问题标签 [cox-regression]
For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.
r - 金融工具价格的时间序列预测
我正在处理金融工具的日内时间序列数据。我必须根据一些统计参数(Var1,Var2,Var3)和日内时间序列(Obeserv.1,Observ.2.......Observ.80)数据来预测金融工具的价格上一个时期。我必须预测第 81 期金融工具的价格。
表中的所有行都混合在一起,因此任何 i 行中的信息对于 j 行的预测都是无用的。
我打算通过使用 R 来解决这个问题。我是这个金融建模领域的新手。我可以采取什么方法进行预测。请帮我解决这个问题。
数据集长这样
r - is.na() 应用于“NULL”类型的非(列表或向量)是什么意思?
我想从没有 NA 的 data.frame 中选择一个带有正向过程的 Cox 模型。以下是一些示例数据:
该表没有任何意义,但如果我们尝试构建模型:
前锋在第一步结束并说:
在 is.na(fit$coefficients) 中:is.na() 应用于“NULL”类型的非(列表或向量)
(三次)
我试图改变上层模型,我什至尝试过upper = ~ 1
,但警告仍然存在。我不明白:我没有 NA,我的向量都是数字(我检查过)。我搜索了人们是否有同样的问题,但我能找到的只是向量的名称或类别造成的问题。
我的代码有什么问题?
r - 从 coxme 对象中提取 AIC (R)
我正在使用包 coxme,我想从模型中提取 AIC,以便选择最好的。
1)我没有找到如何直接执行此操作,我认为如果不更改函数 coxme() 的代码,这是不可能的,但我很高兴错了,如果我错了,请告诉我!
2)我用命令查看了函数的代码:
为了将变量添加到库存 AIC 并查看代码,但如果我将其称为“coxme2”(例如,我只是在开头添加 coxme2<-)并尝试使用它(没有任何其他添加),我会收到错误消息:
colnames<-
( , value = c("NULL", "Integrated", "Fitted" 中的错误*tmp*
:'dimnames' [2] 的长度不等于数组范围
总而言之,coxme 函数运行良好,但如果我只是复制并粘贴它的代码,它就不行。我该如何解决这个问题?
r - Python 2.7 - Rpy2 Cox 比例危害模型
我正在使用Python 2.7
并将Mac OSX Lion
安装rpy2
使用Cox Proportional Hazards Model
我只是想知道:以前有没有人rpy2
做过 Cox Proportional Hazards。我正在阅读rpy2
包上的一些文档,它主要谈论创建dataframes
等,而不是说明如何运行各种功能。那么,我将如何调用此函数,然后指定依赖项time variable
以及censoring
变量(由二进制1
值指定)?
Mac 的 R 包还建议在使用计算机时不要将其连接到 Internet。这是为什么?
r - 带有 coxme 对象的转发过程 (R)
我正在研究心脏移植数据,我必须在R
. 由于它是为此目的而设计的,因此我选择使用该coxme
软件包,但在选择模型时遇到了很多麻烦。我想使用转发过程,但它不适用于coxme
对象。我在这里问了另一个问题,他的答案允许我访问step()
's 的代码来修改它,以便它适用于coxme
模型。但是,这非常困难(至少对我而言),因为功能相当复杂(绝对不仅仅是修改exctractAIC()
,还有许多其他功能需要适应)。
所以这是我的问题:
1) 有没有更简单的方法在模型上运行前锋coxme
?
2)我应该使用另一个包吗?
r - 使用包命名空间在 R 中分层 cox 回归
我正在使用生存包在 R 中进行分层 cox 回归:
这很好用,但是在使用采样包时,生存包中的分层功能被隐藏了,不能直接使用。
但是,使用显式命名空间调用它survival::strata
不会创建分层分析:
所以,
为什么会这样?当它被隐藏时我如何访问这个功能sampling::strata
(除了分离采样包;-)
我正在使用 R 版本 2.15.2
谢谢, DeltaKappa
更新:
作为将生存::strata 与我所做的采样包一起使用的解决方法
它在基本包的正上方加载具有低搜索优先级的采样包。那我可以做
在显式调用时sampling::strata
。
python-2.7 - Rpy2 - 函数调用 - Cox 比例危害
我的原始帖子目前尚未得到答复且有些开放式,可以在这里找到
我一直在尝试弄清楚如何使用它,并将一些示例数据关联起来,我已经到达了哪里以及我当前的问题是什么。
因此,我的数据,或者更确切地说是我的数据的简短示例,如下所示:
该数据已经过预处理,因此存在虚拟/二进制变量代替实际类别age_age6574
- 并age_age75plus
构成一个类别,sex_female
另一个,stage_late
另一个,death_death
另一个。 Access
是一个连续变量。TruncTime
将被视为离散时间变量。将用作审查变量的变量将是death_death
.
调用函数:
因此,要导入我执行以下操作的所有内容:
所以一切都准备好了考克斯比例危害 - 我想!
在 RI 内可以:
一切正常。
当我在 Python 中做同样的事情时,使用我所描述的一切,我得到一个错误,内容如下:
这是函数调用:
这是返回的错误:
所以,我想知道我在函数调用中做错了什么(为什么它会返回这个错误)以及我如何正确调用它?此外,我还想知道是否有办法将censoring
'0' 更改为 '1'(反转审查变量的工作方式)?
::::更新::::
所以我发现我的部分问题是指定使用哪些列/属性。显然, rpy2 需要列的数字索引来调用函数。所以:
为生存部分coxph
。该Surv
部分有效。
现在,我仍在尝试弄清楚如何指定其他所有内容。即:
-如何指定要在构建模型中使用的其他变量。使用+
in 将这些变量链接在一起存在问题。也~
不能像在常规 R 中那样工作。以下不工作
我还尝试用“,”替换“~”,例如:
- 这些肯定有问题,+
我不确定用~
a替换它,
是否真的有效。
r - R coxph() 警告:Loglik 在变量之前收敛
我在使用 coxph() 时遇到了一些麻烦。我有两个分类变量:Sex 和 Probable Cause,我想将它们用作预测变量。性别只是典型的男性/女性,但可能的原因有 5 个选项。我不知道警告消息有什么问题。为什么置信区间从 0 到 Inf 且 p 值如此之高?
这是代码和输出:
谢谢
r - R中Cox模型的似然比检验
有谁知道似然比检验,比如 lmtest 包中的 lrtest,它适用于使用 coxph 生成的 cox 比例风险模型?lrtest 似乎不适用于 coxph 模型。
谢谢
r - coxph() X 矩阵被认为是奇异的;
我在使用 coxph() 时遇到了一些麻烦。我有两个分类变量:“tecnologia”和“pais”,我想评估“pais”对“tecnologia”的可能交互影响。“tecnologia”是一个具有 2 个级别的变量因子:gps 和 convencional。而“pais”分为 2 个级别:PT 和 ES。我不知道为什么这个警告不断出现。这是代码和输出:
我正在就这个主题提出另一个问题,尽管几个月前我提出了一个类似的问题,因为我再次面临同样的问题,还有其他数据。这次我确定这不是与数据相关的问题。
有人可以帮助我吗?谢谢
更新: 问题似乎不是一个完美的分类