问题标签 [factoextra]

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r - 使用 fviz_clusters() 可视化 K-means 集群时遇到问题

目前正在尝试可视化 k-means 集群并遇到了一些麻烦。我在运行以下代码时收到此错误消息:

这是我的代码:

如果有帮助,请查看以下数据:

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r - 聚类图。添加簇号:函数 fviz_cluster (factoextra)

我有以下 R 代码:

它输出以下图片:

在此处输入图像描述

是否可以在图片中添加相应簇内的簇数?或者显示集群编号而不是点中心。

更新。

类似于我想要实现的东西我发现在:https ://www.r-bloggers.com/2016/11/hybrid-hierarchical-k-means-clustering-for-optimizing-clustering-outputs-unsupervised-machine-learning /

我试过了,但我得到了错误。所以我必须安装使用的factoextra版本并更改代码。所以我得到了这个:

在此处输入图像描述

如何删除除集群中心数字之外的数字?

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r - fviz_pca_biplot():个体和变量的双标图

你好,我有这个 R 代码,我想显示分类和物种,但它只显示物种,如果我做错了什么。谢谢

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r - 在 Factoextra 上更改形状

我是一个非常新的编码员,希望改变我的 PCA Biplot 的形状。我的 PCA Biplot 代码如下:

颜色按照我的喜好排列,但我希望Trts之间的形状不同。示例:shime1 trt 1 = 蓝色圆圈,shime 1 trt 2 = 蓝色方形,shime 2 trt 1 = 绿色圆圈等。有关当前双标图,请参见下图。

我试过了:

没有给我与 fill.ind 相同的输出,并且与 col.var= 、 geom.ind/var 和 shape.ind 发生冲突

改变pointshape=c()似乎也不起作用

甚至是修改后的代码:

prcomp(j, center=TRUE, scale=TRUE) 之前的数据摘录:

更新双标图的图片

任何帮助表示赞赏。提前致谢。

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r - 如何从我的数据框中将标签添加到 PCA 图

我有一个数据集,想运行一个 PCA 图。在此图中,观察值应根据name( ) 列以相同颜色分​​组habillage = a$name。此外,我希望单个观察结果显示它对应于哪个组Age。我发现label = "none"没有显示它,但如果我写label = a$Age什么都没有改变。最后,如何避免在图例中显示重复的黑白文本habillage = a$name

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r - R标记中的双标图由两个变量?

你好我有一个多元数据集

我对我的缩放数据执行了 PCA,并使用fviz_pca_biplot()了显示双标图的函数。

这是我所做的一个例子:

(以 mtcars 为例)

“mpg” “cyl” “disp” “hp” “drat” “wt” “qsec” “vs” “am” “gear” “carb”

pca_mtcars

问题是我不仅想通过“gear”变量显示标签,还想通过 mtcars 数据集的“am”变量显示标签,点颜色相对于“gear”变量,点的形状相对于“我”变量

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r - 如何在 pca biplot 中显示观察结果?

我希望使用 factoextra 包在主成分分析双图上显示观察行名称。

)在此处输入图像描述

在此处输入图像描述

提前致谢

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r - 如何仅标记双图中的点子集?

我在 factoextra 中使用 fviz_pca_biplot 生成双图。以下代码提供了我的数据集和双图的示例。我想标记点的子集,而不是全部。例如,只有单一属的物种,如桉树。我无法弄清楚如何,或者即使它是可能的。任何人都可以提出解决方案吗?

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r - 去除 PCA 中椭圆的内部颜色

有谁知道如何更改椭圆中颜色的透明度(或 alpha)?
我只想保留情节中的边界线。
我试图模仿这个站点中的代码:http: //www.sthda.com/english/wiki/fviz-pca-quick-principal-component-analysis-data-visualization-r-software-and-data-mining

但我找不到关于椭圆颜色的 alpha 值的选项。

在此处输入图像描述

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r - 在 y 轴和 x 轴上转换比例给出和无限值时出错

为了制作流式细胞术实验的散点图,我在过去几周使用了以下代码。在运行代码时,我没有收到大量错误(从数据集中删除了 10,000 个条目中的 20 个)。

现在我想使用 Mclust 包中的基于模型的聚类,我使用 fviz_cluster 作为函数来创建散点图。只有这一次,我在运行下面的代码后收到以下错误。

警告消息: 1:在 self$trans$transform(x) 中:产生了 NaN 2:转换在连续 x 轴中引入了无限值 3:在 self$trans$transform(x) 中:产生了 NaN 4:转换在连续中引入了无限值y 轴 5:删除了 9110 行包含缺失值 (geom_point)。

谁能帮我解决这个问题?