2 值,还获得所有测试变量的 p 值?
为什么函数 ordiR2step 比 ordistep 快得多?