问题标签 [pairwise.wilcox.test]
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r - 对两个数据帧的行运行配对 wilcoxon 测试
我有两个大数据框（大约 19000 行和 71 列）如下 df1
| 样品1 | 样品2 | 样品3 | |
|---|---|---|---|
| 基因1 | 5 | 10 | 15 |
| 基因2 | 2 | 8 | 10 |
| 基因3 | 3 | 9 | 10 |
df2
| 样品1 | 样品2 | 样品3 | |
|---|---|---|---|
| 基因1 | 40 | 50 | 65 |
| 基因2 | 12 | 18 | 0 |
| 基因3 | 31 | 19 | 10 |
我正在尝试对具有相同索引的行执行 wilcoxon 秩和测试，但代码在 google colab 上一直占用！！到目前为止我的代码
有没有更快的方法来获得所需的输出？
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r - 在 R 中从数据框读取数据时如何执行 Wilcox 测试功能？
我正在尝试使此功能正常工作，但失败了。我需要的是一个从数据框列中读取名称并使用它们对这些列中的每一列执行 Wilcoxon 测试的函数。“结果”将是主要的最终产品，即每行包含属名及其 p 值的表格。我还添加了一个绘图功能，用于可视化每列的组之间的值，我会保存在相应的属之后命名它们。
一个可重现的数据集可能是
我对函数不是很熟悉，也没有找到关于如何从数据框中制作它们的好教程......所以这是我最好的尝试，我希望你们中的一些人可以让它工作。感谢您的帮助！