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r - 安装所有尚未安装的 CRAN 软件包？

以下 R 命令将安装所有 CRAN 包：

以下命令将列出所有已安装的软件包：

我的问题是：如何指示 R 安装所有尚未安装的 CRAN 包？

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r - R: apt-get install r-cran-foo vs. install.packages("foo")

在 Ubuntu 下安装 R 包（例如mcmcpack在此示例中）时，我可以选择以下两种安装方法：

问题：

  • 两种安装 R 包的方法中的任何一种都被认为是“最佳实践”吗？
  • 假设我首先install.packages("mcmcpack")和后来apt-get install r-cran-mcmcpack- 我应该期待麻烦吗？
  • 假设我首先apt-get install r-cran-mcmcpack和后来install.packages("mcmcpack")- 我应该期待麻烦吗？
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unit-testing - 测试脚本如何通知 R CMD 检查它应该发出自定义消息？

我正在delftfews办公室写一个 R 包 ( )。我们svUnit用于单元测试。

我们描述新功能的过程：我们定义新的单元测试，最初标记为DEACTIVATED；一次一个测试块，我们激活它们并实现测试描述的功能。几乎所有时候我们都有少量的 DEACTIVATED 测试，相对于可能被删除或将要实现的功能。

我的问题/问题是：如果有 DEACTIVATED 测试， 我是否可以更改doSvUnit.R以便发出注释（即自定义消息“NOTE”而不是“OK”）？R CMD check pkg

截至目前，我们只看到活动测试没有给出错误：

如果所有测试都成功，那没关系，但如果有跳过的测试，那肯定是错误的，如果有失败的测试，那肯定是错误的。在这种情况下，我实际上希望看到如下注释或警告：

到现在为止，我们必须打开doSvUnit.Rout来查看真实的测试结果。

我联系了 r-forge 和 CRAN 的两个维护人员，他们向我指出了R 的来源，尤其是testing.R脚本。

如果我理解正确，要回答这个问题，我们需要修补tools软件包：

  • 使用system调用调用测试目录中的脚本，
  • 输出（stdout 和 stderr）转到一个文件，
  • 有两种可能的结果：ok or not ok ,

所以我在 R 上打开了一个更改请求，建议对返回状态进行位编码，位 0 表示错误（就像现在一样），位 1 表示警告，位 2 表示注意。

通过我的修改，很容易产生这个输出：

Brian Ripley 回答说：“然而，有几个包含正确编写的单元测试的包可以根据需要发出信号。请在其他地方进行此讨论：R-bugs 不是提问的地方。” 并关闭了更改请求。

有人有提示吗？

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r - 如何检查 CRAN 镜像是否已过时？

建议 R 用户从本地 CRAN 镜像下载 R 和 R 包。但有些已经过时了。有没有一种简单的方法来检查存储库是否已过时？R中的任何功能可以做到这一点？

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r - tools::texi2dvi - 它发生了什么？

我很熟悉这样一个事实，即您可以直接从 R 中创建带有tools包和texi2dvi函数的 LaTeX 报告，但我很惊讶地发现该tools包丢失了。它只是不在 CRAN 存储库中。有谁知道适当的替代品texi2dvi？

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r - Install R packages from binary in Ubuntu Lucid

I've installed R in Ubuntu Lucid with the command

sudo aptitude install r-base

When I try to "install.packages" it seems to download source and then spend ages compiling it. How can I get it to just download and install the binaries, like I'm used to on Windows?

Is there any need to compile the packages myself? I'm running inside a VM so it would be great to keep things as slim as possible.

Thanks

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r - 无法从 CRAN 镜像中找到 tseries 包

我正在尝试tseries在我的 Linux 机器上安装该软件包。下R，我跑了

我被提示了一个镜像站点列表，但无论我选择哪个（例如，79: USA (WA)），它都给了我

有谁知道为什么会这样？我的 R 版本是 2.9.2。谢谢。

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r - 在 R 中从源代码安装时的包依赖项

repos = NULL只是确认：如果我将我的 R 包分发为 ZIP/TAR，那么安装包将不会自动下载/安装依赖项，因为我必须设置install.packages()并且不使用依赖项参数如果repos = NULL？可能让它工作的方法是打包一个安装脚本。那可能吗？我是否在这里完全遗漏了一些东西，并且有一种从源代码安装并自动下载和安装依赖项的机制？

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r - 安装 RJSONIO 库时遇到问题

我在安装 RJSONIO 时遇到了一些问题。install.packages 告诉我该软件包不适用于我的 R 版本。我可以手动下载二进制文件并安装，但随后我无法使用该库，因为它“未为 'arch=x64' 安装”

解决方法？

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r - 在 Ubuntu 10.04 上安装 R 2.13.0 包（插入符号）时出错

我按照http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/的说明通过 CRAN 存储库安装了R。过去，我能够在其他几个相同的 Ubuntu 10.04 系统上正常安装插入符号，但今天install.packages('caret', dependencies=c('Depends','Suggests'))导致以下错误（只是一个示例）。有什么提示吗？


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