问题标签 [factoextra]

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r - R函数创建和保存图形

我正在尝试创建和保存几个图形。我被困在factoextra包用于制作图表的情况下。

这是一个从输入 pca 对象(使用 FactoMineR 包创建的 pca)创建双标图的简单函数,out_f 是先前定义的。当我逐行运行脚本时,它可以工作。当我将它作为脚本运行时,什么都没有创建。

在这种情况下没有问题。有谁知道为什么在第一种情况下会出现问题?

在此先感谢,约翰

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r - 以簇为颜色的 R Biplot

我在 PCA 转换后进行聚类,我想可视化 PCA 空间的前两个或三个维度中的聚类结果,以及原始轴对投影 PCA 的贡献。

我使用factoextra使用 ggplot 的库,它工作正常,但我想取消图例

我的代码:

在此处输入图像描述

如何删除右侧的图例列?

不使用任何库的等效双图也是一个受欢迎的解决方案。

PS:

即使在 3-D 中也很容易获得一个好的双标图:

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r - factoextra:抖动标签以避免过度绘制

由于factoextra使用ggplot2绘图系统,有没有办法调整文本标签的位置(抖动),以避免重叠?

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r - How to install "factoextra" in R?

I am using R version 3.0.3. while running

Iam getting below error:

Can anyone please tell me how to install this package?

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r - 需要帮助在 R 中为变量着色和向 PCA 添加椭圆

我是 R 新手,正在尝试弄清楚如何使用它进行 PCA。到目前为止,我已经尝试了两种方法,但两者都有问题。

这是第一个的代码:

绘图输出为: Dim1, Dim3 plot

我的问题是 1)我如何知道颜色已正确分配,2)我如何添加椭圆。


这是我的第二种方法的代码(我使用这个网站寻求帮助,但仍然卡住):

情节: Dim1,Dim2情节

我的问题是我想像以前一样绘制第 1 维和第 3 维,而不是第 1 和第 2 维,但不知道如何指定。我也不明白如何改变颜色。

这是否看起来像我正朝着正确的方向前进?如果可能的话,我真的很感激一些帮助。我不知道我在做什么,并且应该在写我的文章,而不是仍然停留在分析中。也很抱歉文件有奇怪的名字,比如“你好”,我很沮丧。


这是您要求的信息

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r - 使用 ade4 和 factoextra 包的自定义标签

我想用ade4包制作和绘制 PCA,然后用factoextra. 在我意识到我的双标图之前,它对这两个包都很好factoextra,我不知道如何自定义标签。

我只知道是否有人可以帮助我编写以下代码:

这给了我这个双标:

在此处输入图像描述

我将变量的名称命名为“Cocco”、“Crypto”、“Diato”而不是“biot.Conc_cocco”、“biot.conc_Crypto”

感谢您的回答和建议

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r - Factoextra - 更改椭圆和变量的线宽

我目前正在使用factomineRfactoextra包制作 pca。

我的带有数据虹膜的代码示例:

1

我想更改椭圆周围线条的宽度,并且变量的宽度相同。我尝试了几种方法,但我不知道如何做我想做的事。

有任何想法吗?

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r - PCA 双图组个体

我的数据中有很多人(n = 600)。我运行 PCA 并想创建变量和个体的 Biplot。我想要由它们的贡献着色的变量。这些人来自两组,我想根据两组对点进行着色。我附上一个小例子。

问题;

  1. 如何将行名 SEBRLE 和 NOOL 涂成红色,其余的涂成黑色
  2. 将所有行名分配给 2 个因素中的 1 个(我不介意这是一个例子),并为它们着色。

部分回答;

然而,在我得到的地方,我正在失去。正如不断出现的那样,我无法找到同时使用 habillage 和 contrib 的 select.var 的方法Error: Continuous value supplied to discrete scale

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r - 基于组/类的 PCA 中特征的贡献

我想获取/绘制每种葡萄酒类别(巴罗洛、格里诺利诺、巴贝拉)的特征的贡献。使用fviz_contrib我得到了所有类的贡献,如下面的 MWE 所示。但是我想知道是否以及如何计算/绘制按类/组单独过滤的它们。

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r - 如何使用 fviz_nbclust 打印最佳簇数

我需要帮助来了解如何使用 R 中的 k-means 集群找到最佳的集群数量。

我的代码是

我得到了情节,但我仍然不知道如何找到数字?

谢谢

我的情节在这个链接中显示了 wss 和集群数量之间的关系,没有关于最佳集群数量的信息