问题标签 [maxent]

我正在尝试实现 Maxent 分类器，但在使用 iis 算法时遇到问题。以下代码适用于 gis 算法。

我正在使用 WIN32 机器，上面的代码来自 Jacob Perkins 的 NLTK 书。它抛出的警告是

然后电脑挂了。所以我必须停止执行。

.

我有一系列二进制栅格图层（ascii 文件），显示欧洲和非洲某个物种的存在/不存在。该文件基于未投影的纬度/经度 (WGS84) 数据。我的目标是使用 R 计算存在区域（我无权访问 ArcGIS）。

我知道 raster 包有计算面积的功能，但我担心这对于未投影的数据不准确。我也看过 raster 包中的 cellStats 函数，可以用它来“求和”占用的单元格数，但我觉得这有同样的问题。

有谁知道准确计算存在区域的方法，考虑地球曲率？

谢谢！

我希望我来对了论坛。我是一名生态学家，使用 maxent（版本 3.3.3，http://www.cs.princeton.edu/~schapire/maxent/) R 中的函数，通过 dismo 包。我使用了参数“replicates = 5”，它告诉 maxent 进行 5 折交叉验证。当直接从 maxent.jar 文件（maxent 软件）运行 maxent 时，将生成一个带有统计信息的 html 文件，包括预测图。在 R 中，也制作了一个 html 文件，但之后必须使用 r 中 dismo 包中的函数“predict”提取预测图。当我这样做时，由于 5 折交叉验证设置，我得到了 5 张地图。但是，（这就是问题所在）我只想要一张输出图，一张“摘要”预测图。我认为这是可能的，尽管我不知道 maxent 是如何计算它的。maxent 教程（见上面的链接）说：

“...您可能希望通过关闭“写入输出网格”选项来避免占用磁盘空间，该选项将禁止为复制运行写入输出网格，以便您仅获得汇总统计信息网格（avg、stderr 等.)。”

在此论坛https://groups.google.com/forum/#!topic/maxent/yRBlvZ1_9rQ中可以找到可以放入 R 的参数列表。

我尝试在 maxent 函数本身和 predict 函数中都使用参数“outputgrids = FALSE”，但它不起作用。即使我在 R 中没有任何错误，我仍然得到 5 张地图。

所以我的问题是：我如何获得一个“摘要”预测图，而不是交叉验证产生的五个预测图？

我希望有人可以帮助我，我真的很困惑，在互联网上的任何地方都没有找到任何答案。甚至没有关于这个的讨论。希望我的问题很清楚。这是我使用的 R 脚本：

model1<-maxent(x=predvars, p=presence_points, a=target_group_absence, path="//home//...//model1", args=c("replicates=5", "outputgrids=FALSE"))

model1map<-predict(model1, predvars, filename="//home//...//model1map.tif", outputgrids=FALSE)

最好的问候，克里斯汀

希望这里有人可以帮助我，或者知道我可以在哪里问。

我在 R（dismo 包）中使用 maxent（版本 3.3.3）制作了一个分布模型，然后制作了一张限制因素图，如 Elith et 的附录中所述。人。( http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.2041-210X.2010.00036.x/full )，通过windows cmd窗口使用maxent软件。这些说明运行良好，我现在将限制因素映射到一个名为 lf_map.asc（约 10 GB）的文件中。为了在 ArcGis 中打开地图，我将 asc 文件作为栅格导入到 R 中，并使用以下 R 脚本将其保存为 tif 文件：

lf_map<- raster("//home//...//lf_map.asc")

writeRaster(lf_map,"//home//...//lf_map.tif")

当我在 ArcGis 中打开它时，模型中的不同变量（因子）在地图中的名称为 0-4（我在模型中有 5 个变量），但现在我不知道哪些变量属于哪个数字。我也尝试在 ArcGis 中使用 ASCII 到栅格（转换）工具，但名称仍然是 0 到 4，而不是变量的名称。有谁知道如何找出这个？

此致

克里斯汀

我确实浏览了下面链接的可用文档。但是事情仍然不清楚，我应该如何进行？我遵循了正确的输入训练格式，但出现如下错误。

cmd命令：

错误：

参考： http: //opennlp.apache.org/documentation/1.5.3/manual/opennlp.html#tools.chunker

我正在尝试使用 stanford maxent 分类使用 4 个特征对数据进行分类，第 5 个是类。当我提供测试数据时，准确率是 99%，这几乎是不可能的。

当我检查预测的标签时，它们与数据本身完全相同。但后来我更改了数据中的标签，预测的标签也发生了变化。我想使用分类器模型的预测不应该考虑数据中给出的标签。请建议如何在看不见的数据上使用 maxent 模型。

我标记了一个简单的句子，这是我的代码：

这是输出：

编辑属性文件后，它根本没有任何效果。例如，我已将标签分隔符更改为 ( * )，但在输出中它仍然打印 ( _ )。

我如何在 Eclipse 中使用模型配置文件？

我正在阅读 jurafsky 的 NLP 书，其中提到为了训练 MaxEnt，我们需要调整权重以防止过度拟合。但我不明白为什么会这样。如果我们不使用正则化，谁能解释在训练过程中过度拟合是如何发生的？

在 NLTK 中，MaxEnt 分类器报告多个准确度指标，如下面的屏幕截图所示。第一组是每次迭代的准确度。第二个打印在屏幕截图的底部，通过调用来报告nltk.classify.accuracy(maxent, test_set)，其中maxent变量已正确初始化。这些准确度中的哪一个是可报告的，即在结果中显示训练模型的准确度？他们之间有什么区别？

我在包 biomod2 中从 R 运行 maxent，并出现以下错误。我不是技术背景，也不知道为什么会发生这个错误。是内存问题还是有人说没有设置java路径。但我按照说明将 maxent 设置为在 R 中运行，还下载了 Java 平台标准版开发工具包并为其设置路径，如本 pdf 中所述：http: //modata.ceoe.udel.edu/dev/dhaulsee/ class_rcode/r_pkgmanuals/MAXENT4R_directions.pdf

如果您能帮助我理解这个问题以及任何解决方案，我将不胜感激。

非常感谢