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我如何对变量进行排序以便绘制它们，例如热图/它们显示相似模式的位置，即：在顶部 A 和 D，然后是 B、C 和底部 E。希望避免将其作为真实数据手动执行是更多的变量。

并希望：

如果您查看具有相似性的聚集行的热图，例如：https ://3.bp.blogspot.com/-AI2dxe95VHk/TgTJtEkoBgI/AAAAAAAAC5w/XCyBw3qViGA/s400/heatmap_cluster2.png您会在顶部看到该行其模式是第一个 x 轴时间点，然后是最后一个 x 轴时间点的更高的时间点。

要做的事情：所以我想知道是否使用缩放值，我们可以这样做，顶部是变量2（1：2）中平均值较高的值，然后是变量2（3：5）和变量2（6：7）平均值较高的值。如果我在这里不清楚并且可以更好地解释，请告诉我。

我目前正在尝试使用ggplot2. 数据分为 3 个类别，但对于每个类别，我想突出显示一些选定的点（或使它们在图表中以不同的方式显示）。没有像我在前面的示例中设法检查的任何特殊特征（例如，类别的最后一点、范围外的点……）。

附件是我目前得到的图表的一般视图，其中每个类别都由默认形状表示。

难题是，如何突出显示图表上的选定点，每个类别使用相同的形状，但颜色不同？所以每个点都是一样的，只是选择的点是黑色以外的颜色。我为每个要绘制的类别选择了 15 个点。

这可能与ggplot2吗？

我无法达到与我类似的任何情况，而是之前的一些关于在绘图上手动分配颜色的示例。我只是想用不同的颜色而不是形状来绘制类别，并用scale_fill_manual2 种不同的颜色（基色和选定点的颜色）绘制点，但它不起作用，而是出现了 6 种颜色。

如果可能的话，我仍然希望它像第一张图一样，其中点在所选点上以不同的形状和不同的颜色绘制。

更新：

这是我用作输入的制表符分隔文件的一部分：

以及所需的输出：

选定的点为黄色。

如果需要更多详细信息，请告诉我。谢谢！

我在遗传学工作，最近开始练习 R，特别是 ggplot，以制作用于出版的图像。

我运行了几个分析并组合在一个表 (Attempt_mod_TopTen) 3 数据集中，其中包含：

• y 轴 (GO_term) = 整个图形必须相同的名称
• x1 轴 (N_Genes_AB) = 与 y 相关的基因数量，以及它们的 p_value
• X2 轴 (N_Genes_A) = 与 y 相关的基因数量，以及它们的 p_value
• X3 轴 (N_Genes_B) = 与 y 相关的基因数量，以及它们的 p_value

我可以仅使用一组数据（X1、X2 或 X3）制作带有单个面板的图形

显示 GO_terms、基因数量及其 P 值之间关系的气泡图：

我看到有关于如何使用多个面板（即 facet_wrap）制作气泡图的帖子，但我想我的数据做错了，因为我找不到如何合并 X2 和 X3 的数据。我想在单个面板中显示我能够在 3 个面板中制作的内容，这些面板彼此相邻，共享相同的 y 轴。

我试图在 R 的地图上绘制一些点，但只有一半出现。我想这可能与日期线有关。

我的样本数据：

编码：

只有日期线的西部部分用正确的点绘制（其他点放在顶部）：

问题是蓝色数据点没有绘制在它们的特定范围内（-180、-120 和 25,65），因为两个坐标系/日期线在 +/- 180° 附近。我似乎无法弄清楚如何定义正确的 xlim 以使经度刻度在 x 轴上保持不变。有人知道缺少什么或需要重新定义吗？非常感谢。

我正在使用以下代码制作一个图形：

但是，我注意到 A 型的点颜色不是灰色，而是黑色。
无论如何，我可以相应地手动更改它吗？
如果可能的话，我想保留函数“scale_color_grey”。

谢谢！！

我想根据我的每个变量的 SD 值绘制我的误差线。我尝试了几件事（见底部），但我相信有一种方法可以为每个变量的每个数据点绘制单独的 sd？

我尝试了以下方法，但我认为问题可能是重构数据？

• 请注意，我创建了一个仅包含数据的 df 和一个包含 data+sd 的 df，data_sd这是我们要使用的。

我想绘制变量 B、C、D（y 轴）与 A（x 轴）的相关性，以获得与此类似的图：

如何获得绘制在对数刻度 y 轴上的每个变量的特定相关趋势线和 R 值？到目前为止，我已经获得了以下信息：

我有以下数据框：

我想在 ggplot2 中绘制这些数据，以生成一个散点图，其中不同的海洋颜色不同。我尝试了以下代码，它适用于类似的数据：

这给了我这个输出。有人可以解释为什么数字没有出现在图表的轴上吗？ GGplot输出

我正在努力将圆圈ggplot 完全重叠在一起。

这是情节代码：

我的数据框：

和情节：

我需要将圆圈居中，其中几个略有偏移。我已经尝试了许多电话，position =但没有成功。

有任何想法吗？

会话信息：

我正在绘制一个简单geom_point的年份作为 x 轴和百分比作为 y 轴。出于某种原因，y 轴没有将比率从最小到最大，而是将两个最小的比率放在顶部，其余的分别按从小到大的顺序从底部到顶部。这是我的代码：