问题标签 [ggraph]

我想格式化非叶子不同，但我无法找到有关过滤器的 aes 的更多信息。有哪些不同的可能值？

这是一个例子

为了获取根节点或其他节点，我必须在过滤器中放入什么？

我有以下内容tree hierarchy data.frame：

hierarchy.df$Unclustered它描述了一个迭代聚类过程，我们从非聚类数据开始（当没有集群可以再分解为更精细的集群时，就达到了收敛。

在此示例中，经过 4 次迭代后达到收敛。

我正在尝试hierarchy使用ggraph包来绘制这个：

这给了我：

所以这里的问题是迭代 1 的集群 1.3 从根指向上方，而不是与该迭代的所有其他集群齐平，因此树看起来很糟糕。

知道如何解决这个问题或使用另一个绘图包来做到这一点吗？

我想使用ggraphpackage，但加载它，我得到了这个错误：

这是什么意思？我该如何解决？我在互联网上找不到任何答案。提前致谢。
我在 Windows 10 这个版本的 R 上运行：

我正在尝试在ggraph.

igraph类对象是从下面的数据框中获得的：

但是，当我在以下脚本中绘制图形时，它会产生意想不到的边缘宽度：

有一些基本问题：

• in 中定义的边的宽度weight与节点 ID 不对应（from/toinedge和namein node）。例如，权重3赋予数据框0->1和1->0数据框，但它出现0<->2在图表之间，
• 即使边距由and设置，之间的边也会0<->1进入节点内部，0start_capend_cap
• Weight除了边缘之外的标签不是集中的（它位于节点 0 附近）
• geom_node_label由重叠节点 定义的标签
• 节点 (w和s) 内的标签大小似乎没问题，但它们的位置不正确dodge（它们相互重叠）

第一点以外的问题都只是审美问题，但第一点是情节的致命错误。我绘制了它，igraph其中给出了节点和边缘之间的适当关系。

我非常感谢您提出的解决上述任何问题以获得所需图表的建议。我是新手，ggraph并找到了一些获取当前图表的解决方案，但是我目前一直在努力解决上述问题。（我更喜欢使用ggraph而不是igraph精确控制它的外观）

========== 更新 ==========
大多数问题可以通过以下脚本解决，尽管这是非常手动的调整。一个最重要的关键是去除0<->0导致标签与边缘实际宽度不适当对应的循环边缘。

然而，关于图例还有两个问题：

• 如何将重叠的“w”和“s”替换为其他字体，例如“a”（活动）？
  
• 如何在所需结果中再添加一个手动图例“活动类型”？
  

我把它作为一个新问题发布在这里

除了这篇文章，我在这里提出新的问题，如何调整由ggraph.

以下是生成当前情节的脚本：

这是我想要的结果。

这是上述脚本的结果。

有两个与图例相关的问题可以达到我想要的结果：

• 如何将“活动数量”中重叠的“w”和“s”替换为其他字体，例如黑色的“a”（活动），如所需结果所示？
  
• 如何在所需结果中再添加一个手动图例“活动类型”？
  

虽然是用 in 写的ggraph，但我想语法似乎与 in 相似ggplot2。我很欣赏你的建议！！

========== 更新 ==========

第一个问题已通过更改scale_size参数解决，如更新的脚本所示。

但是，第二个问题仍然存在，我0-value在圆心（非常小的点）的符号上发现了另一个问题。我找到了一些解决方案来解决这个问题，方法是应用 1)subset()省略0-value数据框中的记录data=subset(df,x!=0)，2) 在方法中简单地用 NA 填充 0 值data=ifelse(x==0,NA,.)，但是由于它是从graph对象写入的，因此它可能不适用于这种简单的情况。

========== UPDATE ver.2 ==========

这真的很棘手，但不知何故我可以删除线中心的点以及添加一个图例。

我真的不确定原因，但前一个问题通过 1）0 values在node数据框中NA替换为 2）在 geom_node_textNA中的语句中替换为，然后 3）通过指定颜色来解决。它不会删除数据，只是将颜色更改为白色以使其不可见。 我想这不是正式的解决方案，而只是我在数十次试验中遇到的方式。有趣的是 1) 和 2) 应该结合起来，否则它会返回错误。 aes(size=...)aes(size=ifelse(is.na(w),0,w) ...color=ifelse(w==0,"white","red")0-value

因此，这是最后的更新：

但是，由于它仍然是丑陋的代码，我仍在等待您对更合适的操作的建议。

我正在使用包ggraph中的布局函数绘制图形igraph。但是，我得到的布局在视觉上并不完全令人满意。特别是我有一个非常强的连接组件和一些未连接节点的图表。结果如下所示：

因此，连接组件中的节点非常靠近，以至于边缘甚至都不可见。现在这使用了fr布局，但其他布局给出了类似的结果。我似乎无法找到一个参数可以使图形稍微松散一点，使连接的组件看起来不像这样的球。将不胜感激任何建议。

我有一个包含论文 ID 和作者姓名的数据框，如下所示：

解释是作者 a 和 b 一起写论文 1，而作者 b 和 c 一起写论文 2 和 3。

我想用例如这样来绘制这个ggraph：

a - b = c

也就是说，我希望将作者作为节点，将共同撰写的论文数量作为边权重。

我正面临这个问题：我得到了一些这样的数据：

现在我希望有一个带有 ggraph 的图，它有节点和带权重的边。所以我是这样工作的：

然后节点：

到目前为止，一切正常。现在，以此为例：

突然我绘制了图表：

但结果是这样的：

而且我无法弄清楚为什么k和z之间有一条线，因为边不存在。

预先感谢。

我正在尝试绘制二元组的共现（来自Text Mining with R），如下所示：

或者像这样：

但是按照书中给出的完全相同的代码，我的情节缺少很多线条和颜色。不知道是因为我错过了一些重要步骤还是我错过了某些包裹。

下面是一个更简单的版本来说明：

而且我得到的情节不正确（甚至图例也没有正确显示）：

好的，这很有趣，但删除theme_void()所有解决方案。我想当这本书被写出来时，它会做一些不同的事情。但是第二张图中的图例仍然没有显示，所以仍然有问题：

一直在阅读 Julia Silge 和 David Robinson 的 Tidytext Mining with R - https://www.tidytextmining.com/nasa.html - 并为如何根据频率 (n) 调整节点大小感到困惑。尝试了以下代码...

...并收到此错误...

任何想法或想法将不胜感激。