问题标签 [snomed-ct]

问题陈述：

从 Snomed CT 数据库中提取所有父母、祖父母、孩子和孙子

描述：

我正在尝试在我的本地盒子上设置 snomed 数据库，以提取特定概念的关系（所有父母和孩子）（使用 concept_id）。

我已经从https://download.nlm.nih.gov/umls/kss/IHTSDO20190131/SnomedCT_InternationalRF2_PRODUCTION_20190131T120000Z.zip下载了 snomed 数据

然后我使用我在这里找到的脚本将数据导入Postgres SQL DB https://github.com/IHTSDO/snomed-database-loader/tree/master/PostgreSQL

但是我没有找到这些表之间的任何关系，因此我可以获取特定概念 id 的父母、祖父母、孩子和孙子（我尝试使用肺癌 93880001）

下图包含表结构：

我非常感谢任何帮助或建议。

如何将程序：“患者建议多喝水”编码为 SNOMED 表达式（或 FHIR 程序？）

是否有编码记录的公共指南？SNOMED 的文档在示例上似乎有点稀疏。

SNOMED 代码集似乎正在迅速发展。正在添加新代码，正在停用旧代码。这些版本是否提供从旧代码到新代码的升级映射？（特别是，我对英国的扩展感兴趣）。

SNOMED CT 中的每个概念都有 conceptId (SNOMED_CID)。请让我知道 SNOMED CT 如何定义 SNOMED_CID。SNOMED CT 是否遵循任何编号方案？SNOMED 术语也可用于 UMLS。UMLS 遵循什么编号方案来定义 UMLS CUI？

我正在使用 owlread 构建代码，代码必须抛出文本并将医学发现转换为 SNOMED ct

但是我收到关于 SNOMEDCT_US = PYM["SNOMEDCT_US"] 的错误，错误说 TypeError: 'NoneType' object is not subscriptable

我认为缺少可以识别 PYM["SNOMEDCT_US"] 的文件，但我仍然找不到它？

谢谢

我想创建一个仅包含 SNOMED 的“无序子层次结构”的子图。我正在尝试使用 SPARQL CONSTRUCT 查询从完整的 SNOMED-OWL 图创建此子图。但是，由 owl:equivalentCLass/ owl:intersectionOf / owl:Restriction 组成的属性在创建的子图中显示一个空的 []。相同的查询在本体编辑器窗口中显示正确的结果。我是 SPARQL 和 OWL 的新手。有人可以帮助我遍历属性关系中的复杂猫头鹰公理，以便正确创建子图。我使用了免费版 TopBraid 本体编辑器版本 6.0.1 (tbcfe-6.0.1) 中提供的 SPARQL 查询选项卡。这是我尝试过的查询。我之前在我的问题中提供了屏幕截图，但我猜它们并不清晰可见。

此查询在 TopBraid 编辑器检索结果中显示正确的输出，但是当我将它们导出到 .ttl 文件时，只要有复杂的猫头鹰公理，如 owl:intersectionOf、owl:EquivalentClass、owl:restriction 等，我就会得到一个空白 []。

我已经提到了这个解决方案，但它似乎对我不起作用并给出了一个空的结果集-（SPARQL：如何将 owl:equivalentClass 转移到 rdfs:subClassOf (owl:Restriction) 属性？） 截 ​​图本体编辑器正确显示 ?o 生成的子图文件有一个空白 [] 表示 ?o

根据最近的更新，AWS 医学理解服务现在应该返回 snomed 类别以及其他医学术语。

我在 Python 3.9 Lambda 中运行它：

我得到以下回复：

所以要么我遗漏了一些东西（可能是一些明显的东西），要么该方法实际上还不可用？任何能让我走上正确道路的事情都会受到欢迎。