问题标签 [correspondence-analysis]

我觉得这可能是一个愚蠢的问题，但我花了很长时间寻找答案，但似乎找不到答案。甚至很难知道要搜索什么，所以如果在你知道的其他地方回答了这个问题，我只需要一个链接。

然而。我正在尝试使用 vegan 包在 R 中做一个简单的 CA，它工作正常。但是，我生成的图只显示了 60 个“站点”，而实际上我有 135 个。有谁知道为什么会发生这种情况？我需要能够显示所有的对象。我的代码如下

为了让您了解我的数据是什么样的：

数据是 5 种鱼类、135 个位置以及每个物种在单元格中每个位置的单位努力捕获量。当我绘图时，绘图中显示的位置不够多。

我正在寻找一种在 OpenCV 中（甚至在 JavaCV 中更好）进行对应分析的方法。基本上我有两个从两个不同的角度拍摄的图像。现在我需要在两个图像中找到对应的点。结果应该如下所示：

OpenCV有什么方法吗？

我正在使用 FactoMine R 绘制 MCA 图。我的数据表如下所示：

这是我的第一个红色标志......之后，我执行了 MCA 只是为了看看我会得到什么，这就是代码：

然后我在控制台中得到以下信息：

我是使用 R 的新手（如 1 周），但我有使用 SAS 的经验......我不知道我做错了什么以及为什么 R 将我的数据修复到上述结构中（3L、3L、3L.. .) 有没有人知道如何进行？

I have two scatterplots, based on different but related data, created using qplot() from ggplot2. (Learning ggplot hasn't been a priority because qplot has been sufficient for my needs up to now). What I want to do is superimpose/overlay the two charts so that the x,y data for each is plotted in the same plot space. The complication is that I want each plot to retain its formatting/aesthetics.

That data in question are row and column scores from correspondence analysis - corresp() from MASS - so the number of data rows (i.e. samples or taxa) differ between the two datasets. I can plot the two score sets together easily. Either by combing the two datasets or, even easier, just using the biplot() function.

However, I have been using qplot to get the plots looking exactly as I need them; with samples plotted as colour-coded symbols and taxa as labels:

and

Can anyone suggest a way by which either

• the two plots (PlotSample and PlotTaxa) can be superimposed atop of each other,
• the two datasets (DataCorresp$rscore and DataCorresp$cscore) can be plotted together but formatted in their different ways, or
• another function (e.g. biplot()) that could be used to achieve my aim.

Example of workflow using a extremely simplified and made-up dataset:

The biplot will produce this plot: /r/10wk1a8/5

The PlotSample appears as such: /r/i29cba/5

The PlotTaxa appears as such: /r/245bl9d/5

EDIT so don't have enough rep to post pictures and tinypic links not accepted (despite https://meta.stackexchange.com/questions/60563/how-to-upload-images-on-stack-overflow). So if you add tinypic's URL to the start of those codes above you'll get there.

Essentially I want to creat the biplot plot but with samples colour coded as they are in PlotSample.

我对 R 很陌生，我正在尝试对汇总数据进行 Corresp 分析（MASS 包）。虽然输出显示行和列分数，但生成的双图将列分数显示为零，使绘图不可读（所有值按行分数以预期方式排列，但沿列分数平缓排列）。

代码是

对于我做错了什么以及如何修改它的任何建议，我将不胜感激，在此先感谢！马丁

链接到图像 绘图 对应的结果

它似乎不适用于这张名为 mytable 的表：

但是，它适用于这张桌子：

我使用了以下FactoMineR功能：

CA不适用于特定类型的列联表？除了非常大的尺寸之外，我还没有阅读文献中的任何内容来暗示这一点。

编辑：

dput(mytable)输出：

我想在我的数据上使用 mjca（包 'ca'），以便更真实地估计尺寸的解释变化。问题是我想提取活动变量和补充变量的坐标，以便在数据框中编辑它们。但是，mjca 的输出中没有给出变量的名称和维度。在 MCA（包“FactoMineR”）中，输出如下：

有没有办法将变量的名称提取并粘贴到 mjca 中的坐标？在 mjca 中，输出不容易解释：

我想我应该首先像这样提取坐标：

你认为我应该这样做吗？

感谢您的帮助！

我在 R 中使用这个 factoextra 包进行通讯分析。

当我打印出结果图时，我找不到隐藏 x 和 y 零线的选项。
我知道主题设置是基于ggplot2的。谁能帮我弄清楚如何隐藏这两行？
请在下面找到代码。

其他参考链接请看这里：ggplot2 主题

任何建议都有帮助！非常感谢

如何在 Python 中运行简单对应分析 (CA)？在 sklearn 库中，似乎只有多重对应分析 (MCA) 和规范对应分析 (CCA) 选项。但是，我的数据不是分类数据，不需要 CCA 应用的额外线性约束。

基于CCA 上的这个链接和MCA上的这个链接，我的印象是，不能通过使用其他两个选项之一来应用常规 CA。

我使用了函数 CA : CA(data[ ,2:5])

我得到了那个图形：

我有一个包含五列的列联表：一个定性数据和四个定量数据。但是，我想获得第一列的标签，而不是数字。如果我输入CA(data[ ,1:5])R 回答我说第一列是定性的而不是定量的并且存在编译错误，那么您知道如何显示第一列的标签而不会出现错误吗？