问题标签 [cran]

我正在尝试构建一个 R 包，但似乎包依赖项存在一些问题。如果我在 R 中运行代码，我需要包“rgdal”和“rgeos”，所以要从中创建包，我：

• 在 NAMESPACE 文件中添加了“import(rgdal, rgeos)”行
• 将“取决于：rgeos，rgdal”行添加到说明文件中

当我运行 R CMD 检查（构建后）时，我收到一条错误消息：

错误的德语部分：“Benötigte，aber nicht verfügbare Pakete：”=“需要，但不可用的包”。

我已阅读上述手册并了解使用导入、建议或增强的选项，但我很确定这取决于我必须使用的选项，因为在我的代码函数中，我使用的是外部函数这两个包。

我究竟做错了什么？

我正在寻找一种tempdir()在 R 会话开始后更改位置的方法。我认为需要更新 C 级全局变量R_TempDir。从 R 中执行此操作的好方法是什么？

我一直认为在“Depends”字段中有一个包也会自动导入命名空间。但是，似乎在 R 2.15 中，依赖关系在包实际附加到搜索路径之前不可用。这是预期的行为吗？

问题出现如下：假设有一个包'Child'，它依赖，但没有显式导入一个名为'Parent'的包，并且包含一个调用'Parent'命名空间中的对象的函数。那么当这个函数在没有实际附加'Child'的情况下被调用时，'Parent'中的函数就找不到了。

这是包手册中的一个示例bigdata，但问题非常普遍：

该示例失败，因为 lasso.stars 依赖于 'glmnet'，它在bigdata附加之前不会加载。能够调用的唯一方法lasso.stars是实际附加bigdata包：

现在使事情进一步复杂化，似乎这个问题被继承到在这种情况下导入 lasso.stars 函数的任何“孙子”包。我很难找到一个很好的例子，但我相信他们就在那里。

这是一个错误吗？我知道可以通过要求包作者使用 Imports 而不是 Depends 来避免这种情况，但实际上 CRAN 上的大多数包仍然使用 Depends。如果 R 会自动将任何 Depends 包的名称空间导入到子包名称空间中，那么这个问题似乎很容易避免。

使用 R，我希望创建一个 QR 码并将其嵌入 Excel 电子表格（数百个代码和电子表格）。显而易见的方法似乎是使用命令行创建二维码，并在 R 中使用“system”命令。有谁知道如何通过“system”命令传递 R 变量？谷歌不太有用，因为“系统”有点通用，?system 不包含任何示例。

注意 - 我实际上使用的是数据矩阵而不是 QR 码，但是在 R 问题中使用术语“数据矩阵”会导致严重破坏，所以让我们来谈谈 QR 码。:-)

失败了，我用“粘贴”尝试过的变体也是如此。任何建议都非常感激。

假设我需要在没有互联网连接的（Linux）机器上安装一些包。假设我下载了一份 cran 并将其刻录到我带到离线位置的 DVD 上：

我什至可以添加一个 PACKAGES 文件，其中包含所有源包及其依赖项的概述：

我怎么能离线使用它来安装源包，以便从本地文件中解析和安装依赖项？例如，有人想要安装包 ggplot2，它具有相当深的依赖结构。假设 ggplot2 的源包及其所有依赖项都可以作为源包在当前工作目录中使用。如果我做：

这会导致错误，因为根本没有解决依赖关系。或者：

但是，这也忽略了依赖结构，并尝试按字母顺序安装包，这也会失败。

我查看了available.packages，contrib.url但我找不到从本地文件安装源包的示例，包括它的依赖项。

有available.packages()列出 CRAN 上所有可用软件包的功能。是否有类似的功能来查找所有可用的小插图？如果不是，我将如何获得所有小插曲及其相关包的列表？

作为一个角落案例，请记住该data.table包有 3 个与之相关的小插曲。

编辑：根据安德烈的回应，我意识到我并不清楚。我知道用于查找所有可用本地小插图的小插图功能，我正在寻找一种方法来获取 CRAN 上所有包的所有小插图。

如何测试对象是否是 S4 类的实例（不确定这是否是正确的术语）？但是，我知道该函数isS4，这对于类定义等也返回 true。例如：

trajobject在这种情况下，我只对包含数据的对象感兴趣；在方法或类定义中没有那么多。是否有可用于测试 S4 对象是否为实际对象的本机函数？即当使用print(object)输出开始时：

“foo”类的对象.....

我有一个数据集，其中包含由个人手机记录的每分钟 GPS 坐标。即数据集有 1440 行的 LON/LAT 值。根据数据，我想对参与者家的位置进行点估计（经度/纬度值）。让我们假设家是他们在给定的 24 小时间隔内花费大部分时间的单一位置。此外，GPS 传感器在大多数情况下具有很高的精度，但有时它会完全关闭，从而导致巨大的异常值。

我认为解决这个问题的最好方法是将其视为一个点过程并使用 2D 密度估计来找到峰值。在 R 中是否有本地方法可以做到这一点？我查看了 kde2d (MASS) 但这似乎并没有真正起到作用。Kde2d 使用密度值创建数据范围的 25x25 网格。然而，在我的数据中，这个人每天可以轻松地旅行 100 英里或更多，所以这些街区通常是一个太大的估计值。我可以缩小范围并使用更大的网格，但我确信必须有更好的方法来获得点估计。

假设我正在尝试运行一个来历不明的脚本，并且其中一个功能来自脚本未加载的包（疏忽，可能是由.Rprofile编写它的人加载的）。我怎样才能找到这个函数驻留在哪个包中？

在CRAN 上编译了一些信息，不需要用户在本地下载/安装所有 R 包；但是据我所知，它只能访问DESCRIPTION文件。RSiteSearch 及其网络等价物似乎可以访问所有 CRAN 软件包的在线数据库，其中可能会提供所有功能的列表。有什么方法可以访问这些信息吗？

谢谢。

编辑：我知道sos::findFn，utils::RSiteSearch并且search.r-project；我想要的是获得这些工具使用的原始数据。

我正在尝试通过执行以下操作通过 R 提示安装包：

但输出如下：

没有别的！我找不到这个非常基本的问题的解决方案。为了选择 CRAN 镜像，我应该输入什么？

编辑：

操作系统：Mac-OS X 10.6.8 R 版本：2.15.0