问题标签 [r-package]

我正在使用 R 中的arulesandarulesViz包对我的数据实现一组关联规则。它工作得很好，直到几天前。但是现在，每当我加载使用此包的 R 文件时，我都会收到以下错误。

如果我使用该plot()功能，arulesViz我将面临以下错误：

所以试图卸载软件包并重新安装它。它只在重新安装后第一次工作，当我重新安装后第一次使用时，它也抛出了以下错误。

但是，一旦我保存了文件并将其加载回来，旧的错误消息就会再次重复。我在 Google 中搜索过，但没有人发布过任何接近此类错误的内容。感谢您的帮助。谢谢。

这似乎是一个奇怪的问题，但我确实有一个我正在尝试弄清楚的用例。

假设我正在编写一个包，并且我有一个函数，我想允许用户使用其他名称 - 用户提供函数的名称。我想知道实现这一目标的最佳方法是什么？

这是我想要得到的行为 - 现在用户可以调用addAlias("bar")，然后如果他调用bar()它，就好像他调用了我的函数。

显然这不是一个好的解决方案，因为它分配给全局环境。有没有人对什么是最好的方法有反馈？我试过的几种方法：

1.分配给globalenv

就像我在示例中展示的那样。这似乎奏效了。

2.分配到包的环境

这工作了一段时间，直到我意识到它只适用于devtools而不是如果包由于锁定环境而正确加载

3. 将新环境附加到搜索路径

这是我不喜欢的，因为使用attach. 在这种情况下是否有保证？我什么时候detach？

4. 暴露一个单独的命名环境

bar()这可行，但用户需要调用alises$bar()or ，而不是能够调用mypackage::aliases$bar()。我不喜欢那样，但这是一个有趣的实验。我也不知道这样导出变量是否可以？

任何帮助表示赞赏

我正在尝试将以下 ggplot2 辅助函数包含在一个包中[它将标签包装在 grid_facet(.~variable, labeller = "plot.label.wrap")] 中：

我的说明文件包括：导入：ggplot2。使用该函数的脚本包括：library(ggplot2)。

该包在 ?plot.label.wrap 上构建、重新加载并提供文档。可以找到：

然而：

所以我的问题是，为什么这个函数可以在 mypackage 的命名空间中找到，而不是在命令行本身？

有人可以指出一个工作示例，其中Packrat与AppVeyor一起使用来构建 R 包？通过谷歌和 GitHub 搜索，我找不到任何使用 AppVeyor 的 packrat-enable 包。

appveyor.yml 文件是否需要更改？我需要通过 AppVeyor 网站添加一些设置吗？

我有一个非常小的包（testthat是唯一的依赖项），它破坏了 AppVeyor 的构建。这是为该提交冻结的代码。这是AppVeyor 日志。

（如果这个 SO 问题听起来很熟悉，我将向Travis-CI 提出一个类似的问题。）

根据“frontier”的包描述，当extraPar设置为TRUE时，会报告一些额外的参数，例如“sigmaSqU”，“sigmaSqV”等。但是，它也指出“sigmaSqU和sigmaU不是方差和标准误分别为 u"。

所以，我的问题是，如果 sigmaSqU 和 sigmaU 分别不是 u 的方差和标准误，那么它们是什么？

非常感谢。

纯函数是返回值仅由其输入值决定的函数，没有可观察到的副作用。

有哪些方法可以在 R 中以编程方式捕获不纯函数？

• 在探索一个包时，我经常这样做lsf.str("package:base")（base在这里作为一个例子）。

• 我还尝试通过源代码查看是否/在哪里调用了我知道不纯的函数。

• 我倾向于多次运行函数文档中给出的示例并测试结果是否相等：例如。is.recursive(replicate(10, 1+2))

这都不是很耗时，而且我确信有一套更好/更强大的方法来探索哪些函数是不纯的。

那么 R 包中不纯函数的常见/稳健测试是什么？

- 最佳实践切线（随意忽略）：此外，如果您有一个不纯的功能，您是否应该在其下明确记录它?

我有一个 R 包，这取决于base64enc库。当我使用 Rscript 运行包中的源文件时：

它运行得很好。

Analyzer.R 中的第一行是：

但是，当我从 repl 中的包中运行一个函数时：

它抱怨未安装base64enc。

但是，当我在 REPL 中手动包含 base64enc 时：

它工作正常。无论如何我可以告诉我的分析器包使用 base64enc 库，而不必每次使用该库时都将其包含在每个脚本中？

我正在编写一个 R 包并使用 roxygen2 创建文档。我使用RStudio 中的Build & Reload按钮构建包和文档。根据 RStudio 的输出，它用于devtools::document(roclets=c('rd', 'namespace'))编译文档。

我想使用@family标签将文档中的许多功能链接在一起，这就是我的问题发生的地方。这条线

在 .Rd 文件中转换为以下

我不想要单词之间的点。我有一个较旧的包，即使我以与编译新包完全相同的设置重新编译文档，也不会发生这种情况。我看不出这个旧包和我的新尝试之间没有根本区别。

我写了一个非常简单的测试包，问题也出现了。它包含一个 R 文件 ( testpackage.R)：

描述文件是

NAMESPACE 是由 roxygen 生成的。对于文档test1.Rd，我得到：

与\seealso部分中不需要的点。显然，@family标签中的单词数量似乎并不重要。我试过用引号、各种括号等将文本括起来，但没有任何积极作用。当然，我可以编辑 Rd 文件，但这会错过使用 roxygen2 的意义。

R CMD check在 .上运行而没有警告或错误testpackage。

为什么会出现这些点？我怎样才能摆脱它们？

我正在尝试为包提供一些可选的、方便的功能，foo但我与依赖项的依赖关系作斗争。具体来说，如果安装了 bioconductor KEGGgraph-package ，我想使用它的一些功能。本身取决于-package。从我读到的（虽然不清楚）是按照建议包括（和？）。KEGGgraphgraphKEGGgraphgraph

从文档中，我看到requireNamespace现在鼓励使用 of::而不是require内部函数。事实上，如果使用包裹检查也会抱怨require。但是，当我使用requireNamespace并且找不到::依赖项时。KEGGgraph

考虑以下最小的可重现示例。已安装和KEGGgraph全新的 R-session。graph下面的函数在-package中找不到函数：

好像requireNamespace什么都不做。通过运行重现错误：

如果require("KEGGgraph")已被调用，则可以正常工作：

用户真的有必要require手动安装这个可选包吗？在函数定义中添加&& requireNamespace("graph")-conditionif似乎没有帮助。

我想知道在记录函数时是否可以在 roxygen2 的代码块中插入换行符？

如果我在里面有东西\code{}，roxygen2 默认将所有换行符折叠成单个空格。我尝试\cr在里面插入以强制换行，我得到了所需的行为，但是当我“R CMD CHECK”时我得到了一个警告。有没有办法做到这一点？

例子：