问题标签 [ggally]

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r - 使用 ggnet2 在 R 中按度数着色

我一直在尝试使用ggnet2. 为此,我使用以下代码:

我得到一个完全蓝色的图表。

我正在使用包igraph

我想要绘制的是一个基于节点颜色的图表,如下所示: 在此处输入图像描述

文件链接:
https ://snap.stanford.edu/data/ca-CondMat.html

编辑:

添加了完整示例

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r - 在`ggsurv`图中(或在`plot`)中区分不同类型的每条线

我正在使用Rstudio. 我正在使用包中的ggsurv函数GGally为我的数据绘制 Kaplan-Meier 曲线(用于生存分析),来自教程here。我使用它而不是plot因为ggsurv它自己照顾传说。

如链接所示,多条曲线按颜色区分。我想根据线型进行区分。本教程似乎没有任何选择。以下是我的命令:

lty.est=3(或 2)为所有线提供相同的虚线。我希望每条线都有不同的虚线。使用lty=type给出错误:object 'type' not found。并且lty=type可以工作ggplotggplot不直接处理survfit情节。

请告诉我如何通过线型ggsurv或简单来区分曲线plot(尽管我更喜欢ggsurv它,因为它会处理图例)

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r - 将总体生存曲线添加到协变量的生存曲线图

我一直在尝试将“整体”生存曲线添加到为给定协变量生成的生存曲线中。该曲线是使用 R 中的生存和 ggsurv (GGally) 生成的。

我使用 R 中生存包中的冒号数据集重新创建场景。

现在我需要将总体生存线添加到图 g_rx 中。g_rx, g_avg 是 ggplot2 对象。

现在我尝试向 g_rx 对象添加一行。

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r - 更改 ggpairs 中的颜色,因为 params 已弃用

我看到这些帖子 GGally::ggpairs plot without gridlines when plotting correlation coefficient use ggpairs to create this plot

阅读后我能够实现这个黑客https://github.com/tonytonov/ggally/blob/master/R/gg-plots.r我的情节看起来像这样

我的阴谋

我认为这是一个很好的结果,但我无法更改颜色。

A MWE是这个

现在我想跑

但颜色保持不变。既然 params 不再工作了,有没有办法改变颜色?

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r - ggpairs 更改axisLabel字体大小

在为 绘制内部axisLabelsggpairs,如果数字很大,它们会被裁剪掉。

在此处输入图像描述

在上图中,Var2 的 y 轴标签被截断,Var4 的 x 轴数字一起运行。我将如何更改字体大小?

我从这个页面看到,可以通过添加theme()from来找到修复ggplot2,但我找不到代表轴文本字体大小的主题元素。

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r - 基于 R ggpairs 变量的着色点

我正在尝试使用代码重现https://tgmstat.wordpress.com/2013/11/13/plot-matrix-with-the-r-package-ggally/中的数字

然而,在情节中,我得到的点不是基于性别的颜色,而是它们都是相同的颜色。我收到以下警告

警告消息:在 warn_if_args_exist(list(...)) 中:额外参数:“颜色”被忽略。如果这些是>美学,请使用带有> ggplot2 :: aes或ggplot2 :: aes_string的ggpairs中的'mapping'变量提交它们。

我尝试添加 ggplot2::aes(color = sex),但这也不起作用。

这里还有其他人有同样的问题吗?我正在使用 R 版本 3.3.1 和 GGally_1.2.0。

谢谢。

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r - 如何让 ggpairs 在上面板中显示 ancova 结果?

我正在制作一个带有 ggpairs{GGally) 的散点图矩阵,如下所示,但我想在上面的面板中显示我的 aov 结果中每个术语的 p 值,而不仅仅是出现的整体和按物种的相关值与包裹。

我怎样才能从这个 aov 结果中得到正确的列到我的上图中?我可以编写一个自定义函数来做到这一点,以及如何?甚至可以使用ggpairs吗?谢谢。

虹膜数据 ggpairs 图

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r - 如何为一个直方图指定 bin 宽度?

如何为一个直方图指定 bin 宽度?

在此处输入图像描述

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r - 减少 ggpairs 图中的线条粗细和“Corr:”字体大小

我正在做一个 ggpairs 绘图,但回归线太粗而且“Corr:”文本字体太大。

这是输出:

在此处输入图像描述

我在GGally文档中找不到可以设置它的位置。

任何指针?

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r - 保留原始 y 轴标题或调整通过 yAxis Labels 输入的标题与 y 轴之间的距离

我想使用 GGally 组合几个散点图ggmatrix更喜欢这样做,gridarrange因为当 y 轴标签的大小不同时可以更好地对齐)。我的问题是

  1. 我可以保留原始轴标题(每个图的 y 轴,仅最后一个图的 x 轴吗?

或者

  1. 如果我使用yAxisLabels=在其中添加 y 轴标题,我可以修改(减少)轴标题和轴之间的空间ggmatrix吗?
  2. 使用gridarrange来自Gridextra,当 y 轴标签的大小不同时,有没有办法正确对齐多个绘图的垂直网格线?(底部图的大小可以通过添加额外的图例来调整,为组合 ggplots 添加一个通用图例,但这对我来说不适用于轴标签/标题)

示例代码(我的原始数据集有更多行):