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如何使用 Roxygen2 正确记录 S4 类插槽

我想构建一个包含S4 classes使用 R Studio 和roxygen2. roxygen2当我将几个函数引入S4 classes我的包时，我已经使用语法记录了我的所有函数。

现在我意识到没有开箱即用的“@slot”功能。所以我想知道我怎样才能让我的所有文档都为其他功能工作，并像这个线程S4 classes中建议的那样手动记录？

或者换句话说，您会推荐哪个工作流程来构建一个包含老式函数和S4 classes?

编辑：您是否建议将 R Studio 构建工具配置为不创建 .Rd 文件。roxygenize手动然后添加信息？这仍然会导致覆盖类的手动生成的 .Rd 文件......

在带有 S4 类的 R 中，我定义了一个方法来为一个对象分配两个值：

然后按如下方式使用它

但是，这意味着我必须一直写obj为函数的参数。

是否可以在 S4 中定义一个可以在没有对象本身作为参数的情况下使用的方法？

例如：

我非常感谢任何建议！:)

尝试重载+运算符并将Matrix包与稀疏矩阵一起使用时，我得到了一个奇怪的效果。我首先定义了一个非常简单的类，它不使用 Matrix 包但有一个+操作符。然后我对两个稀疏矩阵求和。第一个M+M添加提供了预期的结果，但第二个抛出了错误。这是一个生成错误的非常简单的代码：

第二次添加会引发以下错误：

如果矩阵不是稀疏的，则不会发生错误。+I 定义和+for sparseMatrix之间是否存在一些干扰？我没有+正确定义运算符吗？

谢谢！

版本：

我想制作一个使用 nls.lm （包：minpack.lm）函数的输出对象作为插槽的 S4 类：

现在，如果我想在“构造函数”中调用这个类，我可以做这样的事情（对吗？）：

并且对象“pippo”似乎已正确初始化。

如果我改用此代码，则会出现错误：

似乎如果我想在新的一些插槽中进行初始化，这会导致 S3 类插槽出现问题？

关于如何避免这个问题的任何线索？

谢谢

在R我想将（强制？）从stats::spectrum（类“规范”）返回的对象转换为新的 S4 类。S3 类“规范”本质上是一个混合格式的各种信息列表（我已经评论了屏幕输出）：

现在假设我们为名为“specS4”的类定义了一个新的 S4 生成器，其中插槽名称是“spec”对象中的名称

并从中生成一个新对象：

将每个组件分配psd3到其相应插槽的最佳方法是psd4什么？ 一个复杂的问题是spectrum可能会返回NULL一些（已知的）字段；分配这些值会引发错误checkSlotAssignment（对于给定的表示）。

我有一个痛苦的解决方案是：

哪个有效，即使as.specS4.spec是故意不完整的。

有没有更好的方法来实现什么as.specS4.spec？这个解决方案似乎不稳定。

大家好，

当“lme4”中的“lmer”函数运行时，它会生成一个带有很多插槽的 S4 对象。我对这些插槽之一感兴趣，即模型@X，以及如何产生这个“X”插槽输出。我想尝试为我正在使用的不同模型函数（glmmPQL）重现这个输出，它不会自动产生这个'X'输出（仅供参考'lmer'产生一个'mer'类的对象，插槽'X'是一个模型固定效应的矩阵）。下面的代码显示了我在说什么。

我想弄清楚这个'X'数据是如何产生的？我通过在没有'()'的终端中编写'lmer'的代码来查看它，但我在那里找不到任何东西。我也试过 showMethod('lmer') 但它说 function 'lmer': 。

只是想知道是否有办法获取“X”插槽具体在做什么（或 S4 对象中的任何插槽）的源代码？或者有谁知道如何重现这个？非常感谢您的帮助和时间。

我想继承一个 S4 类并向该子类添加一个特殊方法。该方法应该只适用于子类，它对我的​​应用程序中的任何其他类都没有意义。

随着setGeneric它的工作，但我真的必须定义一个通用函数，尽管它只会与这个对象一起使用吗？注释掉的部分有效，但是没有检查是否使用正确的参数调用函数。这样做的正确方法是什么？提前致谢。

我想创建一个包含不同变量的 data.frame，包括 S4 类。对于像“POSIXlt”（日期）这样的内置类，这很好用：

但是现在我有一个用户定义的类，让我们说一个带有名称和年龄的“Person”类：

但以下失败：

我还尝试使用 [...]-Operator 为 person 类重载

这允许类似向量的行为：

但是以下仍然失败：

也许我必须重载更多运算符才能将用户定义的类放入数据框中？我敢肯定，一定有办法做到这一点，因为 POSIXlt 是一个 S4 类并且它有效！任何使用新 R5 参考类的解决方案也可以！

我不想把我所有的数据都放到 person 类中（你可能会问，为什么“id”不是 person 的成员，我只是不使用数据框）！这个想法是我的 data.frame 代表数据库中的一个表，其中包含许多不同类型的列，例如字符串、数字……还有日期、间隔、地理对象等……而对于我已经拥有的日期一个解决方案（POSIXlt），用于间隔、地理对象等。我可能需要指定我自己的 S4/R5 类。

提前非常感谢。

我正在尝试为我创建的对象定义“c”方法。

就像是

问题是我无法定义 ... 的类，以便正确完成调度。任何想法？

我有一些使用S4对象及其插槽的经验，所以我知道如何访问特定的插槽和子插槽。我想学习的是如何以unlist拆分S3列表的方式“去槽”一个对象。
我的直接目标是让我的一个玩具有一个 S4 对应物，它返回一个对象的元素数量：

（不公平地嘲笑我的代码:-)）。我希望不必编写一些递归例程来一次提取一个插槽来转换它们。

编辑：我知道object.size会返回字节数；不是我在这里追求的。