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For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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r - muhaz 包风险函数的置信区间

该软件包使用核平滑方法从右删失数据中估计风险muhaz函数我的问题是,有没有办法获得计算的危险函数的置信区间?muhaz

muhaz 危险函数

在上面的示例中,有muhaz.object fit一些条目fit1$msemin,但是它们的长度是 的一半。fit1$var.minfit1$haz.estfit1$haz.est

如果可以提取危险函数的置信区间,有什么想法吗?

编辑:我根据@user20650 的建议尝试了以下内容

设置 max.time 似乎有效,每个引导样本都有相同的估计网格点。然而,获得的 CI 意义不大。通常我希望间隔在 t=0 时很窄,并且随着时间的推移变得更宽(信息更少,不确定性更多),但获得的间隔似乎或多或少随时间保持不变。

在此处输入图像描述

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r - 计算标准正态分布的风险函数

根据Mathematica UUPDE 数据库中给出的公式, 我绘制了 R 中标准正态分布的风险函数。

在一定范围内似乎是正确的;数值较大时会出现数值问题,见附图。以下是完整的 R 代码。

任何意见将不胜感激。

标准正态分布的 PDF、CDF、HF 和 SF 图

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r - 创建具有响应百分比和时间的逆 Kaplan Meier 曲线

我正在尝试创建患者对药物治疗做出反应所需时间的逆 KM 图。

时间以天为单位,响应以百分比为单位。起初我以为我可以使用生存分析来尝试这个,但认为危险图会更好。我不知道该怎么做。

这是一篇已发表文章的链接,第三张图显示了这一点。我还不是 KMplots 方面的专家,但我们将不胜感激任何帮助和批评!

https://www.researchgate.net/publication/7789803_Bortezomib_therapy_alone_and_in_combination_with_dexamethasone_for_previously_untreatment_症状_multiple_myeloma

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r - 比例风险假设

我正在使用 R 中的 coxme 函数 {coxme} 运行混合效应 Cox 模型,并且我想检查比例风险的假设。

我知道 PH 假设可以通过 cox.ph 模型上的 cox.zph 函数 {survival} 进行验证。

但是,我找不到 coxme 模型的等价物。

2015 年在这里发布了一个类似的问题,但没有答案。

我的问题是:1)如何测试混合效应 cox 模型 coxme 的 PH 假设?2) 如果 coxme 模型没有等效的 cox.zph,在科学文章中发表运行混合效应 coxme 模型但在与 coxme 模型相同但没有随机效应的 cox.ph 模型上测试 PH 假设是否有效?

提前感谢您的回答。问候

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r - 如何从 R 中的 glmnet 对象中提取基线危险函数 h0(t)?

从 glmnet 对象中提取基线风险函数 h0(t)

我想知道时间 t >> h(t,X) = h0(t) exp[Σ βi*Xi] 的风险函数。如何从 R 中的 glmnet 对象中提取基线危险函数 h0(t)?

我所知道的是,Survival Packages 中的函数“basehaz()”只能从 coxph 对象中提取基线危险函数。

我还发现了一个函数, glmnet.basesurv(time, event, lp, times.eval = NULL, centered = FALSE). 但是当我尝试使用这个功能时,出现了错误。

错误:找不到函数“glmnet.basesurv”

下面是我的代码,使用 glmnet 拟合 cox 模型并获得所选变量的系数。是否可以从这个 glmnet 对象中获取基线危险函数 h0(t)?

代码

我非常感谢您能提供的任何帮助。

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python - 如何将累积风险概率转换为条件/边际概率?

我正在使用 Python 中 Lifelines 中的 AalenAdditiveFitter 构建预测模型,以预测事件是否会发生以及何时发生。

T(时间)= 月 C(事件)= 1 是,0 是否

此外,我还有 8 个正在使用的属性。

我能够建立一个相对稳定的模型并使用以下方法获得累积危险概率:

有没有办法直接从 AalenAdditiveFitter 过程中获得条件/边际概率?

因此,在进行了更多挖掘之后,我可以假设以下内容吗?

  1. 我从 Aalen Additive 模型中获得累积危险概率
  2. 为了让他们得到每个月的条件概率,我可以取上个月的差值:P(t) - P(t-1)

这是基于发布在https://quant.stackexchange.com/questions/21816/cumulative-vs-marginal-probability-of-default上的答案

不确定这个解决方案是否如此简单,请帮忙。

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r - 危害比的坐标方向

假设我有以下数据集:

所以我所做的是重新调整到我的参考 A 并运行:

我查看了结果并与提供的示例协议进行了比较,发现我的 exp(-coeff) 在 B 和 C 两种情况下都等于它们的 exp(coeff)。

因此,我使用参考 B 再次运行代码,并使用参考 C 运行一次,发现下限和上限都与示例一致。但是,我还需要 log-rank p 值,而这不是以这种方式提供的,因此我想知道:

我如何扭转模型,使逆危险比和 conf. 显示了限制和 p 值(我的意思是逆模型)/或者您认为还有其他问题吗?

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r - 使用 stat_functions 进行基本计算——绘制危险函数

我目前正在尝试用 R's 绘制一些密度分布函数ggplot2。我有以下代码:

基本上我想根据具有不同参数的 Weibull 分布绘制危险函数,这意味着我想绘制:

https://i.stack.imgur.com/w2nlZ.gif

上面的代码给了我这个错误:

计算失败stat_function():未使用的参数 (x_trans)

我也尝试直接使用

而不是上面带有自定义函数构造的“解决方法”。这引发了另一个错误,因为我试图对一个对象进行数值算术:

二元运算符的非数字参数

我得到了那个错误,但我不知道解决方案。

我做了一些研究,但没有成功。我觉得这应该是直截了当的。我也想尽可能地“手动”完成,但如果没有简单的方法来做到这一点,那么打包的解决方案也可以。

在此先感谢您的任何建议!

PS:我基本上想重新创建您可以在链接的 PDF 文件第 10 页上的Kiefer,1988中找到的图表。

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r - Forestplot.default 中的错误:您在均值参数中提供了 2 行,而标签有 34 行

我正在尝试在 R 中制作森林图。

本站提供的示例:https ://designdatadecisions.wordpress.com/2016/07/02/forest-plot-with-horizo​​ntal-bands/

从读取 R 中的数据开始。

格式化使列标签和列匹配

到目前为止没有错误。

在我尝试执行第二步后,出现错误。第二步如下:

错误:

Forestplot.default(labeltext = tabletext, graph.pos = 3, mean = c(NA, : 您在 mean 参数中提供了 2 行,而标签有 34 行

这甚至意味着什么?如何解决这个问题?

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limit - F(x)/x(1-F(x)) 的期望值有名字吗,F(x) 是 CDF?它与危险函数有关吗?

我正在解决一个问题并遇到以下问题:

\sum (f(x)/x) (F(x)/(1-F(x))

这里 f(x) 是 pmf,F(x) 是 CDF。F(x)/x(1-F(x)) 的期望值是已知函数吗?我发现 f(x)/(1-F(x)) 被称为危险函数。此外,x 是在正值上定义的。可以假设 x 在两个值 Xmin 和 Xmax 之间有界。

我想更多地了解这个期望值的特征,如果我们取总和直到 F(x) < 1,它是有界的吗?

如果有人能帮助我更好地理解这一点,我将不胜感激。