问题标签 [graphml]

我正在使用 neo4j 2.0 存储大量数据。使用 ruby​​ 脚本生成大量数据并保存在 graphml 文件中，然后使用 Gremlin 导入 neo4j。

在 neo4j 2.0 中，我想利用节点上的标签新的很酷的支持。是否可以通过这种方式指定节点应该具有哪些标签？或者我真的必须事后对所有节点进行查询，设置它们的标签。

谢谢

我正在更新一种将图形从 .dot 导出为 .graphml 格式的方法。

以前，颜色和标签是在 FormatEdge 和 FormatVertex 事件中设置的。我不清楚在哪里设置graphml的颜色。

.点方式

自定义边缘类：

.Graphml方式

一些类：

自定义边缘类：

我正在尝试读取 yEd ( yEd ) 生成的 .graphml。我能够读取简单和手动生成的 .graphml 文件，但 yEd 文件包含几个要定义的属性。有没有人有一个运行示例来说明如何处理此类 yEd 文件？

现在我有一个 GraphML 文件，它是通过使用 JUNG 的 GraphMLWriter 写出一个 JUNG DelegateTree 图而构建的。我现在正试图将该文件读回新的 DelegateTree。使用 GraphMLReader 时，您无法读取树类型（您会遇到“使用 addChild() 添加顶点”异常）。因此，我将文件读入 DirectedGraph。

现在如何将该 DirectedGraph 转换为我想要的 DelegateTree 类型。由于各种原因，我需要这种类型的它，主要用于显示目的。谢谢。

我目前的工作流程是从TGF 格式的图表开始，使用 yED读取它们并使用yED将它们输出为某种图像格式。我宁愿有 d3.js 输出。

那里有任何工具（最好是 Ruby gem）可以采用 TGF 格式的图形并在 d3.js 中输出它们？如果它处理有向图，则加分。

当使用来自https://github.com/jexp/neo4j-shell-tools的工具运行 neo4j-shell 时，它不会加载我的 graphml 文件，在http://validator.w3.org/check上进行了验证。

Neo4j 在 KDE 下使用 OpenJDK IcedTea 2.3.9 在 Ubuntu 上运行

这是命令和消息：

如何让它发挥作用？这是我的 graphml 文件的片段：

我已经提取了一些我曾经在 networkx 1.6.1 中使用过的代码。gml在 1.8.1 上，它在写入or时不起作用graphml。

问题归结为无法在数据字典中写入边缘属性，如下所示：

导致错误：

当我使用时：for e,v,data in BasicGraph.edges_iter(data=True):数据打印如下：

AKA 新属性在字典之外。

文档说我应该能够像上面那样做。但是，我想我犯了一个愚蠢的错误，很高兴能回到正确的道路上！

编辑：

所以我用程序内部生成的图表运行程序： BasicGraph = nx.complete_graph(100)它运行良好。

然后，我使用来自底漆的示例 graphml 文件运行它：BasicGraph = nx.read_graphml("graphmltest.graphml")这也很有效。（我什至导入和导出 Cytoscape 以检查这不是问题）

所以很明显这是我正在使用的文件。这是它的链接，任何人都可以看到它有什么问题吗？

您好有一个由 3 个节点和 2 个连接组成的简单 graphML 文件，我想对其进行转换，以便标签和属性的内部结构以不同的方式组织。

原始文件如下：

虽然我想获得的文件如下（我手动转换它以显示所需的结果）：

结构的改变不是那么容易（例如节点ID在原始数据结构中从0开始，而在所需输出中从n1开始）：是否可以使用XSL转换来转换它？

好的，这里有一个更清晰的解释：

我现在明白我需要使用 sparse 或 SparseMultigraph 类型才能拥有双向边，所以我已经更改了我的 GraphML 类：

}

然后将我的树生成器类构造函数更改为 SparseMultigraph ：

当我运行我的主要课程时：

我没有收到错误，但边不存在（节点在图中但未正确显示）。

谢谢齐德

我正在尝试将包含单个有向图的 GraphML 文件读入 Haskell Data.Graph，以便使用该Math.Combinatorics.Graph模块运行分析。

但是，我找不到任何允许我读取 GraphML 文件并生成Data.Graph. 我发现的一个相关模块是ForSyDe.Backend.GraphML. 但是，这似乎是特定于ForSyDeDSL 的，我目前想不出一种方法来使用它来阅读普通的Data.Graph.

你能给我指一个允许我阅读 GraphML 的库吗，最好有一些关于如何使用它的示例代码？