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体素是在通过 3D 渲染算法获取图像后构建的，例如行进立方体吗？或者它们是通过直接 3D 图像采集获得的？

如果两者都可能：目前通常用于从 MRI 扫描中获取 3D 图像的方法是什么？

我正在研究 Transvoxel 的实现，它工作正常，但我无法继续处理噪音。现在我正在使用 perlin 噪声生成一个 2d 高度图，并使用我正在设置单元格值的高度图，但我不知道如何为单元格生成值。实际上它们必须在 -127 和 128 之间，并且它们必须平滑地增加和减少，但我无法生成这些值。

编辑：

我停止使用 3d 噪声，我正在尝试用 2d 噪声做一些事情。现在，我可以对密度场进行三角测量，因为我使用行进立方体和体素大约半年了。但我唯一不知道的是，如果我生成一个 2d 高度图以具有像山脉这样的地形特征，那么我不知道我必须使用什么密度。我尝试只是简单地给所有实心-127和所有非实心127，我还尝试在给定的（x，z）处获取高度图值，然后将y添加到它，例如：（x，0，z）= 42， (x, 1, z) = 43, (x, 2, z) = 44 等等......但是这些变化会产生如下图所示的块状地形：

我应该怎么做才能使它顺利？顶点位置是具有非整数值的浮点数，因此应该不是问题。

我有一个带有曲线（骨架化数据）的 3D 数组，需要找到这些线上两点之间的最短连接路径。

如何在 Matlab 中找到沿 3D 骨架数组的两点之间的最短路径？

有 几个 人在这里和mathworks 论坛上提出了类似 的问题。但大多数答案都指向这篇关于寻找最短路径的博客文章，它不会沿着骨架搜索。如果我试图沿着骨架强制它，它也会返回不在两点之间但离两点更远的路径。此外，人们建议的一些 matlab 函数只能处理 2D 数据（例如，可用于规避非骨架体素）。 bwdistgeodesic

我使用文件交换中的两个函数。这就是我所做的：

到目前为止，这些结果很好：

右图中的白线显示骨架，蓝线显示种子。但是，如果我尝试应用距离变换，我找不到最短路径：

第一个发现几乎再次发现了整个骨架，第二个看起来像假的。区域最小值肯定不适合找到路径，但不确定还有什么。此外，我的距离计算没有考虑骨架，我试图在第二条路径中规避它，但也没有很好地工作。

我应该怎么做？

刚刚发现了一个叫做“快速行进”的东西，也许这会起作用。现在调查它。

从那时起，我一直致力于实现 Transvoxel。现在它起作用了，它多边形化了，但它有点像块状。如下图所示：

这是多边形化的代码：

这是另一个用于生成高度图和密度值的方法：

如果您以前使用过 Transvoxel，或者您对此有任何想法，请发表评论或回答。我真的坚持这一点。

编辑：密度生成代码的变化，不生成太多的零等等，但它仍然是块状的。

使用 python VTK lib 渲染透明对象时，会出现奇怪的图像显示效果。在某些时候，当我们旋转物体时，物体的透明度会发生一些变化。它们从前景中消失。有时会发生有时不会。这极大地阻碍了视口中的导航。也许这与法线有关。有可能解决这个问题吗？代码：

我的目标是使用 python 从漂亮的 (.nii) 格式获取 .obj 文件，目的是在 Unity 上打开它。我知道“scikit-image”包有一个名为“measure”的模块，它实现了 Marching cube 算法。我将行进立方体算法应用于我的数据，并获得了我期望的结果：

然后我可以绘制数据：

我一直在寻找将数据（顶点、面法线、值）保存为 .obj 的函数，但我还没有找到。因此，我决定自己建造它。

但是当我将数据导入统一时，我得到了以下结果：

所以我的问题如下：

• 我在 .obj 制作过程中做错了什么？
• 是否有一个模块或功能可以更好地做到这一点？
• 有可能做我想做的事吗？

谢谢你。

更多示例：

Python：

统一：

我有一个表示为体素化图像的薄结构。我正在使用来自 scikit-image 的行进立方体，但我注意到它不能很好地处理薄结构。

相同结构的示例移动了半个体素：

所以第二个失败的原因是没有高于的值level。但是，知道我的结构是二进制结构（不存在中间值），我想知道是否可以通过以下方式补偿这些插值伪影

• 使用不同的行进立方体算法？
• 使用分辨率增加？

我正在尝试从 3d 体积生成网格。我在VTK上处理，使用Marching Cube（vtkMarchingCubes.h）；但我仍然找不到如何将结果视图保存为 vtk 文件！

任何想法

我感谢您的帮助。

我正在研究如何实现与这项工作类似的东西：https ://vimeo.com/9121195 。但是通过给定颜色数组中的每个元球显式地分配颜色。据我所知，在这个例子中这完全是从着色器方面完成的，但我想知道这是否不能用 Threejs 和 marchingcubes 来实现。

通过创建一个新的THREE.ShaderMaterial，我假设我可以将每个元球的位置传递给着色器，然后评估每个顶点与给定位置的距离，最终为每个像素分配颜色。

只是为了简化问题，我从两个移动的元球开始。

从threejs：

}

这是我的着色器：

这是一个示例结果：

这里的问题是，显然距离没有正确计算，并且我尝试使用的两种颜色之间的过渡mixScale也不起作用。任何想法？

我尝试使用three.js 的Marching Cubes 库实现一个显示不同类型的空间二次曲线的小程序，以呈现隐式表面。虽然出现的形状不正确，我想我没有THREE.MarchingCubes根据需要实现属性。小程序的核心有以下代码

但完整的代码可以在这里检查。我想field属性必须用函数的值填充，但也许这不是正确的方法。例如，当a11变大时会出现奇怪的效果，这会扩大椭圆体而不是缩小它；“行进立方体网格”似乎也在扩展，这有点有趣。

许多其他配置与预期结果不匹配。哪个是正确的使用方法THREE.MarchingCubes？