问题标签 [complexheatmap]

ComplexHeatmap我正在尝试使用库创建带有外部树状图的热图。

创建的热图与使用plot().

我有一个数据集，我在其中手动为行名分配了一些 unicode（vars下面我的数据示例中的列）：

我将此数据读入 R，将其转换为矩阵，vars列设置为矩阵的行名，然后使用complexheatmap包绘制热图 - 但是，它不接受我添加到行名的 unicodes，相反，我得到了这个：

然后，对于带有 unicode 的行名，输出图为空白。我怎样才能让这个热图接受行名中的 unicode？到目前为止，我只发现了类似的问题，这些问题集中在 ggplot 上，而不是使用其他包，如 complexheatmap。任何帮助或指导表示赞赏。

编辑：尝试添加示例代码，但是当我直接从 R 中获取它时，它不允许我包含 unicode，因为它们实际上在上图中看起来（例如 †、‡）：

我正在尝试在热图的每个单元格上添加一个数字标签。因为它还需要边际条形图，所以我尝试了两个包。iheatmapr 和 ComplexHeatmap。

（第一次尝试）iheatmapr 可以很容易地添加到下面的添加栏，但我看不到如何在单个单元格的热图中添加标签。

然后使用： save_iheatmap(in_out_plot, "iheatmapr_test.png") 因为我不能将 ggsave(device = ragg::agg_png etc) 与 iheatmapr 对象一起使用。

此外，iheatmapr 对象与 ggsave() 明显不兼容（也许我错了）对我来说是个问题，因为我通常使用 ragg 包导出图像 AGG 以保留字体大小。我怀疑其他一些热图包制作的自定义对象可能与拼凑和 ggsave 不兼容。

（第二次尝试）ComplexHeatmap 可以很容易地在热图中标记单个数字“单元格”，并且还在其“注释”中提供边缘条，我已经尝试过了，但是它的调色板系统（它使用整数来指代一组颜色）不适合我的 RGB 矢量颜色渐变，总体而言，它是一个复杂的包，显然旨在使图形比我正在做的更高级。

我的目标是如下面的屏幕截图示例所示的样式，它是在 Excel 中制作的。

请任何人都可以为像这样的简单热图建议一个更合适的 R 包，里面有边栏和数字标签？