问题标签 [nibabel]

我有 RGB 图像，我将其作为 numpy 数组加载。我想将这些图像转换成漂亮的格式，我可以使用 ITK-SNAP ( http://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php ) 打开它。

这是我尝试做的事情：

但是，ITK-SNAP 解释output.nii为 3D 灰度体积而不是 RGB 图像。对我来说，ITK-SNAP 似乎应该能够处理 RGB 数据（见此）；但是，我不明白我应该如何保存img才能使这成为可能。我正在使用 ITK-SNAP 3.6.0。

加载大小为 14.4 MB 的大型 NIFTI 文件时出现以下错误。

这是代码：

当我尝试打开此类较小大小的文件（以 KB 为单位）时，不会发生这种情况。我可以在 FreeSurfer FreeView 中毫无错误地打开此文件，并且看起来不错。NiBabel 3.2.1 版本正在发生这种情况。

我有一个非常基本的问题。我想在我的计算机上安装一个新模块以便在 Python 中使用它（通过 Spyder）。当我通过 pip 安装软件包时，一切似乎都正常。当我想在我的脚本中导入包时，它说没有该名称的模块（见下面的截图）

有什么建议可能是什么问题？

非常感谢 ：）

这个问题的截图

我正在尝试将.npy图像转换为nii.gz图像，即使我正确遵循了说明，我也遇到了各种问题。

这是我正在使用的代码：

关于图像：（332、360、360）float64（这是我们打印形状和 dtype 时得到的） https://ibb.co/mRyTrw7 - 显示错误的图像和图像信息

我正在使用以下代码将我所有的 332 个 npy 切片转换为 nii.gz 格式：

对我来说，切片太多（以及大量图像）无法继续这样做，有没有办法一次将它们全部转换？

我对神经影像学过程非常陌生，并尝试使用 nltools 加载神经影像学数据。因此数据集可以在以下位置找到：https ://gin.g-node.org/ljchang/Localizer 我已将其下载到本地，这是我访问.nli.gz文件的代码

然而， Brain_Data() 提高

我确定路径正确并且文件具有完全控制权限。太感谢了！

我目前正在使用以下代码将 DCM 切片转换为 NIfti 图像：

此代码将生成 3D NIfti 体积。

如何从这个 3D NIfti 卷中获取所有切片？