问题标签 [openbugs]
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r - 使用 wine 和 openBUGS 的数据文件似乎太大了
我最近开始尝试使用 OpenBUGS 和 R 进行一些贝叶斯建模R2OpenBUGS
。
我关注了 David Eagles 的安装 wine 和 OpenBUGS 的一个很好的链接,那里发布的学校示例运行良好。
然后,我尝试运行我拥有的一些代码,并在the model is syntactically correct
告诉我数据未正确加载后不断收到错误消息。
经过几天的故障排除后,似乎当数据文件超过一定长度时,最高位(您通常list
在 OpenBUGS 中突出显示以加载数据)丢失并且 OpenBUGS 无法加载数据。
我的 OpenBUGS 程序的屏幕截图,其中包含已加载的列表部分已被切断的数据
这张图片显示,在我的 data.txt 文件的顶部,不再有一个list{
基本上停止了我运行模型的所有尝试。
为了确认这一点,我运行了一个简单线性回归的示例,其中我将点数设置为 1000,然后设置为 100:
该模型运行良好,linedata <- list(Y = c(1:100), x = c(1:100), N = 100, xbar = 3)
但在加载数据阶段时崩溃了linedata <- list(Y = c(1:1000), x = c(1:1000), N = 1000, xbar = 3)
。
我已经用谷歌搜索了 wine 和 OpenBUGS 的数据文件大小限制,但没有发现任何有用的信息。
任何人有任何关于尝试什么/从哪里开始/以前体验过的建议?
openbugs - OpenBUGS:初始化模型
我在 OpenBUGS 中初始化以下模型时遇到问题
这是我的数据
这是我姓名缩写的列表
模型检查,数据加载和编译步骤都可以。加载首字母时,OpenBUGS 表示已加载初始值,但链包含未初始化的变量。然后我也尝试初始化 theta0,但问题仍然存在。有人可以帮我解决这个问题吗?谢谢哈立德
r - R2OpenBUGS - 矩阵、列表和向量的几个问题
我是 R2OpenBUGS 的新手,非常神秘的错误非常令人沮丧。
我尝试运行一个非常简单的模型。我之前曾成功运行过类似的模型。我的问题是因为我有一个二维数组(矩阵)吗?
我尝试简化模型但没有成功。
以下是错误:
这是我使用的代码
数据文件:
bayesian - 使用 JAGS 的纵向分层贝叶斯回归
我对 JAGS/OpenBUGS 完全陌生,所以在指定我的模型时,我真的很感激朝着正确的方向前进。我正在使用由 103 个国家在 15 年内编制的不平衡纵向数据,在这种情况下选择 12 年。DV 是基尼系数,它不应该被建模为 log-Normal,而可能是 Beta,尽管现在的重点是了解如何在 JAGS 中编译模型。我暂时使用的是固定效应模型。
我正在运行的数据和代码:
而且我不断收到此运行时错误:
任何关于我应该做什么不同的建议将不胜感激!我知道有 3 个“技巧”可以应用于不平衡数据,但我仍然对所有这些工作原理感到有些困惑,即 JAGS 如何读取数据输入。
干杯
Ĵ
bayesian - OpenBugs 错误:预期集合运算符 c 错误 pos 7515
我正在尝试使用 R2OpenBUGS 库从 R 评估分层模型。我已经看过类似问题的答案,但似乎没有任何效果。如果有人可以提供帮助,我将非常高兴。
模型如下。
在日志中我得到:
当我尝试将先验均值向量priora[]和priord[]赋给a[i]和d[i]时,问题就开始了。如果我将这些手段设置为“0”,则代码有效。
openbugs - 当 p 未知时,如何在 R2OpenBUGS 中进行 Xb 计算
我想计算 x1b1+x2b2+......+xpbp。但是,p不知道,我不能提前写下来。所以我想做以下事情。但在 BUGS 中,它表示多个定义错误。
有没有办法在错误模型中完成它?
bayesian - 数组索引不是 OpenBUGS 中的整数错误
我正在尝试在 OpenBUGS 中运行马尔可夫模型来估计过渡概率。但我收到一个错误“数组索引不是整数”这是我的模型代码:
这是我的 R 代码数据:
谁能帮我解决错误?
bayesian - 未定义变量 TT:OpenBUGS 中的错误
我正在尝试在 OpenBUGS 中运行模型。但我收到错误“未定义变量 TT”。这是我的错误代码:
这是我运行 BUGS 代码的数据和 R 代码:
任何人都可以帮助解决这个问题吗?提前致谢。
bayesian - modelCompile 函数在 BRugs 中永远运行(Open Bugs)
我正在使用 R 中的 BRugs 包运行模型以进行贝叶斯推理。该模型在语法上是正确的并且数据加载,但是 modelCompile 函数永远运行,我在 15 小时后停止了它,但我不知道问题可能是什么。
数据文件很大,但我可以根据要求提供...
bayesian - 在 WinBUGS/OpenBUGS 中明确指定 logit 函数
我是 OpenBUGS 的新手,在使用 logit() 函数拟合模型时遇到了一些问题。
阅读周围我发现一个可能的解决方案是明确指定 logit 函数而不使用 WinBUGS 自己的 logit 函数:
在更复杂的模型中,我们在使用 WinBUGS 自己的 logit 函数时经常遇到问题,例如实现收敛(实际上,即使使用相当简单的模型也可能出现问题。)。因此,通常最好通过 logit.p[i] <- log(p[i] / (1 – p[i])), p[i] <- exp(logit.p[i ]) / (1 + exp(logit.p[i])) 或 p[i] <- 1 / (1 + exp(- logit.p[i]))。
(更多信息在这里http://www.mbr-pwrc.usgs.gov/software/kerybook/AppendixA_list_of_WinBUGS_tricks.pdf第 14 点。)。
问题是我不明白该怎么做,假设我使用 WinBUGS 集成 logit 函数的原始似然函数是:
我如何明确地写出来?
非常感谢。
文森佐