问题标签 [snomed-ct]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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sql - 运行多个子查询

我正在提取表 AbsDrgDiagnosis.Diagnosis 中的一个代码 (ICD9)。当 DMisNomenclatureMapCodes.CodeSetID = 'SNOMED_CT' 时,我需要提取另一个表 DMisNomenclatureMapCodes.CodeID 中的另一个代码(SNOMED_CT)

那么链接这两个表的唯一方法是当 DMisNomenclatureMapCodes.CodeSetID = 'ICD9' 时通过 AbsDrgDiagnosis.Diagnosis = DMisNomenclatureMapCodes.CodeID

例如,当 CodeSetID = 'SNOMED_CT' 时,我必须从 DMisNomenclatureMapCodes.CodeID 报告 3942005。

到目前为止,我只能比较 DMisNomenclatureMapCodes.CodeID 上的 AbsDrgDiagnosis.Diagnosis,它们都等于 290.23,但之后我不知道如何获得 SNOMED 代码。我假设我必须对 DMisNomenclatureMapCodes.MisNomenclatureMapID 执行另一个子查询以获取分组,然后找到 SNOMED_CT 的 CodeSetID 以获取 CodeID 3942005 的最终值。我该如何尝试呢?任何帮助将不胜感激,我尝试了几个子查询,但他们出错了。我是 SQL 新手,所以如果我说的不正确或以专家的方式写出来,请善待。

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health-monitoring - 使用 SNOMED-CT 进行标准化

我想了解使用 SNOMED-CT 对临床术语进行标准化的目的。

假设我有一个标准/声明,例如

我的问题是 SNOMED-CT 是否用于规范性别和男性,或者只是其中之一

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mysql - 缓慢的*初始* mysql 查询

运行 Mysql V5.6.22,在正确索引的数据库上运行复杂查询,最初的响应时间非常慢(10 秒)。随后的查询(针对不同的项目)响应速度非常快(50 毫秒)。所以我猜查询缓存正在做他们的工作——但是我如何最小化最初的慢响应?

该数据库是一个外部维护的医学数据库(SNOMED),我对当前快照使用推荐的视图——我认为这些视图是速度的限制。

奇怪的是重新启动 mysql 并没有什么不同——这似乎是一个时间问题——如果数据库在一段时间内没有使用,那么启动需要很长时间。

所以我的问题是,是否有一个 mysql 设置用于这些缓存的保留时间,或者我应该使用不同的方法而不使用视图(SNOMED 的数据每年更新 2 次,在另一个类似的药物数据库中有每月发布。?

你们中的一些人希望看到查询,所以就到这里。警告它确实有点棘手,基本查询的行数在评论中给出...... ;-)

在哪里:

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mysql - MYSQL 代码创建传递闭包表失败

我正在使用当前的 SNOMED 数据和示例,并且我想创建一个传递闭包表,但是我的 mysql5.6 默认服务器设置中的某些内容失败了。

对于那些不知道的人,SNOMED 是一个医学数据库。有 210 万个关系和 446697 个概念。查询在第二部分停止 - 所以我猜它的 RAM 用完了。但是我要调整哪些设置以及调整什么?加入缓冲区大小?

这是代码:

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standards - IEEE代码数据库

作为 SNOMED 和 LOINC,我读到还有另一个用于识别医学术语的通用标准,称为 IEEE(其数据库还包括我正在从事的项目特别需要的健身/饮食/环境数据)。我的问题是我一直在网上搜索代码,但我找不到任何代码。有人知道您是否需要付费才能访问代码数据库?

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graphdb - GraphDB:将 SnoMed CT 导入 GraphDB

我想将 SNoMed CT 数据加载到 GraphDB。任何人都可以指导将数据导入 GraphDB 吗?到目前为止,我已经安装了 GraphDB 工作台。

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neo4j - 将 SNOMED CT 导入 Neo4J

我需要将 SNOMED CT 本体导入到图形数据库中,在本例中是 Neo4J,但它最终可能是另一种选择。

但是,为了实现这一点,我找不到对 SNOMED CT 底层关系数据模型的清晰描述。或者至少,简化的 SQL 视图以可以映射到图形数据库的方式公开实体关系。

我将不胜感激任何有关此问题的指导或以前的经验。

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text - 有免费的医疗或临床报告/语料库吗?

我正在研究临床自然语言处理。是否有任何包含句子、患者状况、患者病史、临床术语等的临床报告?

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medical - RXNORM 到 SNOMED 的映射

我们的医疗系统中列出了药物。它们被映射到RxNorm id。

我们想迁移到Snomed。有没有办法将 RxNorm id 与 Snomed 概念 id 匹配?也许有一个带有链接的数据库?还是服务?

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python-3.x - python 3中的PyMedTermino安装

我在为 python 3 安装 snomed 时遇到问题。我有一个虚拟环境。安装 snomed 的教程在此链接中:

第 3 步的问题是这些链接中的哪一个是 CIM10 和 ICD10 ?所以我可以在步骤 4 中正确设置变量。 在此处输入图像描述

以及如何在 python 3 的虚拟环境中安装这个库?

Heloo 我正在尝试安装PyMedTermino 0.3.2在 python virtal env 中。我已按照站点中文档的说明进行操作,http://pythonhosted.org/PyMedTermino/tuto_en.html#installation 但它不起作用。所以下面是带有数据变量的代码,错误是设置路径之后的注释