问题标签 [stripchart]

我正在尝试创建组合箱线图/散点图。到目前为止，我做得很好，但有一个问题让我非常困扰，我一直无法弄清楚。我在 R 中，我已经安装了 ggplot2 包。这是我正在使用的代码：

这给了我一个非常接近我想要的图，但问题是异常值在图表上放置了两次。如果可能的话，我想让条形图排除它们（最高的蓝点组），并且只使用箱线图中的那些（黑色轮廓圆圈），这样它们就可以脱颖而出并且看起来不那么草率。

我试图通过将许多不同的异常值参数放入 stripchart 命令来改变有问题的点，不幸的是没有运气。我尝试将 y-limits 设置为低于它们的值，尝试使用 outline=false（它完全删除了条形图），尝试更改异常值颜色、outpch 等。该命令对任何这些尝试都不起作用。下面是一个 ylim 的例子：

ylim(0, 20) 中的错误：找不到函数“ylim”

这是一个异常颜色的例子：

警告消息：
1：在 plot.xy(xy.coords(x, y), type = type, ...) 中：“outcol”不是图形参数
.......# 警告消息照此继续。

条形图是否能够排除异常值？还是我对它们（以及作为一个整体，就此而言）还不够了解，无法有效地编写代码？

如果可以做到这一点，我应该如何进行？只要图上的视觉效果相同，我完全可以接受不直接解决数据方面异常值问题的解决方案。

感谢您的时间和您可以提供的任何帮助！

编辑：这是一些可以使用的数据。顶行是列标签，下面是数据。抱歉，如果这种格式不好。第 9 行数据中的 29 和 30 等，总体第 10 行，是我的图表中绘制为异常值的一些点的示例，我想保留在箱线图中但不保留在散点图中/条形图。

是否可以绘制一个蜂群图，使逐点颜色在水平中心对齐？（我相信这会大大提高可读性，特别是如果数据不像示例中那样清晰。）

要使用居中颜色实现此图：

我试过了：

它很接近，但各个图上的各个点并不完全相同。

我使用以下代码在 R 中创建了一个条形图：

该图在图的顶部包含大量额外的空间或空白，如下所示。

有没有办法消除顶部的额外空间？

大家好！ 我尝试结合箱线图和条形图来表示一些数据，并尝试按组着色：

XFACT YVAR无反应0.0012无反应0.0002无响应0.0018无反应0.0004无反应0.0013无反应0.0004无反应0.0029非反应0.0029非反应0.0016 0.0016响应0.0177响应0.0177响应0.035响应0.0335响应0.0335响应0.0335响应0.0118 0.0314

我的代码：

所以我希望绿色表示无响应，红色表示响应，而不是我有一些奇怪的输出： 我的输出

那么你能帮我按组（不响应和响应）而不是随机着色吗？

我有一个带有数值变量和因子变量的数据框，如下所示：

我想做的是一个条形图，它绘制并df$numbers插入代表每个级别平均值的垂直线段线。df$levels

显然，我可以分别为每个级别插入均值行，例如：

对于所有其他级别，依此类推，如果您有多个级别，这会很乏味。所以我试过这个for循环：

但这不会打印任何东西（也不会引发错误）。插入均值段的最干净和最简单的代码是什么？

我想创建一个如下所示的条形图：

但我只能使用 stat_summary crossbar 创建类似的东西：

结果是这样的：

对于如何修改代码的任何建议，我将不胜感激，这样我就可以获得第一张图片中的图表。

我制作了一个带有红色标记的阈值的条形图。我想标记落在阈值左侧的点，但似乎根本无法让“文本”功能正常工作。

条形图屏幕截图

这是条形图代码： stripchart(ctrls$`Staining Green`, method="jitter", pch=4, xlab='Staining Green', cex.lab=2) abline(v=5,col=2,lty=3)

我首先尝试仅过滤低于阈值的那些样本： Staining.Green <- filter(QCcontrols, Staining.Green < 5) 然后添加文本 text(Staining.Green$`Staining Green` + 0.1, 1.1, labels = Staining.Green$Sample_Name, cex = 2) This does not add any text to the chart。

然后我尝试标记所有点，以防我把它弄得太复杂，并有以下变化： text(ctrls$`Staining Green` + 0.1, 1.1, labels = ctrls$Sample_Name) 再次，没有添加文本，也没有错误消息。

任何建议都非常感谢！

更新：我的 ctrls 对象比我意识到的要复杂 - 也许这让我绊倒了：

这是我的图形代码，它应该是高、中、低，但目前它是高、中、低。有什么我可以添加到这个的吗？

我正在尝试创建一个分类图，其中每个标记的大小反映了相应样本的一些大小，如下面的示例中使用预加载的提示数据（上图https://i.stack.imgur.com/pRn0x .png ):

但是当我对自己的数据进行相同尝试时，所有标记的大小都相同（下图 https://i.stack.imgur.com/pRn0x.png）：

我怀疑数据类型不一样，但似乎并非如此，
尽管当我打印 df['precision'] 时它返回名称和 dtype
，而当我打印 Tips[“size”] 时它也返回它的长度。有人可以给我一个提示吗？我找到了如何在散点图中更改它，但在分类图中没有。

我的数据数据：

term_name,log10p_value,精密
肌肉结构发育,33.34122617,15
解剖结构形态发生,32.91330177,5
肌肉系统过程,31.61813233,11
多细胞生物过程调节,30.84862451,25
系统发育,29.16494157,36
肌肉细胞分化,28.79114555,11

我的数据如下：

使用以下脚本：

我能够生成这个条形图：

我希望标记一些国家（比如几个定义的国家，例如印度、中国、美国、日本），它们将位于条形图上，类似于：

我不知道如何将一个国家附加到每个组件图上的每个点，然后只显示几个选定国家的标签。