问题标签 [hazard]
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r - 删除虚线置信区间线并修改图例
如何从图中删除置信区间虚线?
对于图例,为什么第 2 行是虚线,而第 1 行是实线?有没有办法让两条实线?我不确定这段代码的作用 - lty=1:2, cex=0.8
我在下面附上了我的一个数据集和相应的命令。谢谢!
r - 在减少值的条件下,R中的子集数据
找不到类似的问题,所以我们开始吧:我在 R 中有一个大型数据集,我想为危害分析做准备。因此,我想创建一个二分法生存变量。但是,我的危险事件有一个相对的解释,而不仅仅是某个值为 0。数据集的形式为:
加上一堆自变量和控制变量。ID 输入适合生存分析的子集,因为 y > 0。回到危险变量:我希望它取“1”,因为 y 的减小值低于阈值,即 y 达到的最大值的 75%关于 ID 组。因此,该危害必须满足两个条件:
- 值低于阈值(相对于它们的 ID)
- 值正在减少。因此,如果存在与上述类似的列,对于 ID 2 的前两个值,危险变量不应编码为“1”,因为这些值可能低于阈值但高于前一个值。
有人有解决方案吗?提前致谢?
r - 在 r 中使用 predict.coxph 预测基线累积危险
我的目标是预测(从下面的拟合模型预测新观察的累积风险)从时间尺度 0 到拟合模型的开始时间的累积风险值。
我已经使用 2 次拟合了 cox 模型(开始时间不等于 0 和结束时间)。因此,我可以找到结束时间的累积风险(即从 0 到结束时间的累积风险,我已经使用相同的拟合模型计算)和开始时间的累积风险(即从 0 到结束时间,我想在这里计算),这最终将给出每次观察的开始时间和结束时间之间的 cum haz。
因此,为了获得我使用的预期事件数量predict(coxph(), newdata, type= "expected")
。
我使用的数据如下:
预测代码是:
但pred2
唯一的结果是“NA”值。有人可以指出我的想法或代码中是否有任何错误
如果需要进一步澄清,请告诉我。
survival-analysis - 危险函数到 PDF 计算之间的转换
我正在尝试制定危险函数和概率密度函数之间的计算。
举个例子:pdf_arr = [0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2]
。
我的计算与以下内容不匹配:PDF -> Hazard -> PDF。
所以我正在尝试从转换PDF -> CDF -> Survival Function-> Cum Hazard -> Hazard -> PDF
。
以下是我计算的值: PDF to CDF 给了我 CDF: [0.2, 0.4, 0.6, 0.8, 1. ]
。
CDF to Survival 给了我 Survival: [1. , 0.8, 0.6, 0.4, 0.2]
.
Survival to Cumulative Hazard Func 给了我[0, 0.223, 0.511, 0.916, 1.609]
。
对危险的累积危险函数给了我[0, 0.223, 0.287, 0.405, 0.693]
)。
PDF 的危害给了我[0.2, 0.205, 0.213, 0.228, 0.277]
。
r - 累积危险曲线的多状态建模和比较
如何使用多态方法将两条累积风险曲线与总体四个过渡态进行比较?我有从(下面)的过渡,我想比较 1 和 2 的累积危害,因为从视觉上看,从未经治疗到死亡 #1 从未经治疗到出院 #2 从治疗到死亡 #3 从治疗到出院 #4 存在一些差异