和

我明白了

如何使对角线密度图不被填充，只显示线条？

有点作品……但不是真的。

这真的很丑 - 就代码而言 - 因为它对我来说没有真正的意义。此外，它在这里不起作用，因为它也会改变直方图。

这与R 和 ggpairs 中用户定义的调色板中的问题相同， 或者有没有办法使用 ggplot 更改 GGally::ggpairs 的调色板？

只是那里的解决方案不再起作用。

我也想更改调色板，但是有没有办法使用 ggplot 更改 GGally::ggpairs 的调色板？不再工作了。该怎么办？

MWE：

我想补充

（显然这只是虚拟代码）并得到类似的东西（我没有画出所有的点）：

抛出错误

这是来自GGally的例子。这是（另一个）错误吗？

我似乎无法ggparcoord使用离散比例让我的情节着色。当我这样做时：

输出图仍然使用连续比例（使用Species因子的水平）为线条着色。

我还尝试了scale_color_manual此处指定技巧的修改版本：在 ggparcoord 中控制颜色，但无济于事。

但我收到此错误消息：Error: Continuous value supplied to discrete scale。

我也试过.. + scale_color_discrete()：同样的错误信息。

我很难过......即使ggparcorod cran 页面上的示例也不起作用：

错误信息：Error: (list) object cannot be coerced to type 'double'

编辑

有一个解决方案是使用mapping=aes(color=as.factor(Species))，如下面的Didzis Elferts回答所示。但是，它需要在scale_color_discrete

有没有一种不需要添加scale_color_discrete("Species", labels=levels(iris$Species) )零件就可以完成相同事情的方法？

例如，在 中ggplot2，

自动生成标记良好的图例。中是否有类似的方法ggparcoord？

我正在使用 R 版本 3.2.1 ggplot2_2.0.0、 和GGally_1.0.0

任何帮助将非常感激！

考虑这个例子：

如何使密度图更透明并去除黑线？

这些GGally软件包最近似乎发生了很大变化，我找不到可行的解决方案

更新

我发现如何使用自定义函数更改 alpha：

但黑线仍然存在。

我对下面的情节感到困扰。有人会给我一些关于如何创作这种情节的建议吗？

我正在尝试复制 Coursera R 回归模型课程中给出的这个简单示例：

我希望看到一个 6x6 对图 - 一个散点图，对于瑞士数据中 6 个变量的每种组合，黄土更平滑，置信区间。

但是，我收到以下错误：

display_param_error() 中的错误：'params' 是一个已弃用的参数。请“包装”该函数以提供参数。帮助（“包装”，包=“GGally”）

我查看了ggpairs()and帮助文件，并尝试了and函数wrap()的许多排列。wrap()wrap_fn_with_param_arg()

我可以让它按预期工作：

但是一旦我添加了黄土部分，它就不会：

当我尝试上面的行时出现此错误。

值错误[3L]：以下 ggpair 绘图函数很容易获得：连续：c('points', 'smooth', 'density', 'cor', 'blank') 组合：c('box', 'dot ', 'facethist', 'facetdensity', 'denstrip', 'blank') 离散：c('ratio', 'facetbar', 'blank') na: c('na', 'blank')

诊断连续：c('densityDiag', 'barDiag', 'blankDiag') 诊断离散：c('barDiag', 'blankDiag') 诊断 na: c('naDiag', 'blankDiag')

您还可以提供自己的函数，遵循 function(data, mapping, ...){ 的 api。. . } 并返回一个 ggplot2 绘图对象 例如：my_fn <- function(data, mapping, ...){ p <- ggplot(data = data, mapping = mapping) + geom_point(...) p } ggpairs(data, lower = 列表（连续 = my_fn））

提供功能：黄土

显然我在错误的地方进入了黄土。谁能帮我理解如何添加黄土部分？

请注意，我的问题与这个不同，因为我在询问如何在 ggpairs 中实现 loess，因为 params 参数已被弃用。

非常感谢。

给定一个新会话，执行函数文档中提供的一个小ggparcoord(.)示例

结果如下图：

同样，在一个新的会话中开始并使用加载的dplyr执行相同的脚本

结果是：

错误：（列表）对象不能被强制输入'double'

请注意，library(.)语句的顺序无关紧要。

问题

1. 代码示例有问题吗？
2. 有没有办法克服这个问题（通过一些命名空间函数）？
3. 或者这是一个错误？

我需要dplyr和ggparcoord(.)在更大的分析中，但这个最小的例子反映了我面临的问题。

版本

• R@3.2.3
• dplyr @ 0.4.3
• GGally @ 1.0.1
• ggplot @ 2.0.0

更新

总结 Joran 给出的出色答案：

答案

1. 代码示例实际上是错误的，因为ggparcoord(.)需要一个data.frame而不是diamonds数据集给出的 tbl_df（如果加载了 dplyr）。
2. 通过将tbl_df强制为data.frame来解决问题。
3. 不，这不是错误。

工作代码示例：

我使用以下代码制作了一个带有 ggplot2 扩展 GGally 的散点矩阵

现在我的问题是，在这种情况下，我真的不需要密度线图或相关系数。我只想要矩阵中的散点图。有没有办法“删除”其他方面？我无法在文档中找到任何内容。

请原谅我糟糕的英语并感谢您的任何建议或帮助！

编辑：我用 ggpairs 找到了一个还不完美的解决方案：

但是现在没有传说了，两个标签看起来像情节还没有完全加载：

tl;博士ggpairs无法让我满意的独立图例（描述整个情节的共同颜色） 。

对不起，长度。

我正在尝试使用GGally::ggpairs（用于绘制各种绘图矩阵的扩展包）绘制（下三角形）对图ggplot2。这与如何向 ggpairs() 添加外部图例本质上是相同的问题？，但我对这个问题的美学答案不满意，所以我将其作为扩展发布（如果评论者建议/推荐，我将删除此问题并提供奖励）。特别是，我希望图例出现在子图框架之外，或者将它放在一个虚拟子图中但允许额外的宽度来容纳它，或者（理想情况下）将它放在一个单独的（空的）子图中。如下所示，我的两个部分解决方案都有问题。

假数据：

基础绘图功能：

修剪顶部/右列的功能：

去掉左栏中的图例（如上面的链接问题）：

问题：

• 图例后面的空白面板实际上掩盖了一些点；我不知道为什么它不像往常一样不在面板之外，我认为这ggpairs是正在做的事情
• 如果它在面板之外（在顶部或右侧），我想确保留出一些额外的空间，以便面板本身的大小相同。但是，ggmatrix/ggpairs看起来对此非常不灵活。

到目前为止，我能够尝试的唯一替代方法是通过提取图例并使用ggplot 分离图例和绘图gridExtra::grid.arrange()：

问题：

• 被抑制的轴和标签ggpairs又回来了......

我还考虑过创建一个带有仅包含图例的特殊情节的面板（即试图用来theme(SOMETHING=element.blank)抑制情节本身，但不知道该怎么做。

作为最后的手段，我可​​以自己在适当的地方修剪轴，但这实际上是在重新发明ggpairs一开始正在做的事情......