问题标签 [matlab-spm]

我们正在尝试使用 SPM 分割脑组织类型，几乎不可能在网上找到如何在不使用 GUI 的情况下调用其底层 matlab 函数。

我发现的一些资源没有帮助：

• SPM 手册
• 维基教科书上的 SPM 书籍

我正在使用 matlab 在 SPM8 中使用批处理编辑器编写批处理。现在我想包含一个我自己编写的简单 matlab 函数。我确保这个函数保存在 SPM 的路径中。作为输入变量，该函数使用批处理中上一步的文件，当我指定要调用的函数时，它显示“无法评估输入”。

所以现在我试图让另一个简单的函数在 SPM 批处理中工作，例如“sqrt”。我将“评估输入”设置为 25，将“输出变量类型”设置为实数，将“要调用的函数”设置为 sqrt。再次出现一条错误消息，指出“无法评估输入”。

我在这里做错了什么？

我是 python 的新手，或者更具体地说是 ipython。如NiPype所述，我一直在运行一个名为SPM的统计包中应该是非常简单的Dicom转换的步骤，用于MRI图像文件。我无法让它运行，并且想知道我做错了什么。我没有收到错误消息，而是没有文件更改或输出。它只是挂起。有谁知道我可能做错了什么？我很可能在这里遗漏了一些非常简单的东西（对不起:(

我尝试通过我编译的 SPM12 中的 matlabbatch 对象使用私有 MATLAB 函数（私有意味着我自己编写）：

使用包含以下行的 batch.m 文件：

在文件 myfunction.m 中定义的函数“myfunction”为：

SPM 返回的错误信息如下：

项目“要调用的函数”，字段“val”：项目必须是函数句柄或函数名称。

但是，如果我将函数“myfunction”替换为标准 MATLAB 函数，例如“disp”，它就可以工作。它表明，不知何故，我需要指定 myfunction.m 文件的路径，但我不知道如何。

谢谢你的帮助。

我正在使用spm_jobman()运行大量的 SPM 作业。我有一台带有大量处理器的机器，所以我希望能够并行运行它们。可以spm_jobman()并行运行作业吗？如果是这样，如何做到这一点？

我在 Matlab 上使用 SPM 时遇到问题。我有一个m-file我需要调试但我还没有写的东西。这段代码很旧，很可能错误是由新版本的语法差异引起的。使用此函数弹出错误spm_get_files，最初出现在代码中。当将此函数更改为spm_get（我发现这两个函数应该是等效的）时，我收到以下错误：

'/home/***/folder','a3*093.img'我要分析的输入文件的目录在哪里。这些是功能磁共振成像扫描。

我的 Matlab 版本是 9(R2016a)，SPM 是 SPM12。（代码老了，原来是用SPM99写的）

任何人都可以帮助我吗？

谢谢！

我的 Mac 笔记本电脑上有 Python 3.5.2 (Anaconda 4.2.0 (x86_64))，我遇到了这个问题：

我搜索了这个问题，但没有找到任何解决方案。

先感谢您

我有一个使用 SPM8 工具箱的用户编写的 MATLAB 程序。如果直接运行，它工作正常。但是，编译再运行时，出现如下错误：

此功能来自与 SPM8 工具箱捆绑的 Fieldtrip 工具箱。startup.m包含以下内容：

我自己不是 MATLAB 用户，我在黑暗中摸索，但我的假设是找不到 Fieldtrip 工具箱。

任何人都可以对此有所了解吗？

我想在 SPM 中完成一项有点具体的任务。

基本上，我有一些输入 NII 文件scan.nii，我想对其应用任意仿射变换，由x y z p r yw.

x,y,z,p,r,yw表示每个自由度的平移和旋转（比如x=2mm，p=0.7deg等等）。我可以得到一个合适的矩阵M=spm_matrix([x y z p r yw])，但我不知道如何才能将这个矩阵实际应用到我的扫描中。

理想情况下，我希望它使用新文件名或简单地作为 Matlab 变量输出，这样我就可以对同一个图像多次执行此操作，但这不是明确必要的。

谢谢您的帮助。

我正在研究大脑图像（nifti）。我用 SPM12 分割了大脑。所以分割很顺利，但是对于一些（很多）主题，我明白了：

这是来自“ADNI”数据库的 3D 图像（T1 MRI）。

就像你可以看到仍然有头骨碎片。我需要删除它们。你能告诉我完成那个的步骤吗？使用 matlab 或 R 的代码/算法？

谢谢！