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在使用 RISmed-R 包自动从 Medline 检索数据（摘要/作者/附属机构等）时，我无法使用 Affiliation() 方法检索多个附属机构。即使有多个可用，也只能检索到第一作者的隶属关系。从https://www.nlm.nih.gov/bsd/mms/medlineelements.html#ad 看来，在 2014 年 12 月之后，从属关系字段中包含多个从属关系。类似地，Author() 方法检索一个列表，该列表包含多个数据框，用于说明所有作者数据。有谁知道 Affiliation() 方法是否可以做同样的事情？

例如：在检索从属关系时：https ://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28578058 从链接中注意到有 4 个不同的从属关系。执行下面的代码时，只返回第一个：

我希望能够以不指定句子的 xml 格式逐句处理。我的输入如下所示：

我希望我的输入看起来更像：

这样我就可以像这样提取这些整体：

我的测试代码是：

我是 r 和 RISmed 的新手，所以如果这是一个非常简单的问题，请接受我的歉意。

我一直在关注如何从 PubMed 获取大量参考数据的教程。当我使用：

它按预期返回标题和摘要的数据，但是当我添加返回作者、期刊、年份、国家和关键字的指令时，它仍然只返回标题和摘要。我错过了什么？我使用以下代码：

我正在尝试使用R 中的包以 txt 格式easyPubMed下载内容。PubMed我正在尝试运行以下示例：

但是，此时我收到以下错误：

url 中的错误（myPubmedURL，open = "rb"）：不支持 https:// URL

如何解决这个问题呢？谢谢

我正在使用带有 Python 3.x 的 Biopython 从 PubMed 数据库中进行搜索。我正确获得了搜索结果，但接下来我需要提取搜索结果的所有期刊名称（全名，而不仅仅是缩写）。目前我正在使用以下代码：

所以这很好用，但是 record.get("SO"), "?") 只返回期刊的缩写（例如，N Engl J Med，而不是New England Journal of Medicine）。根据我手动 PubMed 搜索的经验，您可以使用缩写词或全名进行搜索，PubMed 将以相同的方式处理它们，所以我想是否还有一些参数可以获取全名？

我正在尝试使用以下代码搜索一些文章：

从record['Count']我可以看到有 293279 个结果，但是当我查看record['IdList']它时，它只给了我 20 个 ID。这是为什么？如何获取所有 293279 条记录？

根据 NCBI 帮助台回答的问题之一，我们不能“批量下载” PubMed Central。但是，我是否可以使用“NCBI E-utilities”通过Efetch下载 PMC 数据库中的所有全文论文，或者至少在 Entrez Programming Utilities 中使用 Esearch 找到所有相应的PMCid ？如果是，那么如何？如果不能使用E-utilities，有没有其他方法可以下载所有全文文章？

我试图通过构建一个顶点列表数据框，通过 RISmed 包从 PubMed 获取文章来构建一个 R igraph 图，如下所示：

和相应的（无向）边列表

这是我正在获取的数据：

但我真的没有考虑如何从作者字符串列表中为未来的 igraph 图形对象构建边和顶点数据帧

感谢您的任何帮助

我想下载大型科学摘要数据，让我们说大约 2000 个 Pubmed ID。我的 python 代码很草率，而且工作起来似乎很慢。有没有什么快速有效的方法来收获这些摘要？

如果这是最快的方法，我如何测量它以便我能够与其他人或家庭与工作情况进行比较（不同的 ISP 可能会影响速度）？

下面附上我的代码。

编辑：此脚本发生的一般错误似乎是“连接被拒绝”。请参阅下面的 ZF007 的答案是如何解决的。