问题标签 [graphml]

我有一个 prefuse 应用程序，它加载 GraphML 文件，其中节点具有“颜色”字符串属性。IE。

我想允许指定一系列预定义的颜色，并且我不想强制创建 GraphML 的程序使用所有颜色。

我认为这将是一项简单的任务（也许是？），但 prefuse 似乎动不动就和我作对。我提出了两个部分解决方案，但它们都有自己的问题。我的第一种方法是手动添加一个与“颜色”字符串相关的新整数属性，如下所示：

然后，您可以使用 prefuse 的默认颜色管理器将这些整数链接到数组索引。

这种方法的最大问题（除此之外不优雅）是当用户指定的唯一颜色少于三种时它会失败。如果指定了两种颜色，prefuse 使用颜色数组的第一个和最后一个元素。如果有的话，第一个。嗯。

我的另一个解决方案是手动设置每个节点的颜色。

这适用于任意数量的颜色，但随机混乱。我认为 prefuse 在自己的线程上处理这些方法，由于某种原因，这些方法运行缓慢。对于较小的网络，我可以设置一个固定的等待时间（我还没有找到要使用的 Thread.join() 方法）。但是，这对于大型网络来说非常失败（阅读：我的电脑崩溃）。

所以你有它。对本应是微不足道的任务的不必要的大量时间投入。有人设法做到这一点吗？有没有简单的方法？请告诉我我想太多了。

我有以下 GraphML 文件“mygraph.gml”，我想用一个简单的 python 脚本对其进行解析：

这表示一个简单的图，其中包含 2 个节点“node0”、“node1”和它们之间的一条边

这表示一个具有两个节点 n0 和 n1 的图，它们之间有一条权重为 1 的边。我想用python解析这个结构。

我在 lxml 的帮助下写了一个脚本（我需要使用它，因为数据集比这个简单的例子大得多，超过 10^5 个节点，python minidom 太慢了）

该脚本正确获取节点和边，以便我可以简单地迭代它们

或类似的边缘：

但我真的不明白如何获取边缘或节点的“数据”标签以打印边缘权重和节点标签“名称”。

这对我不起作用：

最后一个列表总是空的。为什么？我错过了一些东西，但不明白是什么。

你认为我可以调整 GraphML 的 xml 输出吗？

在GraphML wiki中，标签似乎是固定的：

我看到您可以更改标签属性。您认为我可以将标签本身自定义为类似的东西<car></car>吗？

我正在拼命寻找一种解决方案来创建一个漂亮的二叉树图。不完整的节点具有可区分的边缘（如果有的话）至关重要。

我无法使用 .dot 产生所需的结果，因为我不知道如何对节点进行排序。我不介意，将文件导入 yEd 或其他编辑器。但是，我希望能够用很少的语法非常轻松地生成数据。

我的目标是一种工具，它可以从极简数据（例如（A（B1 C1 C2）B2））生成例如.graphml 格式，其中A 是根标签，B1 是根的左孩子和另外两个孩子。与 .dot 或 .tgf 类似的复杂性当然是可以容忍的，但我想避免自己编写编译器来生成 .graphml。

任何想法表示赞赏。

马库斯·R。

我非常肤浅地使用networkx。将图形写入文件很容易，例如 graphml，但是如何在不打扰文件系统的情况下将其保存到字符串中呢？

它的文档说这是可能的。

我是 Prefuse 的新手。我在使用 GraphML Reader 读取 polbooks.gml 文件时遇到问题。它可以成功读取 xml 文件但不能读取 gml 文件。请提出如何在 Prefuse 中读取 gml 文件的解决方案。下面是我的 GraphML Reader 代码

因此，我在我的一个脚本中切换了 graphML 导入方法，但在清理导入的数据时遇到了麻烦。目前，graphML 数据如下所示：

这是我的代码：

当我去控制台并请求一个节点（someVar [i]）时，我得到这样的东西：

所以我至少拥有所有必要的数据......很好。但我想从每个数据点制作键：值对。所以本质上， someVar[i][0] 应该是这样的：

如何使用带有 d3.js 的 graphml 文件？[我想画一个力导向图]

• 将文件转换为 .json 更简单吗？如何 ？我一直找不到转换器（我找到了一个python转换器，但我不是python用户）

• 是否可以直接使用graphml文件？可能与 d3.xml 一起使用？

注意：graphml 看起来像这样

……

我想制作下面的 graphml(xml) 文件。

但是我的代码制作了以下文件

Graphml 程序不支持输出文件，因为该文件在<y:ShapeNode xmlns:y="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns">.

我想删除部分“xmlns:y="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns"

如何擦除部分？我应该怎么办？我的源代码如下

我将数据导出为 graphML 格式，并希望通过 gremlin 的 graphML.import() 函数将它们导入 neo4j。我需要创建索引来索引我所有的导入数据。甚至可以使用graphML格式吗？

我的导出 xml 如下所示：