问题标签 [rstanarm]

我正在通过 rstanarm 开发一个贝叶斯回归模型，该模型将多项式、二项式和比例预测器组合在比例因变量上。作为常规模型，我的模型如下所示：

我试图通过 rstanarm 通过贝叶斯方法创建相同的模型，但是我对如何将不同的先验应用于每个预测变量感到困惑。

我将如何实施此信息？

任何帮助表示赞赏，谢谢！

我无法rstanarm在R 3.5.3运行时安装Ubuntu 18.04 LTS。我使用了以下命令：

和

并且都抛出以下错误：

会话信息

我不确定我的结果是否可信。

假设我用信息丰富的先验拟合了这个模型：

然后，我想用标准化数据更新模型，看看标准化如何改变系数。

但是，我担心模型 2 的结果不能被“信任”，因为它们考虑到模型 1 的非标准化先验设置，它们可能是错误的（即不必要的）偏见。

有没有办法“标准化”先验，以便我可以将它们传递给update函数，以便 model1 的先验集比照后等同于 model2 中的先验集？

注意：由于我分析的性质，我无法避免使用update.

非常感谢！

随着数据的收集（对于每个新数据点），我想可视化从先验到后验的转变。

我可以同时想象之前和之后：

^{由reprex 包（v0.3.0）于 2019 年 5 月 25 日创建}

但是，我希望拥有所有“中间”步骤（每个新数据点从之前到后的渐进式转变）。有没有办法从模型中检索它？谢谢！

我正在使用 rstanarm 包中的贝叶斯逻辑回归（概率）来训练默认事件的模型。作为输入，模型接受一些财务比率和一些定性数据。有没有一种方法可以让我真正正则化系数，仅针对定性数据，始终为正？

例如，当我对所有内容使用单个先验时，我会得到这些结果（我使用 MCMC 校准模型，使用set.seed(12345)）：

系数如下：

问题是，我可以使用两种不同的分布吗？就像fin_ratio_x变量使用正态变量和Qual_x变量使用指数或狄利克雷一样？

我正在计算贝叶斯方差分析来调查我的航向变量如何影响 FirstSteeringTime。这是我的数据集的示例：

首先我拟合我的贝叶斯方差分析模型：

我的模型显示我有 4 个预测变量。这是正确的，因为我对标题变量的级别 - 0.5、1、1.5 和 2：

但是，当我计算我的实际等效区域 (ROPE) 区间并将其与我的 HDI 进行比较时，我似乎只显示了三个预测变量？

现在我的第一个想法是，一个级别的航向变量可能会产生非常小的影响，因此它不足以创建 HDI？但我不确定。有人有什么想法吗？也有人可以向我解释一下 log-fit ratio/R2 是什么以及他们告诉我什么信息？

非常感谢任何帮助！

此处提出了类似的问题，但我尝试了 Tiago Lubiana 在那里发布的代码，但无济于事。

rstanarm经过几次尝试，我无法安装。R 在安装过程中不断崩溃。

我确实通过运行安装了 rstan

但是，当我想安装rstanarm时，似乎没有任何效果。我尝试了以下方法：

1) install.packages("rstanarm"): R 崩溃并安装一个名为 的文件夹00LOCK-rstanarm，以及相应的rstanarm文件夹。当我打开 R 时，rstanarm是否存在，但在运行后library(rstanarm)，我得到

错误：library.dynam（lib，package，package.lib）中“rstanarm”的包或命名空间加载失败：找不到共享对象“rstanarm.so”

通过install.packages("rstanarm") 再次运行，我得到：

错误：无法锁定目录'/home/nalerive/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5'进行修改尝试删除'/home/nalerive/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5/ 00LOCK-rstanarm' install.packages 中的警告：安装包 'rstanarm' 的退出状态非零

删除该文件夹并没有解决问题（但请参阅此处了解另一个包的类似错误）。

2）从这里，运行

导致 R 再次崩溃，并安装了与 1) 中相同的文件夹。我也通过运行得到同样的错误library("rstanarm")，即：

错误：library.dynam（lib，package，package.lib）中“rstanarm”的包或命名空间加载失败：找不到共享对象“rstanarm.so”

3）在这篇文章之后我试过了

R不断崩溃。

我尝试了更多的东西，比如00LOCK-rstanarm通过unlink("/home/nalerive/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5/00LOCK-rstanarm/", recursive = TRUE);删除文件夹。指示时重新启动 R；检查我的 C++ 工具链（如这里所建议的）等......但没有任何效果。在这一点上，我真的感到绝望。

我有 R 版本 3.5.2、rstan版本 2.19.2 和 Linux 4.15.0-1-amd64 #1 SMP Debian 4.15.4-1~mx17+1 (2018-02-23)

任何帮助将不胜感激。提前致谢！

我正在使用 rstanarm 在函数中拟合 stan_glm 模型。遇到一个问题，即保存的 stanfit 对象的大小在保存到 .rds 时会爆炸，但仅当模型适合函数时。问题似乎是 stanfit 对象正在存储本地环境的副本，然后使用 write_rds 将其保存到磁盘？手动删除函数内的大对象或多或少地解决了这个问题，但这是一个相当笨拙的解决方案，所以想知道是否有人建议以更优雅的方式解决这个问题？下面的玩具代表（警告这会将一些 .rds 文件写入磁盘，我在示例结束时将它们删除但请注意）

^{由reprex 包于 2020-03-11 创建(v0.3.0)}

我目前也在运行旧版本的 Rstudio（版本 1.1.463），因为我的 mac 正在运行 El Capitan（没有足够的内存来更新）。尝试安装和运行“tidymodels”时，我收到：

然后我尝试安装“rstanarm”并收到：

遵循这些选项中的任何一个都是不成功的。考虑到我的情况，是否可以使用“tidymodels”？