问题标签 [r2jags]

我正在尝试使用 r 中的 jags 在模型中集成多种类型的丰度数据。我正在努力使用区间审查来拟合具有计数和丰度类的二项式 N 混合模型。

我的数据集 1 包括来自多个站点、调查轮次和多年的计数数据丰度。数据集 2 由一年（第 1 年，嵌套在数据集 1 中的第 1-5 年）的聚合数据组成，以丰度类数据的形式。

一个简化的数据集可以大致按照Ch 进行模拟。10.3-5 in Marc Kéry & J. Andy Royle (2020)：在生态学中应用层次建模。使用 R 和 BUGS 模拟分布、丰度和物种丰富度。第 2 卷：动态模型和高级模型：

我的目标是使用数据集 1（全计数数据）来估计模型的似然部分中的检测概率和共享协变量。我想用更大但更粗糙的数据集 2 来改进共享似然协变量。我设法做到了。 但我也想使用数据集 1 提供的趋势信息（包括通过年份协变量）来推断数据集 2 的丰度。最后，我想获得数据集 2 中包含的站点的 N 估计值缺失的 2-5 年仅包含在数据集 1 中。

R 返回以下错误：

Dinterval 似乎缺少限制。到目前为止，我找不到解决问题的方法，因为 dinterval 的这种应用并不常见。关于如何将数据丰度类估计推断到数据集 1 的时间跨度，同时在模型部分之间共享协变量的任何想法？

我遇到的另一个小问题：与模拟数据不同，我的真实丰度级数据还包括缺勤。我未能将这些缺席包括在内，因此暂时将它们从我的数据集中排除。我想 dinterval 无法处理具有限制（0,0）的非丰富类数据。我将不胜感激有关如何将这些站点包含在我的模型中的任何想法。

我会很高兴任何有用的建议！谢谢，乔

（这篇文章也发布在 sourceforge 上：https ://sourceforge.net/p/mcmc-jags/discussion/610037/thread/224919442a/ ）

我是 Royle-Nichols 多类群占用模型的新手。运行我在此处附加的代码后，我得到“jags.model 中的错误（model.file，data = data，inits = init.values，n.chains = n.chains，：节点 y[2,1] 节点中的错误与父母不合”。

我在此处发布的相关问题中看到该问题可能与我的先验和/或缩写的大小有关...我尝试了一些更改，但问题仍然存在。

如果有人可以在这里提供帮助，我将不胜感激。

我的数据包含 720 个站点和 29 个检测到的物种和 10 个任意未检测到的物种（用于数据增强）。

我的缩写是：