问题标签 [viridis]

我正在尝试将日期映射到 ggplot2 中的viridis色标。默认ggplot色标适用于日期。但是我无法将它们映射到viridis比例尺，收到关于未提供“原点”的as.Date.numeric()错误（尝试使用时出现类似错误ggplot2::scale_color_gradient()）。请参阅下面的代表。

关于最有效的排序方法有什么建议吗？

I am trying to recreate the two plots on the left: The colour gradient is supposed to be lighter at 0, and darker at the extreme values. I want to use the viridis package to create the colour gradient.

Here is my sample dataset:

Here is what I tried, however the colour here is centered around the mean of the values on the x-axis instead of being centered on 0. I can't figure out how to make it right, I think it's something about trying to use scale_fill with the histogram.

Which gives me this output:

我正在尝试在 ggplot 中创建此图中的左上图，使用 viridis 来制作颜色渐变。

这是我的示例数据：

要创建左侧的图表，我需要根据右侧图表中的相应值对直方图进行着色。如果t=0（对应ap接近1），图形应该是黄色，如果t>4（对应ap接近0），填充应该是深蓝色。这篇文章展示了如何使用 scale_fill_gradientn 创建一个类似的图形，不幸的是它不适用于我使用 cut() 创建的离散值。

这是我来的最接近的，但是我希望图形在 x=0 的边缘有黄色混合成深蓝色。

这使：

我一直在试图弄清楚我是否可以从黑线 geom_contour(breaks = 5E-14) 中分离出 viridis。从本质上讲，黑线是中点，绿色调色板会在那里发散。这可能吗？

谢谢！

这是代码：

您可以看到颜色渐变遵循 的值df_2$speedkt。的最大值df_2$speedkt约为 2.6。

因此，图例中颜色图的最大值约为 2.8。

但我希望将颜色图的最大值更改为 4.0。

我可以做什么？

情况就是这样，我正在生成包含 20 多个条目的复杂堆积条形图。但是，在下游，这通常会减少到只有 5 或 6 个条目。我想使用这个下游集合中的颜色并将它们带回更复杂的样本。

本质上，我希望任何不在最终集中的东西都涂成灰色。我目前不知道该怎么做。

另一个问题是下游数据不一定与上游数据具有相同的形状。就上下文而言，这是一组复杂的 16S 生物测序数据以及纯 DNA 测序和分类。

我目前的想法是以某种方式将颜色直接分配给特定值，但我不完全确定如何执行此操作以及如何确定 viridis 下游显示哪种颜色。

编辑：这些数据集应该有点指示我所追求的：

第一套

下游集

在这种情况下，我希望 A、E、I 和 J 具有一致的颜色，而其他字母为灰色。我还希望将所有彩色条目堆叠在一起，然后将灰色留在顶部。我猜的另一个选择是返回并删除所有非条目，然后添加一个星号，“下游找不到缺失的区域”。

Edit2：原始和下游数据的模型预期输出

我已经动画了一条二维线，我希望它显示在 viridis 颜色图中。该代码不起作用，因为我不确定在代码中的何处分配颜色图，以及如何准确定义它。

我已经尝试定义'viridis'并在不同的地方调用它，包括在定义的函数'LineAnimation'内部和外部，以及'LineAnimation'的'animate'函数内。目前代码如下所示：

我希望在 viridis 颜色栏中看到动画：从紫色开始，以黄色结束。但我没有得到任何输出或错误消息。

我希望能够使用渐变来填充地图上的颜色，但我需要特定的值（如零）才能成为特定的颜色（例如，红色或灰色）。

有没有办法先应用渐变，然后设置这些特定的颜色值？如果可能的话，我希望能够为多个特定值做到这一点。

在下面的示例中，我们如何将 0 值设为红色？

^{由reprex 包（v0.2.1）于 2019 年 2 月 20 日创建}

我在将特定颜色分配给数字向量时遇到了一些麻烦。我的兴趣是使用VAR1.colorin 作为ColSidecolorsin heatmap.2。我的数据框有 1655 行，没有缺失值。我生成了最大值为 VAR1 的 colorRampPalette 向量，但是，当我使用该函数创建一个长度相等的向量以为每个观察分配颜色时，生成的颜色向量的长度与原始向量的长度不同。

谁能帮助检查我的代码中的错误在哪里？有没有人见过这个 ？

我提供了用于在两种情况下复制错误的代码和sessionInfo()详细信息。

任何帮助都感激不尽。

代码

会话输出

我正在制作多个图，其中包含相同的 4 个离散值，未知、负、中性、正。

然而，并非所有数据集都包含所有离散值，因此

在情节 1 中，未知 = 黄色

在情节 2 中，未知 = 紫色等...

我怎样才能设置它，未知的总是=黄色，负=紫色...

下面是我正在使用的代码