问题标签 [r2jags]

我对 jags 中的以下语法感到非常困惑，例如，

目前我认为

n.adapt=100意味着您将前 100 次抽签设置为老化，

n.iter=100,000表示 MCMC 链有 100,000 次迭代，包括老化，

我已经检查了这个问题的解释很多时间，但仍然不确定我对n.iterand的解释n.adapt是否正确以及如何理解update()and thinning。

谁能给我解释一下？

我正在运行 rjags 的逻辑模型，但错误总是发生（见下文），我觉得我的代码包含所需的一切并且它们是合乎逻辑的，所以到目前为止我无法检测到我的代码中的错误。这是错误

这是我的代码：

期待您的帮助。

我一辈子都无法让 R2jags 运行。我尝试了所有不同版本的 rjags、JAGS、R ... 每次我得到相同的错误： .onLoad failed in loadNamespace() for 'rjags' R2jags 包中的所有其他文件都加载得很好...

使用 JAGS 时，如何以以下格式接收模型的输出：

我假设，与 BUGS 一样，它会在模型​​完成时出现，但是我只得到以下格式的内容：

为基本问题道歉。如果有人可以提供有用的 JAGS 介绍材料，那也很有用。

亲切的问候。

每当我尝试在 R 中创建降价时，我都会收到以下错误消息：

代码运行良好，问题出在我尝试编织它的时候。我拥有的一段代码是这样的：

我使用 Windows 10、Rx64 3.2.3 和 RStudio 0.99.903。

我正在尝试参数化 JAGS 中的伽马分布 - 使用分段线性预测器，但我的模型无法运行并出现以下错误消息：

当从正态分布中提取 wood.recovery 时，该模型有效，但较低的分位数预测值小于零，这在生物学上是不可能的。我尝试了一些技巧，例如将 0.001 添加到“mu”参数以防绘制零，根据 glm 的输出设置初始值；但两者都不能解决错误消息。任何见解将不胜感激[我正在使用 R2jags]。我的模型：

我正在尝试使用 JAGS 运行他的模型代码：

我创建的数据矩阵应该没问题：

使用这些参数的实际调用之前一直在工作......

但由于某种原因，当我想调用它时，会发生这种情况：

有人知道为什么“y”应该超出范围吗？

“i”应该始终从适合矩阵（bugs.data）的1到124，而“t”从2到203也很好....

I am working through the textbook "Bayesian Ideas and Data Analysis" by Christensen et al.

There is a simple exercise in the book that involves cutting and pasting the following code to run in Winbugs:

I am trying to translate the following into R2jags code and am running into some trouble. I thought I could fairly directly write my R2Jags code in this fashion:

with the R code:

However, calling the R code brings about the following error:

Is it because I am missing a necessary for loop in my R2Jags model code?

我正在使用多级模型来尝试描述纵向变化的不同模式。Dingemanse 等人 (2010)描述了当随机效应完全相关时的“扇出”模式。然而，我发现当随机效应之间的关系是非线性但在观察间隔内单调增加时，会出现类似的模式。在这种情况下，随机效应不是完全相关的，而是由函数描述的。请参阅下面的示例以了解此情况。该示例仍然具有较高的截距-斜率相关性 (>.9)，但可以获得低于 0.7 的相关性，同时仍保持完美的截距-斜率关系。

nlme我的问题：有没有办法在使用或其他 R 包的多级模型中包含随机效应之间的完美（非线性）关系？MLwiN 有一种方法来约束斜率截距协方差，这将是一个开始，但不足以包括非线性关系。nlme到目前为止，我一直无法找到解决方案，但也许您知道其他一些可以将其包含在模型中的包。

为草率的编码道歉。我希望我的问题足够清楚，但如果有什么需要澄清的，请告诉我。非常感谢任何帮助或替代解决方案。

我是 JAGS 的新手，我正在通过R2jags包在 R 中运行模型。模型代码基于取自 Kéry & Schaub 2012 的代码（“使用 WinBUGS 进行贝叶斯人口分析”），第 399 页。

计算卡方差异度量

whereg和t是地点和时间指数，G和T然后是地点的数量和年数

我得到一个错误

它是由 JAGS 相对于 WinBUGS 使用的不同语法引起的吗？代码与书中使用的代码相同，除了我有 2 个维度而不是书中示例中的 3 个维度。