问题标签 [maxent]

我在 dismo 包中使用 Maxent 函数来创建一些物种分布模型。

通常这是有效的：

但是当我用复制品创建这个模型时

评估功能不起作用。它给出了一个错误

任何想法为什么？或如何解决？

这是可重现的代码：

当我将 Maxent 运行到 biomod2 时，我收到了这个错误：

另外：警告信息：

我已经按照 http://modata.ceoe.udel.edu/dev/dhaulsee/class_rcode/r_pkgmanuals/MAXENT4R_directions.pdf的步骤 添加了java路径，maxent.jar目录被复制到工作目录中，没有空格在路径中。

当我输入

我得到 TRUE 值。

这些是我的选择：

我知道 Apache OpenNLP 将 MaxEnt 模型用于其 NER 标记器。但是，Apache OpenNLP 在运行其命名实体识别 (NER) 模型时（默认情况下）使用了哪些功能？以及我们如何在 OpenNLP（Java 实现）中合并/自定义新功能？

我正在尝试更新基线代码nltk.classify.rte_classify以添加更多功能，以提高模型的准确性。它使用 MaxentClassifier。我的问题是，每次执行代码时，我都会得到不同的准确度结果（在代码之后提到。）。通常，对于 scikit-learn 分类器，我们有参数'random_state'来获得可重现的结果。在我的情况下，我想对 MaxentClassifier 做同样的事情。我检查了他们的文档，但我找不到任何与random_statescikit 分类器类似的东西。

• 第一次：准确度：0.5929
• 第二次：精度：0.5908
• 第三次：精度：0.5854
• 第 4 次：准确度：0.5913

测试集的准确度变化可能看起来更小，但在我自己的具有大量特征的数据集中，差异有时会达到 10%。

运行时出现此错误；

其中“pred”是栅格堆栈，“occ”是 lat/lon 的 csv 文件，“bias”是栅格。没有“args”，模型运行良好。该错误表明它认为我正在使用 SWD (species-with-data) 文件，但我没有。已检查每个输入文件上的 str()。我已经更新了所有内容（R、RStudio、dismo、maxent.jar）。在 Windows 10 上运行。我看到其他人在 Maxent 用户组上遇到过这个问题，但没有解决方案。任何帮助表示赞赏。谢谢。

我正在使用包biomod2构建物种分布模型/栖息地适宜性模型。

当直接使用 Java 应用程序时，Maxent 允许用户选择四种输出格式之一（见标题）。但是，当包biomod2（例如BIOMOD_Modeling）中的函数调用 Maxent 时，似乎没有指定输出格式的选项。也没有任何迹象表明选择了哪一个。我认为 cloglog 是默认设置，所以很可能是这样，但我想确定一下。

本教程有一些图像显示了一些输出之间的差异：https ://biodiversityinformatics.amnh.org/open_source/maxent/Maxent_tutorial2017.pdf

谢谢你的帮助！

我有 8 个用于 maxent 分类器的特征，并且想知道每个权重，因为我需要了解每个特征的重要性。

我使用最大熵是因为计算两个句子之间的结构相似性。所以我使用特征作为相同语素的计数。这就是特征值不是 0 或 1 的原因。

当我运行此代码时：

它打印 64 个列表元素。我认为它只显示打印 8 个元素（重量），但它返回如下：

我想知道每个元素的含义以及如何获得每个元素的权重。

我测试了一个从 uI 提供的新数据，所以我使用了与训练模型具有相同列名的 new.csv 文件。

这有什么问题？

我在这一行得到错误classify_models(container2,maxent_model)

java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space issolved by increase the Xmx3G, but now I get "Error occurred during initialization of VM. could not reserved enough space for object heap. 我该怎么办？

我正在尝试执行此操作

bin\mallet train-classifier --trainer MaxEnt --input train.mallet --output-classifier train.classifier

我的 train.csv 大约 6MB，我通过使用将其更改为 train.mallet 文件（15MB）

bin\mallet 导入文件 --input train.csv --output train.mallet --keep-sequence --remove-stopwords

PS 我已经在 bin/mallet 和 mallet.bash 文件中进行了更改以进行这些更改 Xmx3G

我在 R 中使用 maxent 来预测具有两种气候变化情景的特定物种的分布。我正在使用一个简单的代码来了解 ROC/AUC，但我想要一个代码来绘制标准偏差线（标准误差）和图中的 ROC。我提到代码是为了了解我的工作。

me = maxent( mask1, p=train_p, a=train_a, factors=('Soil.type'))

e = evaluate(test_p,test_a, me, mask1)

e

pred_me = predict(me, mask1, ext=ext, progress='')

plot(e,'ROC')