问题标签 [reticulate]

我正在尝试使用 R 中的网状库。我使用“functions.py”示例对其进行测试：

在 R 工作室（版本 3.5.2）中，这就是我所拥有的：

但是，这会返回错误：

所以我被困在这里。如果有帮助，我还将分享我的 Python 是 64 位和版本 3.6.5。有人知道该怎么做吗？

谢谢

我正在尝试在 Rmarkdown 文档中从我创建的 virtualenv 中导入一些 python 模块。我是 python 新手，所以我将逐步完成我的设置步骤。

(1) 我创建了一个r-reticulate在默认根位置调用的新 virtualevn，~/.virtualenvs使用

(2) 激活 env 后，我使用pip. 以下是已安装软件包的列表：

(3) 现在到我的 R 代码。我只有 2 个代码块。首先：

第二个：

第一个代码卡盘运行没有错误，但第二个返回：

ImportError: No module named matplotlib

r-reticulate通过激活它并通过终端导入这些模块，我已经验证了环境确实有效。

我可以使用 reticulate 从 R 的向量、列表、矩阵转换为 python 的相应对象。

但是，有没有办法将任何 R 对象转换为 python 的 set 对象？

我无法让reticulateR 中的包正常工作。

LIBPYTHON无论我通过哪个版本的 Python 加载module load，或者我告诉使用哪个版本，它都找不到它需要的共享文件reticulate，直接在 R 中。

我正在研究大学的集群，它安装了多个版本的 Python，并通过模块加载。

谢谢您的帮助。

a) 使用 2.7.9 版本（默认版本来自module load CBC）：

b) 通过在 R 中指定来使用 2.7.10 版reticulate：

module load CBC python/2.7.10c)在开始 R / 加载之前运行，使用 2.7.10 版本reticulate：

共享库 ( .so) 文件似乎确实存在，至少对于 2.7.10 而言，所以我完全不知道接下来要尝试什么：

我有一个工作流程，我使用 python 进行信号处理，使用 R 进行分析和绘图。从 python 部分，我得到一个大数据框（11165 个变量的 100 个观察值），我使用它保存并在 R 中导入它feather。但是，在 RStudio 中使用如此大的 df 在绘图 ( ggplot2) 或进行数据整理时非常慢。

我是否应该使用不同的格式（即列表列表？）以获得更有效的内存管理？

我有一个用 Python 3.7 编写的函数，它返回一个 Pandas DataFrame。例子：

这个 Python 文件可能被称为my_dataframe.py

然后在 R 中，我使用 Reticulate 库和 Tidyverse 将 Pandas DataFrame 插入到 Tibble 中。

执行此操作的代码app.R如下所示：

返回以下错误：

Observations: 3 Error in py_call_impl(callable, dots$args, dots$keywords) : IndexError: index 3 is out of bounds for axis 0 with size 3

一些事实：我在 GitHub 中发现了这个问题：https ://github.com/rstudio/reticulate/issues/101 ，我认为这可能会解决。更新到最新版本的网状使用 devtools::install_github("rstudio/reticulate")

会话信息：

为了检查 NumPy 是否有效，我可以更改my_dataframe.py（并适当地更改 app.R）并导入 NumPy 数组......这不会导致任何问题：

我的问题是：如何将 Pandas DataFrame 带入任何 R 等效项？

我正在使用 R 在 Shiny 中创建一个应用程序。我在 python 中有一个模型，我在应用程序中使用它，所以我使用reticulate包来运行它，并在与应用程序相同的文件夹中使用虚拟环境来访问python3。它在本地工作得很好，但是一旦我部署它，我就会在日志中看到一个错误，上面写着

venv/bin/python：权限被拒绝

（venv 是我的虚拟环境）。

我尝试添加一个.Rprofile包含source venv/bin/activate. 此外，如果有帮助，Python 组件将使用该keras包。我还将所有必要的包下载到我的虚拟环境中。

我也运行use_python("venv/bin/python", required = TRUE)，而不是在reticulate::use_virtualenv("venv", required = TRUE)本地也可以运行，但是一旦我部署它，我就会遇到上述相同的错误。

我正在使用 R 中的 Keras 进行图像识别。我正在尝试将我的图像转换为一维矩阵。这是我的代码：

最后一行导致以下错误消息：

initialize_python(required_module, use_environment) 中的错误：您当前的架构是 64 位，但是这个版本的 Python 是为 32 位编译的。

我该如何进行？

我正在尝试使用reticulate libraryin导入一个模块R，但是该库无法导入，因为它有一个连字符。具体来说，就是bitmex-ws模块。py_install("bitmex-ws")工作没问题，但错误是尝试导入时，我收到一个module not found error.

我正在尝试通过使用 RStudio Server 的同事来获得一堆我的 python。我的印象是 python 用户可以使用该reticulate包来管理他们的 conda 环境。虽然包中有乐观命名的命令，但不幸的是，它们实际上并没有像它们看起来那样做。从这个 github issue 看来，从reticulatepython 用户的角度来看，RStudio Server 实际上完全没用：他们无法从 R 管理他们的 conda 环境。

https://github.com/rstudio/reticulate/issues/292

有没有人找到一种解决方法，允许 RStudio Server 会话的用户LD_LIBRARY_PATH仅针对他们的会话或项目进行适当的修改？例如，可以激活特定的 conda 环境吗？

我正在使用开源 RStudio Server 1.2 预览版：

我创建了以下 conda 环境：

然后我在 R 中运行以下代码：

当我尝试print(1+1)在 python 块中进行评估时，我看到以下错误：