问题标签 [biplot]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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r - biplot R中特定点的文本标签

在情节中,我想在 ingg的点上有一个文本标签。Valiantmtcars$brand

我已经尝试过这种方法,它只给了我想要的一点。但我想要相同的情节,但在Valiant点上有一个文本标签

谢谢!

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r - 如何删除双标图(PCA)中的观察(样本)

我想知道如何删除我的双图中的观察结果(我的图表背景中的黑色数字),只保留红色箭头(变量)。

这是我的双标图:双标图(x=pca,选择=1:2)在此处输入图像描述

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r - 如何在 R 中绘制 SVD/PCA 的距离双图和相关双图结果?

我搜索了很长时间,以寻找距离与相关双图的直接解释,以及如何转换 PCA 的标准输出以实现两个双图的解释。我看到的所有堆栈溢出解释1 2 3 4 都用数学术语让我大吃一惊。如何使用 R 的 prcomp 的输出创建距离双图和相关双图?

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r - 如何使用 R 中的 2 个数据框生成具有 2 个以上图例的图

我正在尝试使用带有 2 个数据帧的 ggplot2 来创建一个函数。

第一个数据框:

以及 SeqTech 栏目中的 3 个类别

第二个数据框是

这是我的代码:

现在添加使用 DF1 将每个点与平均点连接的线:C1 和 C2

现在我将使用数据框 DF2 为代表平均值的每个类别添加一个点

这是获得的情节:

在此处输入图像描述

所以我的问题是,我想添加第二个图例,我的意思是第一个图中的图例所有元素都重叠在一个图例中,我想要第一个图例直到: geom_segment(data = DF1, aes(xend = C1 ,yend = C2.......和第二个图例使用从数据框 DF2 获得的数据,在一秒钟内有一个点,图例像“ o Centroid ”:

在此处输入图像描述

对不起图片,已编辑!!!!

有什么建议吗??

非常感谢 !!!!

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r - R CCA - 物种分数可以与 CCA 轴相关吗?双标箭头长度如何与变量的显着性相关?

你好,这是我在 stackoverflow 或任何类似论坛中的第一个问题,所以如果我错过了什么,请原谅并善待;)

我正在使用R中的vegan包来计算cca分析。因为我的研究是关于物种性状的种内变异,所以我没有“情节 X 物种-矩阵”而是代表“生理-化学-利基”的“个体 X 性状-矩阵”(所以我的物种分数看起来与他们不同习惯了)。所以我的问题是:

  1. 以这种方式进行分析是否合适?
  2. 是否可以根据“物种分数”(在我的情况下不是物种分数)来解释 CCA 轴 - 我想获得以下信息:CCA1 与性状 X 最相关。
  3. 与 premutaion 测试 (anova.cca) 相比,我如何解释双标图箭头的长度 - 因为我得到了许多“长”箭头,但在排列测试中只有少数是显着的?

这是我的摘要(cca)-输出:

这是我的 anova.cca(cca)-输出:

这里是双标图: 在此处输入图像描述

谢谢你们!

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r - fviz_pca_biplot():个体和变量的双标图

你好,我有这个 R 代码,我想显示分类和物种,但它只显示物种,如果我做错了什么。谢谢

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r - 在 Factoextra 上更改形状

我是一个非常新的编码员,希望改变我的 PCA Biplot 的形状。我的 PCA Biplot 代码如下:

颜色按照我的喜好排列,但我希望Trts之间的形状不同。示例:shime1 trt 1 = 蓝色圆圈,shime 1 trt 2 = 蓝色方形,shime 2 trt 1 = 绿色圆圈等。有关当前双标图,请参见下图。

我试过了:

没有给我与 fill.ind 相同的输出,并且与 col.var= 、 geom.ind/var 和 shape.ind 发生冲突

改变pointshape=c()似乎也不起作用

甚至是修改后的代码:

prcomp(j, center=TRUE, scale=TRUE) 之前的数据摘录:

更新双标图的图片

任何帮助表示赞赏。提前致谢。

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r - 在 factoextra 包中扩展双标比例

我正在尝试使用 factoextra 包中的“fviz_pca_biplot”在 r 中绘制 PCA 模型。但是我在使绘图足够大以显示所有向量时遇到问题。欢迎任何帮助。

我正在使用这段代码:

这是即将出现的双标图: 双标图

我正在使用这个数据集:Substance_Use

我从中对我需要的变量进行了子集化:

输出是:

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r - 有没有办法将 fviz_ca_biplot 与任何其他情节结合起来?

我希望将fviz_ca_biplot()R 中的结果与符号图结合起来,因为最终目标是在同一附近创建具有相似值的品牌地图,有什么办法吗?

我正在使用此代码-

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r - 无法将 PCA prcomp 中的标签从行号更改为站点名称

我已按照https://stackoverflow.com/questions/38900698/how-to-change-labels-from-pca-using-prcomp-to-sample-names中的答案进行操作,但无法使其正常工作。我设置了一个 7 列 12 行的虚拟文件(称为 tf4)并将其导入 R Studio。前几行看起来像这样

head(tf4)

然后我将行名设置为第 7 列

#将行名设置为第7列

并收到警告信息

警告消息:不推荐在 tibble 上设置行名称。

当我再次使用 head(tf4) 进行检查时,行名尚未重置并保持不变。

但是当我在 R studio 'environment' 中查看文件时,它已经重置了行名

环境中文件的剪辑和草图图像

但是,当我运行 prcomp

图中未使用站点标识符

双图的剪辑和草图视图

我无法解决这个问题。似乎将行名称设置为第 7 列无法正常工作。

  1. 我错过了一步吗?

  2. 在 prcomp 中我需要额外的指令吗?