问题标签 [pydicom]

使用 pydicom 尝试读取测试文件，如下所示：

我收到一个错误

请帮忙。

我正在尝试使用带有 pydicom 的假自定义 AN 匿名化登录号：

我想将自定义值而不是“0000000”传递给回调函数。我想我可以使用全局变量，但我想避免这种情况以减少不必要的错误。有没有不使用全局变量的不同方法？

编辑：我以为walk是一个特殊的python函数，但它只是ds的一个方法，这里是代码。您可以在此处更改回调代码以包含可选参数。回调（自我，data_element，replace_value=None）

I am new to Image Processing and want to know how can I pre-process dicom images using python. I am following the below tutorial:dicom in python I do not have the SliceThickness attribute in my data. How can I calculate it?

This is a sample dataset which I have:

Here is my code:

This is the error I got:

我正在运行本地 python 烧瓶服务来打开/分析 windows env python -V => 3.6.5 pydicom => 1.1.0 ...

但是当我遇到这条线 ds = pydicom.dcmread(dicom)

“权限错误”发生 了权限被拒绝异常

被抓住了

我在 microsoft doc 的 windows runas wiki 中尝试了 [runas cmd]

以管理员用户身份运行图片

机器名和用户规则

但是当我再次调用python服务/脚本时，发生了同样的异常

授权再次被拒绝

json 意味着我需要访问 dicom_list 中的文件路径 C:\Users\za-chenchen\Desktop\MRA_DICOM

我需要将文件分析成jped格式 C:\Users\za-chenchen\Desktop\MRA_DICOM\...\...

有人对此有什么建议吗？

为了：

我的问题是我想要“图像位置（患者）”结构作为一个数组或它的一个元素（如'-207.500000'）。当我运行代码时，会出现这个错误：给的 img2 = dcm_image.ImagePosition行AttributeError: 'FileDataset' object has no attribute 'ImagePosition'

我使用 pydicom 库使用来自 CT 和 MRI 机器的数据集生成 .dcm 文件，但是在该数据集中，标签 (0002,0010) 缺失。因为我没有那个标签，所以我无法检测传输语法是否是隐式 VR 小端、显式 VR 小端、jpeg 无损等。我需要传输语法来保存带有如下标志的数据集

如果我不使用上述标志，则生成的 dcm 文件将无效，因为没有传输语法。由于我不知道传输语法，因此我在运行程序时在命令行参数中发送传输语法，并相应地设置上述标志，并保存数据集。我知道这是错误的方法，但我只是将其用作临时解决方案。由于缺少标签（0002、0010），是否有更好的方法来检测传输语法。下面是我使用来自 CT 机器的数据集保存 dcm 文件的代码。现在我将传输语法作为命令行参数发送

我想在下面的代码中使用“if”比较一些值，但它不起作用：

示例：上述变量中​​的值相等：

因此，当执行代码时，if无法应用if语句并且无法运行语句之后的下一行。而它们的值（-10.000000）相同。如何解决问题，以便该if语句发现它们相等？

从 Orthanc 的官网，我们可以发现 Orthanc 匿名文件的方式：

所以这一步将创建一个匿名的 dcm 文件。

我的问题：

假设我的硬盘上有一个dcm文件，我需要对其进行匿名化，基于Orthanc官网的工作流程，我需要做的是：

1. 将 dcm 文件上传到 Orthanc
2. 创建一个新的匿名 dcm 文件
3. 上传新的 dcm 文件并从 Orthanc 中删除旧的 dcm 文件

我的问题：

有没有办法在 Orthanc 中直接将 dcm 文件转换为匿名格式？

我正在使用从一些文章中获得的以下代码。

得到以下错误

AttributeError：“FileDataset”对象没有属性“SliceLocation”

在

文件：C:\ProgramData\Anaconda3\lib\site-packages\pydicom\dataset.py

线路：524，

函数名称：getattr，

消息：返回超级（数据集，自我）。获取属性（名称）

下面是python代码

我从链接下载了示例 dicom 文件

任何帮助都会很棒...如何读取 dicom 文件然后处理它们。