问题标签 [upsetr]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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r - 从目录中读取文件,将它们转换为列表以进行扰乱图输入

我正在尝试从目录中读取文件,然后将它们转换为列表,然后尝试将它们转换为二进制矩阵以进行打乱图。到目前为止,我已经完成了。

步骤1

result_abd的输出

尝试了第一个 list_to_matrix

它没有用

然后尝试了这个答案 它有效

使用上面的对象我运行了 uptR

错误

任何建议或帮助将不胜感激

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r - 循环 UpSet 图

我有许多数据框,我想在 R 中创建 UpSet Plots 并将它们写入外部文件夹。我正在使用我成功使用的类似代码来创建散点图并将其保存到外部文件夹。

下面是两个示例数据框,以及我尝试使用 lapply 函数来完成任务。

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r - 将轴标题移向绘图并保留组合矩阵标签

我正在尝试将 y 轴标题移向刻度。但是,如果不切断组合矩阵标签,我会遇到麻烦。我已经尝试过 withggupsetggplot功能。请参阅下面的代表。

谢谢您的帮助!

reprex 包于 2021-07-30 创建 (v2.0.0 )

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r - 在 R 中绘制直方图和 UpSet 图

我有一个看起来像这样的数据框,

我想在 R 中制作一个 UpSet 图以查找常见基因,并且
我想在直方图中绘制类型(SNP 或 DEL)的分布。

这是我到目前为止的代码

这是我的错误,我无法解决

在此处输入图像描述

非常感谢任何帮助

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r - 在 Complex Upset 中通过设置颜色手动着色点

我想使用ComplexUpset包创建一个 UpSet 图。我想手动为交叉矩阵中的点着色以匹配集合的颜色。

这是我到目前为止所尝试的:

输出

添加 scale_color_manual 只会导致额外的点图例,这是我不想要的。我希望交叉矩阵本身中的点为红色,“冒险”的点为蓝色,“儿童”的点为黄色。连接点的线段应保持黑色。

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upsetr - 更改混乱情节中的集合标签 - 去掉集合名称中的下划线

我查看了这个问题的上一个答案并尝试创建一个列表输入,但它没有用。这是我的代码,它产生了一个可爱的不安情节,但审阅者要求从标签中删除下划线。我回到 CSV 文件并删除了下划线,但最后我用句号代替了下划线。有没有办法重新标记集合名称?

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r - 更改集名称标签

我可以看到这已经被问过好几次了,但我找不到有效的方法。有没有聪明的人可以解决这个问题?

这制作了一个非常漂亮的不安图,但我需要去掉集合标签中的下划线。我尝试了这篇文章中建议的答案:UpsetR change set name labels in graph

然而,这会产生很好的标签,但图表无法正确显示。我也尝试过使用带有标签列的小标题,但该包似乎不适用于小标题。

有没有办法做到这一点?我只会使用一个词,但它确实需要 2 个词标签。

如果确实存在解决方案,任何帮助将不胜感激?

非常感谢!