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我按照http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/的说明通过 CRAN 存储库安装了R。过去，我能够在其他几个相同的 Ubuntu 10.04 系统上正常安装插入符号，但今天install.packages('caret', dependencies=c('Depends','Suggests'))导致以下错误（只是一个示例）。有什么提示吗？

...
** 测试是否可以加载已安装的包

* 完成（动态）
错误：依赖项“reshape”、“plyr”、“digest”不适用于包“ggplot2”
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/ggplot2'
错误：依赖项 'digest'、'stringr'、'mutatr'、'evaluate' 不适用于包 'testthat'
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/testthat'
* 安装 *source* 包 'ROCR' ...
** R
...
** 测试是否可以加载已安装的包

* 完成（ROCR）
错误：依赖项“plyr”、“stringr”不适用于包“reshape2”
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/reshape2'
* 安装 *source* 包 'party' ...
** 库
...
** 测试是否可以加载已安装的包

* 完成（派对）
错误：依赖项“reshape”、“plyr”不适用于包“caret”
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/caret'
* 安装 *source* 包 'rocc' ...
** R
...
* 完成（rocc）
错误：依赖项 'reshape2' 不适用于包 'Cubist'
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/Cubist'

下载的包在
        '/tmp/Rtmp2TsElZ/downloaded_pa​​ckages'
有 20 个警告（使用 warnings() 来查看）
> 警告（）
警告信息：
1：在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  软件包“Rmpi”的安装具有非零退出状态
2：在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  软件包“rpvm”的安装具有非零退出状态
3：在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  软件包“rsprng”的安装具有非零退出状态
4：在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“XML”的退出状态非零
5：在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“RODBC”的退出状态非零
6：在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  软件包“rgl”的安装具有非零退出状态
7: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  软件包“RWeka”的安装具有非零退出状态
8: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“shapes”的退出状态非零
9: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“rgeos”的退出状态非零
10: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  软件包“rgdal”的安装具有非零退出状态
11: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“plyr”的退出状态非零
12: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“stringr”的退出状态非零
13: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  软件包“latentnet”的安装具有非零退出状态
14: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  软件包“reshape”的安装具有非零退出状态
15: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“statnet”的退出状态非零
16: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“ggplot2”的退出状态非零
17: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“testthat”的退出状态非零
18: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  软件包“reshape2”的安装具有非零退出状态
19: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“caret”的退出状态非零
20: 在 install.packages("caret", dependencies = c("Depends", ... :
  安装包“Cubist”的退出状态非零
> 图书馆（插入符号）
库中的错误（插入符号）：没有名为“插入符号”的包

> 会话信息（）
R 版本 2.13.0 (2011-04-13)
平台：x86_64-pc-linux-gnu（64位）

语言环境：
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
 [5] LC_MONETARY=C LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
 [9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C

附加的基础包：
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base

通过命名空间加载（未附加）：
[1] 工具_2.13.0
> install.packages('caret', dependencies=c('Depends','Suggests')) # 再次运行
...
错误：依赖项 'digest'、'stringr'、'mutatr'、'evaluate' 不适用于包 'testthat'
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/testthat'
错误：依赖项“itertools”不适用于包“plyr”
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/plyr'
错误：依赖项 'RWekajars'、'rJava' 不适用于包 'RWeka'
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/RWeka'
错误：依赖项“plyr”、“stringr”不适用于包“reshape2”
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/reshape2'
错误：依赖项“plyr”不适用于包“reshape”
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/reshape'
错误：依赖项 'reshape2' 不适用于包 'Cubist'
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/Cubist'
错误：依赖项“reshape”、“plyr”不适用于包“caret”
* 删除 '/home/yang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.13/caret'
...
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1 回答 1

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你的 Ubuntu 机器上有正确的开发包集吗？我将开始整理失败的软件包列表，并尝试使用install.packages(). 我知道其中一些失败的包需要大量的开发头文件来编译 R 包。

如果您一次执行这些操作，您将开始了解软件包失败的原因。我使用 Fedora，但对于rgdal，例如，拥有gdal-develand proj-devel，proj-epsg并proj-nad从我的发行版的包管理器中安装，以便编译该 R 包。对于我需要安装的XMLlibxml2-devel等。如果您逐步检查失败的 R 包，应该很明显缺少哪些标头，您可以使用包管理器查找需要安装的 Ubuntu 包（debs）来获取那些标题。

于 2011-06-24T20:48:31.087 回答