问题标签 [openbugs]

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distribution - 在 OpenBUGS 中的 Wishart Prior

我目前正在研究有关二元正态分布的 OpenBUGS 代码。该分布使用 Wishart 先验来提高精度,在更新模型时我遇到了一些麻烦。

我的模型将加载,它会使用我的数据进行编译。但是,在更新时,我收到一条错误消息,上面写着“TRAP 126(尚未实现)”,它与 tau.org[1,1] 有关。

我认为问题出在 Wishart 之前,但我不知道如何解决它。我尝试了一个更简单的模型,之前的更新没有问题,我意识到问题可能是由 eps_theta 引起的。

我已经检查了大多数来源,但错误仍然存​​在。如果有人能对这个问题有所了解,那就太好了。提前致谢!

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r - 通过从 R 导出数据来编辑现有的 .txt 文件

我正在通过 R 中的BRugs包为OpenBUGS 中的空间建模创建一些模拟疾病计数数据。

我有一个现有.txt文件,其中包含运行模型所需的大部分信息BRugs。下面是这个文本文件的样子:

我想要完成的是将O上述.txt文件中的向量替换为m我在 R 中生成的模拟疾病计数向量。这样,我可以使用m新的 .txt 文件BRugs来运行我的模型。

例如,假设这个新的疾病计数向量被称为O_sim

我怎么能去创建一个新的 .txt 文件,现在看起来像这样:

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winbugs - openbugs 生成初始值错误

我有一个可以在 winbugs 中运行的模型,但是即使使用相同的代码和相同的数据,在加载和生成初始值时也会在 openbugs 中出现错误。

在 winbugs 和 openbugs 中加载初始值时,我收到“链包含未初始化的变量”的消息。然后我可以在 winbugs 中成功生成初始值,但在 openbugs 中我收到错误“GraphBinoimial 类型的节点 Ny[2] 的错误。节点第二个参数必须是整数值。” 我对 Ny 的初始值为 Ny=c(4,4,4,4,4,4,4,4)。这些对我来说似乎是整数。加上这些相同的初始值在 winbugs 中被接受。

你可能会问自己,如果我可以让它在 winbugs 中工作,我为什么要让它在 openbugs 中工作?我最感兴趣的是通过 R 运行整个过程。我一直在尝试使用 R2Winbugs 或 Brugs (openbugs) 来执行此操作,但是我在初始化时遇到了这两个错误,甚至导致 R 崩溃(我从未见过 r -以前炸弹,但现在我可以让它反复发生)。我认为这可能与我无法在 openbugs 中手动运行数据的原因相同。

能够通过 R 运行它将大大减少与 win/openbugs 交互的挫败感,尤其是在运行一系列具有不同数据的模型时。

提前感谢您的洞察力。

lg

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r - 使用 OpenBUGS 的“预期右括号错误位置”

我正在尝试使用 R 中的“R2OpenBUGS”包运行简单的线性回归分析。当我运行“bugs”命令时,我遇到了错误。

在命令行中添加“debug = T”后,我在 OpenBUGS 中收到此错误:

预期的右括号错误 pos 130

这是我在 R 中的代码:

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android - 更新/修复 InputChannel 未初始化 android 打开的错误?

以下 Android 打开错误的任何更新,

我看到了这个帖子 ,可能有人会在 StackOverflow 上问同样的问题。但没有任何修复。这个错误是正在处理中还是仍然存在?

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r - R2openbugs bugs() winepath 错误:没有这样的文件或目录

我的 mac 系统是 OS X El Capitan 10.11.6。我使用 Winebottler(1.8.6 版)和 Wine 安装了 OpenBUG。

当我尝试使用 R 调用 OpenBUGS 时,出现以下错误:

这是我的 R 代码:#Load the OpenBUGS Package - 确保 XQuartz 正在运行库(R2OpenBUGS)

我认为问题可能在于我如何指定 Wine 和 winepath 工作目录。

有人可以给我一些建议吗?

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openbugs - 使用 inprod() 总结线性预测器的问题

尝试总结我的加法预测器时遇到问题:

通过使用 inprod()。这是我认为应该是等价的:

虽然模型编译并似乎可以工作,但它会永远保持更新。它已经运行了几个小时并且没有结束,而第一种方法在几分钟内结束。

这些是先验,以防万一:

为了以防万一,我使用 R2OpenBUGS 从 R 调用 OpenBUGS。

非常感谢你花时间陪伴!

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mcmc - 为先验定义约束时,JAGS 中出现错误消息尝试重新定义节点

我正在尝试从先前的分布中进行采样并将某些总和和差异限制为大于 0,但是,当我运行通常在 OpenBugs/WinBugs 中运行的此代码时,我收到以下错误“尝试重新定义节点”。我想知道是否有任何可能的方法来定义我的约束以防止发生此错误。任何帮助将不胜感激。

谢谢

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r - 将数据从 R 加载到 OpenBUGS 时出现问题?

我正在尝试在 R 中构建一个数据集,然后将其加载到 OpenBUGS 中以执行一些贝叶斯分析,但在加载数据时遇到了困难。

这是我的 R 代码:

这一切都很好。然后我尝试将其加载到 OpenBUGS 中,但是当我在选择文件后单击“加载数据”时,我收到一条错误消息:此时“预期为数字或 NA”:

n= c (7.4...)

我对此感到困惑,为什么它会在那里期待一个数字?我需要在 R 中创建一个向量来存储信息“m”,但它告诉我这是 OpenBUGS 中的错误(但不是y 向量的错误,它接受 y= c (...) 很好)。

有人可以帮忙吗?

谢谢!

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r - 无法通过 R 中的锯齿对数据执行贝叶斯分析

这是我的代码

一切正常,直到我尝试编译输出。我收到一个错误:

我相信这与我的 OpenBugs 格式的数据有关:

但我将其转换为 R 格式:

我是否错误地转换了数据?数据哪里出错了?一切正常,直到我尝试编译输出。我收到一条错误消息:jags.model 中的错误(model.file,data = data,inits = init.values,n.chains = n.chains,:节点 y[1] 中的错误节点与父节点不一致