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我是 python 的新手,或者更具体地说是 ipython。如NiPype所述,我一直在运行一个名为SPM的统计包中应该是非常简单的Dicom转换的步骤,用于MRI图像文件。我无法让它运行,并且想知道我做错了什么。我没有收到错误消息,而是没有文件更改或输出。它只是挂起。有谁知道我可能做错了什么?我很可能在这里遗漏了一些非常简单的东西(对不起:(

import os
from pylab import *
from glob import glob
from nipype.interfaces.matlab import MatlabCommand as mlab
mlab.set_default_paths('/home/orkney_01/s1252042/matlab/spm8')
from nipype.interfaces.spm.utils import DicomImport as di

os.chdir('/sdata/images/projects/ASD_MM/1/datafiles/restingstate_files')
filename = "reststate_directories.txt"
restingstate_files_list = [line.strip() for line in open(filename)]

for x in restingstate_files_list:
    os.chdir( x )
    y = glob('*.dcm')
    conversion = di(in_files = y))
    print(res.outputs)
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您正在创建一个DicomImport接口,但实际上并没有运行它。你应该有res = di.run()

另外,你最好在运行di.base_dir = '/some/path'前告诉界面在哪里运行。

最后,您可能还想打印 的内容restingstate_files_list以检查您是否正确找到了 DICOM 目录。

于 2017-06-26T07:48:26.883 回答