问题标签 [pydicom]

我正在尝试做一个项目。不幸的是，我可以读取 dicom 文件，但是当我尝试访问 pixel_array 属性并绘制它时，它会抛出错误。

错误是：

任何建议都会很好。先感谢您。

解决方案：

我正在尝试使用 dicom 图像并在 Python 环境中使用 OpenCV 对其进行操作。到目前为止，我已经使用 pydicom 库读取 dicom(.dcm) 图像数据并使用像素数组属性使用 OpenCV imshow 方法显示图片。但输出只是一个空白窗口。这是我目前正在使用的代码片段。

如果我打印出此处使用的数组，则输出与使用普通 numpy 数组得到的不同。我也尝试过使用 matplotlib imshow 方法，它能够显示带有一些颜色失真的图像。有没有办法将数组转换为 OpenCV 的清晰格式？

我正在尝试阅读一系列默认显示轴向视图的 .dcm 文件。下面是代码：

正如您从代码中看到的那样，我无法找出特定 dcm 文件的相关 idx 和 idy。所以我的问题是，考虑到轴向切割，如何获得矢状和冠状切割并绘制它们？

提前致谢。

编辑：正如@ColonelFazackerley 完美回答的那样。我在下面添加只是为了展示我是如何使用它的。

我无法将从 DICOM 文件中提取的详细信息写入 CSV 文件。这是我使用的代码 -

即将出现的错误如下 -

回溯（最近一次调用最后）：文件“C:\Users\dmgop\AppData\Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\pydicom-1.2.0rc1-py3.6.egg\pydicom\dataelem.py "，
第 344 行，在getitem
中 返回 self.value[key] TypeError: 'PersonName3' 对象不支持
索引

在处理上述异常的过程中，又出现了一个异常：

Traceback（最近一次调用最后一次）：文件“C:\Users\dmgop\Personal\TE
Project - Pneumonia\detail_extraction.py”，第 14 行，在
writer.writerows(lung) 文件
“C:\Users\dmgop\AppData\ Local\Programs\Python\Python36\lib\site-packages\pydicom-1.2.0rc1-py3.6.egg\pydicom\dataelem.py"，
第 346 行，在getitem
raise TypeError("DataElement value is unscriptable" TypeError: DataElement值无法编写脚本（不是序列）

我有 4 个特定患者的不同 dicom 图像。我想从它们重新创建一个 dicom 图像，以便最终图像显示患者的详细信息，并在其上显示 4 个图像。

输出 DCIM

我对 CT 图像世界完全陌生。所以提前谢谢你我有两个同一个病人的dicom系列。对于这两个系列，第一个切片信息是

. 我想在系列 1 上重叠系列 2。

但是要重叠，根据我的理解，它们必须共享相同的坐标。像素间距和文件数量也存在差异。所以我的问题是：

• 如何重叠两个系列？

• 如何匹配指数。因为两个系列都有不同数量的切片。例如，在系列 1 中，切片索引为 220 或 Z 值为 -976，如何获取系列 1 的特定切片的 Z 值或系列 2 中的索引？

我正在使用 pydicom python 包。任何示例代码或处理此问题的想法都会很棒:)

编辑：我正在使用的 sitk.resample 代码

我试图用 python3 和 pydicom 库读取 dicom 文件。对于某些 dicom 数据，当我尝试打印 pydicom.dcmread 的结果时，我无法正确获取数据并收到错误消息。

但是，我尝试使用 python2 并且效果很好。我检查了元信息并将其与其他可以处理的 dicom 文件进行了比较，我没有发现它们之间有任何区别。

有人遇到过同样的问题吗？

我正在使用pydicom，我的代码非常简单：

但这会产生运行时错误：

我不知道该怎么办。任何帮助都会..有帮助。

我正在尝试创建一个简单的 DICOM 查看器，在其中我使用 matplotlib 绘制图像，并且我想在 tkinter 中显示相同的图（这是一个 DICOM 图像），但是当我运行代码时出现此错误。请帮忙。当我尝试绘制 a 时会发生错误，但我相信它与我声明 x、y 和 p 的值的方式有关

我正在使用 dcm4chee 作为 PACS 服务器，我正在尝试根据患者姓名检索一项研究。

相关代码为：

我得到了一个成功的信号：

C-FIND查询状态：0x0000

但是当我想访问像素数据时，我输入了 status.pixel_array 而不是 Numpy 数组，它包含以下错误：

有谁知道为什么我得到这个错误而不是图像？