我正在尝试在 ggplot 中创建此图中的左上图,使用 viridis 来制作颜色渐变。
这是我的示例数据:
# simulate t-values
data = data.frame(sim =1:10000,
t_0= rt(n = 10000,df =12, ncp=0),
t_1 = rt(n = 10000,df =12, ncp=1.2))
# compute p-values
data = data %>%
mutate(p_0 = 2* pt(t_0, df=12, lower.tail = ifelse(t_0 > 0,FALSE ,TRUE)),
p_1 = 2* pt(t_1, df=12, lower.tail = ifelse(t_1 > 0,FALSE ,TRUE)))
# convert from wide to long
data.long = data %>%
gather(condition,measurement, t_0:p_1) %>%
separate(col=condition, into=c("para","hyp"), sep = "_")
# convert to wide repeated measures format
data.wide = data.long %>% spread(key = para, measurement)
要创建左侧的图表,我需要根据右侧图表中的相应值对直方图进行着色。如果t=0(对应ap接近1),图形应该是黄色,如果t>4(对应ap接近0),填充应该是深蓝色。这篇文章展示了如何使用 scale_fill_gradientn 创建一个类似的图形,不幸的是它不适用于我使用 cut() 创建的离散值。
这是我来的最接近的,但是我希望图形在 x=0 的边缘有黄色混合成深蓝色。
# create bins based on t-values
t0bins <- seq(-12, 12, by = 1)
# compute corresponding p-values
pt0bins <- 2*pt(t0bins, df = 12, lower.tail = FALSE)
ggplot(data.wide, aes(x=t, fill=cut(..x.., breaks=get("t0bins", envir=.GlobalEnv)))) +
geom_histogram(binwidth=0.1)+
scale_fill_viridis(discrete=T)