问题标签 [upsetr]

当我打电话时，UpSetR 图表没有正确保存f。保存到tmp.tiff的是空白图像文件。如果我调试该函数，那么它会正确保存。

我已将图形保存到一个变量中，该变量称为文件流的 tiff 函数，称为图形变量，然后是dev.off(). 我在这里想念什么？

编辑：

我有以下代码：

这产生了这个情节：

如您所见，目前左侧的条形图是根据大小排序的。我想从上到下订购它：three, two, one。

我怎样才能做到这一点？

我想得到一个在左侧按 S1-6 列出的顺序保留 6 行的图，至于列我只对选定的交叉点感兴趣（只有非空的 S1 和 S2 以及一个特定的空 S1 -S2 相交）。

这是我的情节的样子

但是，我的行顺序已经改变，我想使用 group.by="sets"，所以我的问题是如何更改行和列的顺序，选择显示的交叉点并更改所选集的颜色。我想在左边有 S1-6 并分组红色，然后是黑色空路口，然后分组蓝色。

ComplexUpset 包非常好，但我也无法得到我需要的东西。有人可以帮我吗？

我正在尝试从列表列创建一个 ggplot。首先我创建列表列，然后创建 ggplot。预期的 ggplot 是一个显示集合交点的ggupset 。我按照 ggupset 示例创建列表列和绘图。但是，尝试geom_bar()从列表列创建一个时，我收到以下警告：Warning message: Computation failed in stat_count():non-numeric argument to mathematical function. 我也无法使用tidy_pathway_member. 下面是一个简单的 reprex 以及 ggupset 示例。

感谢您的时间和帮助！

^{由reprex 包于 2021-01-05 创建(v0.3.0)}

我正在尝试制作一个仅显示特定交叉点的令人不安的情节。我有 6 个不同的峡湾，它们产生了太多的交叉点。我只对绘制其中一些感兴趣：

我已经运行了下一个脚本：

我获得了下一个情节： 峡湾共享的物种

但我只对显示用红色箭头标记的交叉点感兴趣。我希望删除所有其他人。我一直在寻找答案，但没有找到。有没有办法只选择那些交叉点？

谢谢先进

我有四组 A、B、C 和 D，如下所示：

一个upset情节给了我以下结果：

但我对查看特定集合之间的交叉点很感兴趣。A & B, A & C, A & D. 所以，我这样做如下：

但是，A 和 B 之间的共同点是 4，A 和 C 是 4，A 和 D 是 3。为什么上面的混乱图显示错误的数字？

如何正确显示正确的常用号码？我不想要所有集合之间的共同点。

我正在尝试手动订购我的交叉点，UpSetR但我不知道是否可以这样做。order.by只允许freqordegree并且我看不到任何其他可以产生我想要的参数。

左边是我实际拥有的，右边是我想要复制的。

有谁知道这是否可能？谢谢。

我想使用 Upset 图而不是维恩图来显示特定组之间的重叠（总共 20 个）。但是，其中一个组（第 10 号）对我来说是最重要的，我想介绍该特定分数中有多少个唯一值。我想在图表上总共显示约 25-30 个交叉点，但还必须显示第 10 组的唯一性。

我知道功能的存在，sets但我想介绍大约 25-30 个交叉点，如前所述，另外还有这 1 个组。

有任何想法吗 ？

编辑：添加了可重现的示例：

这是一个用于生成绘图的代码：

如果我正确理解了条形图下方的点的概念，它们表示在特定交叉点可以找到多少组，并且单个点给出了该特定点的数字Gr？我对吗 ？

如何强制和算法将几个“有趣”组显示为单个点（显示该组的唯一性）和其他交叉点。

你可以（@krassowski）为你提到的包重写代码吗？

您好，我正在创建扰乱图，无法弄清楚如何绘制数据，如下图所示

我看到了与此类似但不相同的不同情节，任何人都可以建议我一种简单的方法吗，并且根据我上面的图像类型输出，看到一些线程无法重现一些

UpSetR 按颜色组分组

在 UpSetR 中为矩阵点使用调色板

博文

谢谢

我不知道如何在这个 UpSet 图中调整 y 轴标题的位置。由于变量名称的长度，它被移到了左边。我在下面创建了一个可复制的示例：

如何将 Y 轴标题移近右侧的绘图？