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我需要计算图上每个节点的度数、接近性和中介中心性。我目前在cy.ready()事件发生后的每个节点上使用 Cytoscape.js 中内置的功能。但是，由于图表非常大（250 多个节点，650 多个连接），因此计算时间太长。任何人都可以提出更有效的方法吗？

我有一个包含村庄名称、市场、教堂和医院的数据集。市场、教堂和医院没有直接命名；相反，它们是按村庄列出的，因此它们可以直接与村庄名称相关联。坐标仅按村庄列出。我需要在 SAS 中重新组织数据集，以便村庄的 GPS 坐标与各自的市场、教堂和医院相关联。

这是我正在尝试做的更好的可视化：

转换此数据集：

对于看起来像这样的东西，新创建的市场和教堂坐标列（基于原始村庄坐标）：

我知道这里的格式有点奇怪，所以这里有一些这些示例表的图像：

原表：

所需表：

感谢您对此有所了解！

我正在使用 R 中 igraph 中的 cluster_infomap 函数来检测具有约 19,000 条边的无向、未加权网络中的社区，但每次运行该函数时，我都会得到不同数量的社区。这是我正在使用的代码：

在我执行的测试中，最后一行代码的结果范围为 805-837。我尝试使用 set.seed() 以防它是随机数生成的问题，但这并不能解决问题。

我的问题是（1）为什么我每次都会得到不同的社区，以及（2）有没有办法让它稳定？

谢谢！

我想创建一个邻接矩阵，用于社交网络分析（可能与 igraph 中的 graph_from_adjacency_matrix ）来自结构如下（但更大）的 csv：

对于网络分析，节点将是名称变量，节点将根据它们一起投票的频率（1 或 0）连接。就像是：

看起来很简单，但我无法成功地将这个数据框转换为可用于创建 igraph 图形对象的邻接矩阵。as.matrix 和 data.matrix 确实将其转换为矩阵，但不是邻接矩阵，也不是保留“名称”变量中的字符的矩阵。我的矩阵代数不强，所以我知道我可能遗漏了一些明显的东西，但我知道的不够多，不知道它是什么。我对其他解决方案持开放态度，这些解决方案能让我实现网络分析的最终目标。

我在 Vincent Zoonekynd 编写的两个函数的帮助下创建了下图（您可以在此处找到它们）（在帖子末尾找到我的代码）。

为了能够解释邻域图和参数“k”是什么，等距特征映射使用的邻域图和参数“k”是什么。“k”指定每个点直接连接到多少个点。它们的距离只是彼此之间的欧几里得距离。任何点与其 (k + 1) 最近点（或任何更远的点）之间的距离称为“测地线”，是到达那里所需的所有边缘长度的最小总和。这有时比欧几里得距离长得多。我图中的 A 点和 B 点就是这种情况。

现在我想添加一条黑线，显示从 A 点到 B 点的测地线距离。我知道命令segments()，这可能是添加线的最佳选择，并且我知道找到最短路径的一种算法（测地线距离) 是 Dijkstra 的算法，它在包中实现igraph。但是，我既不能igraph解释我的图表，也不能自己找出需要传递的点（顶点）（及其坐标）。

顺便说一下，如果 k = 18，即如果每个点都直接连接到最近的 18 个点，那么 A 和 B 之间的测地线距离将只是欧几里得距离。

我正在尝试从矩阵构建网络，以便我可以绘制整个网络或仅绘制顶点的子集。我一直在使用 R 中的 Network 包并创建了一个玩具网络，我在其中向顶点添加了两个属性：“年份”和“主题”。然后我绘制网络，使主题颜色不同。

我想做的是绘制这个相同的网络，但仅用于属性“年”的值为“2006”的顶点。欢迎大家提出意见

我正在研究 Gephi 中组织结构的可视化。我有一张个人图表，通过他们过去是否一起工作来连接。绘制个人图表看起来不错，但我想根据分类属性（部门；字符串）组合节点（个人）。新图——或者至少是一个可视化图——将为每个部门都有一个节点，最好是具有与组成它的人数成正比的数字权重。

我可以在导入之前生成图形文件的脚本中执行此操作。但大约一年前，我完全在 Gephi 中完成了这项工作。要么功能被删除（如饼图！），要么我只是忘记了（更有可能）。

我正在使用 Gephi 0.9.1。任何帮助，非常感谢。

我需要绘制大脑网络的社区结构。与所附图像类似。我正在使用图形工具 python 工具箱。任何帮助创建这个将不胜感激。

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我正在尝试使用带有rgrass7库的 R 3.3.2 在 GRASS 7.2.0 中处理多个操作。

我的主要目标是使用 GRASS 网络工具计算多个位置之间的道路网络距离。

我的问题是我的数据库中的位置是由个人组织的，我想计算嵌套在个人中的位置的网络距离，而不是数据库中的所有位置。

这是我的数据结构的示例

我能够在 GRASS 中编写这个脚本来计算一个 ID 的所有距离。我省略了加载位置 ( my_locations) 和道路 ( street_vector) 图层并设置区域的脚本开头。

接下来，我使用该rgrass7包执行GRASS7.2.0。来自 R 3.3.2 的命令。目标是使用一个for循环来生成我所有的网络距离表和一个脚本。

这是我的代码：

}

但是当我execGRASS使用 GRASS 执行函数时v.net，出现以下错误：

就像 doGRASS 不将 thresh 识别为有效v.net参数一样。我有点卡在这里，所以如果有人知道我做错了什么，那真的很有帮助。

我正在尝试运行网络分析，并且想知道是否有办法将服务区设施作为多边形而不是点？

我已经尝试过功能点工具，但这会创建一个不占多边形整个区域的点。

是否有一种工具可以创建多个点来勾勒出多边形的轮廓？